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CRISPRs details
NC_017177_12
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_017177_12                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile BI1
RefSeq :
NC_017177 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017177_12
DR consensus (31 bp) :
ATTAAACCTTAACACTATGTGTATTTAAATT
Number of repetitions :
8
Begin Position :
133975
End Position :
134465
133975
ATTAAACCTTAACACTATGTGTATTTAAATT
TGGGAGATTCTCCAGAGTTTTCCGCATCAGTGAA
134039
134040
ATTAAACCTTAACACTATGTGTATTTAAATT
AAGTGTCTATTAACATTTGCAACAGTGTCTTCTAC
134105
134106
ATTAAACCTTAACACTATGTGTATTTAAATT
GTTATATTTTTGTTGCTTCCCTTCTTAACATGGTC
134171
134172
ATTAAACCTTAACACTATGTGTATTTAAATT
CCATATCTATCTTTCAAAAACTCATATGCATATTTA
134238
134239
ATTAAACCTTAACACTATGTGTATTTAAATT
TAATTAAAATATTTACAAATAGAATTATAAGAAAG
134304
134305
ATTAAACCTTAACACTATGTGTATTTAAATT
TGATAAAACACTACATACAAACTCAACCTCGCTC
134369
134370
ATTAAACCTTAACACTATGTGTATTTAAATT
TGTTATATAAATACATATTACACAAGATATGTAT
134434
134435
ATTAAACCTTAACACTTTGTGTATTTAAACA
134465
Left flanking sequence : Till position 133975 (length
bp)
ATTCTTATTTTTAACTGTTAGTTGGGATAAAAAGCTTAAATTAATTGATACTACTGTATTACAAGTATTT
ATTGATTTTAAAAATGGCTTGTTTACATCT
Right flanking sequence : From position 134465 (length
bp)
CCACTCTTTGGACCATCTTTAAGTGTAAAAAAAGAGCTGTCTATCAGTTTAGACAGCTCTTTTTATTTAA
TAAAAATCCTTCAAAAATTCAAGATATATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp