Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_016510_1                                                                                                                 top


Strain : Flavobacterium columnare ATCC 49512 RefSeq :NC_016510 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_016510_1
DR consensus (36 bp) : GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTNumber of repetitions :44
Begin Position : 391567 End Position : 394479

391567TATAATTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTACTACTATGTTGGAAGAATTTCACGATAATGTG 391632
391633GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTATTATTTTATTTTTTTCAAAGGTCAAGGATGGA 391698
391699GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTATAATATTTTCTTTACTGATGAGACACCCTTA 391763
391764GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTCTTCTGTTAATAATAGTAATCCCGTTTATATGGTTGTGGTTTACAAACACCAAGTCAATATTTGTTATAGGTGTGTTTGT 391877
391878TATAATTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTGTTGTTGATGTTAGTGAAGCTTTGAATAATTA 391943
391944GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGCCGCCAGTTGGCACGTTCTTGATCAGTAAGC 392008
392009GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTATCATCTAATTCCAAAACATTTATTACATCTTG 392074
392075GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGAAGAAAGACGTGAAGTTGAAAAAAATCGGTAC 392140
392141GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGAAGAATACCAGTCGTTCTTCCCTCACCTTGAA 392206
392207GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTAATAATACTGATTTATTTCGAGTATCGCCCGT 392272
392273GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTGATGATTTAGGTATTGATTTATCAAAAGACAC 392338
392339GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCGGCGGTAACGTTTGCCCGCTAGTTTATAATAA 392404
392405GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTTATTATGATGCGTTACAAAAAATGTTTTTAAA 392470
392471GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCATCATGCAGATGTTTTTCTACAAATTCACGA 392535
392536GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTTATTAATTGCAGAGATAGATTTTAGATTTTGA 392601
392602GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAAGAAGGTATTTATTTTTTTGAAAAAAACTTAT 392667
392668GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGAAGAAGAAAGATTCAGTATCTAAAAAAGATAT 392733
392734GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGATGATCAGGATTAACTTATAAATCGGACGAT 392798
392799GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTATTATTAAAAAATGTTTAGTAATACAACTATC 392864
392865GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAACAACAAAAAAAAAGGAGGTACAGGATTTGTA 392930
392931GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTTATTAACCTAAAAAATGACTCAAATAAACATT 392996
392997GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAATAATTCCTCAAGGTCAATTTTACATTCGATT 393062
393063GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAATAATCAAAGGTAAAAATAAAATGACTTTACA 393128
393129GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCTGCTGTTAATGCAATTGCAAACGATATAAAA 393193
393194GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTTTTTTTTATTTTATTTATATAAATGTTTTCCA 393259
393260GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAATAATGTTTTAGCTTCTAACGCTGCATTATCT 393325
393326GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCATCATTACAGGTTTATAATCAACTGGATTAGA 393391
393392GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTATTATTAGAAGAAACACGAGCTTGATCCATA 393456
393457GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTACAACAGGAGTTTCTGAGCAAACCATAGGTAAA 393522
393523GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTACAACATTGCGTTTCTAACTGAATTAACAGCGC 393588
393589GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCTTCTTTTTTATCTTGATAAGATAATTCAATGT 393654
393655GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGTAGTAGAAATGAAATAAAAACAATTAAATTGA 393720
393721GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAAAAAAGCTTTTGCTTTTGCATTAAATTGATTA 393786
393787GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTAATAAAAGACTATGTGAAGTGGTTAATGAAGA 393852
393853GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCCTCCTTAAAAACAAAGTGAACTAATGGAAACC 393918
393919GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAGAAGAAGAAGAATTACGTTATCCTGATTTGAA 393984
393985GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCAGCAGTGAACGCCATTACGGCACAATTGACC 394049
394050GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTATAATAATTGTTAAACCATTAGGACCAGTAACA 394115
394116GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGCAGCAACTCCAGAAGTCATCCTAGAAACAAC 394180
394181GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTATTATTCACTTCTACATTTCCGCCAAACAAAG 394246
394247GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTAATAAGAAGCTAAACCAATAATATGAGCTGTA 394312
394313GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGATGATGTAGAAATACTTAGCGATAATGTACT 394377
394378GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGCCGCCAATTCCGCAAAGAATGAAAACGGCAAG 394443
394444GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAGC394479
Left flanking sequence : Till position 391567 (length bp)
GAAGTCAAAACACGATATTATTTGGTTAAAAATTACGATTGTAATTTCAGTTGTGGTTTACAAACACCAA
GTCAATATTTGTTATAGGTGTGTTTGTGAT
Right flanking sequence : From position 394479 (length bp)
TAACAGCTTAGTTATTAAATATCAAAGCATTAAGCCGAAATATCGTTAAAAAAAATGCTTCTTTTTTGGC
ACGTTATACCAAGATTGAAGCATTTTTTTA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp