Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_016894_2                                                                                                                 top


Strain : Acetobacterium woodii DSM 1030 RefSeq :NC_016894 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_016894_2
DR consensus (30 bp) : ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATNumber of repetitions :48
Begin Position : 3377721 End Position : 3380835

3377721AAACCGATTCCAATATGGATCTACTCAAATAATAAATTGAGATGGCAAAATGTTATATTCATTC 3377784
3377785AATTTACATCCAATATGGATCTACTCAAATTTTGGCGACCGTAGAAATTGTCGTTTGGGTTCTGAT 3377850
3377851ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATGATGGCGCTTGCAAGGGTAATCCCGGCGTTGGTGGT 3377916
3377917ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATCAAGGTTGAATTCCGAGAATTGGTAGCGGCGGATTA 3377982
3377983ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTGGGTGGCGTAACCCAAAGCTTAACAGACCGGATCAG 3378049
3378050ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATGAAAATGAAGTCAATGCCCTAGCCCCGGCATTGC 3378113
3378114ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATATCAGTGTCGGTGCGTCTTCGGACAACGCAACTTTT 3378179
3378180ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTAATCGATTAAGTTCTTCAACAACATCATCCACGAA 3378245
3378246ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATCTTCTAATTGCGATACTAGGTCATAGGCCTTTTGC 3378310
3378311ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATCGGTATATGTAAAGCCGTTCGGGTGTTGGTAGCACG 3378376
3378377ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTTGCGCTTTTTGTCAACGAGATTGATGGAGAAATGA 3378442
3378443ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTTTATTATAAGAATGAACGGGAAGTTATGGAATCGT 3378508
3378509ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATACGATCAGCCCCAACACTATTAGCCTGTTCAACTG 3378573
3378574ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATAAAGTCTCCCCGAAGCTGATAGCCTGATAGTTATT 3378638
3378639ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATGACTATAAAAATGTTGTTACTAACGTAAAGCCAAA 3378703
3378704ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATGCGCTTAAAAGCCCTCTTCAATTCAAATTTCCAAA 3378768
3378769ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTACGATTGATATACCGTTTATACTCTTTACTTTGAA 3378834
3378835ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTTGTAGTTCGTCCATTGCCATTTTAACCGCATCGGT 3378900
3378901ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTCTTAATAACATTCATCTCATCACCTCATAGAATAA 3378966
3378967ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTTGTTTATTAATGATCAAGTGTTTAGCATTAAGATG 3379032
3379033ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATAAAATGGAGAATTAAATACAACTAGTTCACCATC 3379096
3379097ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATGATTATAAAGTAATGATAAATCAATCACTAAATTAAC 3379163
3379164ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATCCCCCATTGCCTAATTCTCTTGCGCAAATAGCCCAA 3379229
3379230ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATAAAATGGTTGAAGTCGTATTAGAAGACGTTGGCAAC 3379295
3379296ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTAAACTAAATACCGGCAGAACAGGACGCTTCCAAA 3379360
3379361ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATATACGTAATCTCTATCAGTAATAGTGCCATACGTT 3379425
3379426ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATACAAAATAACAGATAAGCCGCTGTTCTGCTATTGTA 3379491
3379492ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATGCTAGCAGAGATCAAAACCGTCGATGGACCTAGCAG 3379557
3379558ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATCGTATTGCCCTGAGCTGTCCAGGTACGTAAACTT 3379621
3379622ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTCTTTTGCAAATCGATTGTCGTAACCGCTTTTAAA 3379686
3379687ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATCAACCGGACTGGCCGCGAAATATTATTGTAGTTG 3379750
3379751ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATGCATTACCAATTATTTGGAAAGCACCTGTGAAAAG 3379815
3379816ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATAAGAATTGTTTCTTTTGCTTTTCTCATGTCTTCAA 3379880
3379881ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATAAAATGGTTGAAGTCGTATTAGAAGACGTTGGCAAC 3379946
3379947ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTCGCCATCGTCATTCCCAGTAACGACAATATCCGA 3380011
3380012ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATATTTATCCCGATATTGAAGCGGTTTTCATTGATAC 3380076
3380077ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTAATGCATCGATAATCTCAATGCCGGCATTAATTTTTC 3380144
3380145ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATAGAAATAAATTAGTTGATGAACTCAACACGAAATA 3380209
3380210ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATAACAATCCGGGTAAACCGATCCGGCGTCATAACAGT 3380275
3380276ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATGACGATTTAATTAAAGCTATTAATGATTTTGATTC 3380340
3380341ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTAATACTGTTTATTTTTCTTTTCAGATCATTATAAG 3380406
3380407ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATCGCCGGGGCCTCTCCCAAGAGTAGGTCAGCAATCTTA 3380473
3380474ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATCTTTTTACATCTTTTAAGTTCATTTTTATTCCTCCC 3380539
3380540ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATCCCGCATTGACGCTATTATTTGTTATTTCTCTACTC 3380605
3380606ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATGTTGACAAAATACGCATTGCGTACTAGAATAAACGCA 3380672
3380673ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATTGATAAGAGTATTAACTTAACGACATCTTTAACAAAA 3380739
3380740ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAATCTTAACATTTTGATTCTTGATATTGTTCTTGCATTG 3380805
3380806ATTTACATTCCAATATGGATCTACTCAAAT3380835
Left flanking sequence : Till position 3377721 (length bp)
TGGTTCTTTTGAAATTCTCATATAAACCTCCCCTTATTAAAATGAGTATACTTCTCGAATGAATATATGT
CAATGACTATTTGTCATTAATGTAGTAAAG
Right flanking sequence : From position 3380835 (length bp)
CCGTGCTTGTTAGATACCTATATTCAGGGCATTTCAACGGTCTTATTTGTCGACCCTTTATAATTAACAG
CAAACACTGGAAATAATTATGTCGTTTCTT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp