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CRISPRs details
NC_017464_2
Flanking alignement tool
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NC_017464_2                                                                                                                 
top
Strain :
Ignavibacterium album JCM 16511
RefSeq :
NC_017464 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017464_2
DR consensus (30 bp) :
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
Number of repetitions :
88
Begin Position :
1381767
End Position :
1387646
1381767
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AATGTTGAAATCACCTTTAGTAAGAGAAACCTTCTCT
1381833
1381834
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AGAAAATCGAGCTTCGTTATTAGCATCAATTATTAGGTA
1381902
1381903
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTTGGAGGGATATAAAATACAGGTACTTTCCTAATGGA
1381970
1381971
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CAGTATAGATTTAAAGAAATAATTATCGTTCTTGAAGAA
1382039
1382040
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TGCTGAAGCTAAAGCAAAAGCAGAAATAAGTAATAAA
1382106
1382107
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CAAGGGAAAGGGATAAGGTTTTTTCAACAAGTTCCA
1382172
1382173
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TGAAGATTTATTTTGATTTTATGTCGCTCTGATTTT
1382238
1382239
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
GCAAAATTGACAGTCCTACTATGCCAATAAATGCCATAG
1382307
1382308
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CTGATAATTTGTAATAAATATTTTTGTTTTTTTCATTA
1382375
1382376
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
ATCGACCTAATCGTTTTCTTTGATATTAAGCTTGACT
1382442
1382443
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AGCACTTTGCTTTTTCTCATATCGATTAATTTAGTCA
1382509
1382510
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
ACAGTAGTTTTCTCAACTGTTCCATCCTCTTTCATGT
1382576
1382577
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AAAAAATCAGATTTTTTGAGAAAAAGCACTTTGCTTT
1382643
1382644
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTCCTGAAAATTATTTCCAAAATTTCTGATTAGGTCG
1382710
1382711
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CCTGGCAAATGCATCATAATTGCACCGACGCCCTCAG
1382777
1382778
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CCTGGTCAGTTGTAGTCTGATGCGGAATTTTTCCA
1382842
1382843
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CTTGGAGAAGCATTTTGAGTTGCTTCGTTTAGCATT
1382908
1382909
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AAGCTTCGGATCGAACACTGCAATTGCGCCAACAGTA
1382975
1382976
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TGCTTCAGGATTAGCCGATGTCATATCACCGGAGAAC
1383042
1383043
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTTGGATAAAATCAATATCCAAATTTTTTTGACTAT
1383108
1383109
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CCATATCAAAAGGATATTTATATTAAAAATGCTTA
1383173
1383174
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
GAGAAACTCTTCAAGGGATAAATCGGTTTTTTCAACAAG
1383242
1383243
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CAGGTCTCCGACTCTTTCACAAATTGCCCCAAGTTGGGG
1383311
1383312
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
ATCAAAATAATTCGTCTAGTTTGTGTTCTGTTTG
1383375
1383376
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTTCTTTCGGTAGTAGGAACATAAAAGTTCCATTTAT
1383442
1383443
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TACTACTTTATAAATTTATAATTTATTATTGTCTAAA
1383509
1383510
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AAATATCCTAATTATCAAACAATAATTATTCGGATAA
1383576
1383577
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
ACTCTCTCAACTTGCTCACGAAGGATGTTAATTTCCTT
1383644
1383645
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TACTACTTTATAAATTTATAATTTATTATTGTCTAAA
1383711
1383712
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AAATATCCTAATTATCAAACAATAATTATTCGGATAA
1383778
1383779
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CCTTTCAAGGACTGGTCTTTCTCCACCGCCCGCCTTCC
1383846
1383847
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
GCAAATCCAATTAATACAGCTTTCAATTGGATCAACC
1383913
1383914
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TATTTTTTCGATCTGTTCACGAAGGAGGTTTATCTCCG
1383981
1383982
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CTTGCAACCAATCCGATTATATCAGATGGAGCTTCTGAG
1384050
1384051
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TCAGCTTGATGCACAGGAAGTTTATGTTCAGCCA
1384114
1384115
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
GGACTTGGAACTTTTATATCCCTTGCGAGAGTGTTTT
1384181
1384182
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CCAAAAACCTCAGCTTGAGATTATTATAATAATAAAATA
1384250
1384251
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
GTATTGATTCGGAGGTCTAATTCCTCCCAATCTTCT
1384316
1384317
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CCAAATATATCTTTATGTTATTAGGATATTTATTG
1384381
1384382
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AAACTTTTATTTTTGGAATAAAACCATCAAGATTTTTA
1384449
1384450
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CCGATGATTAAAGCCAAGCCATTTGGCTGCTTTTTTA
1384516
1384517
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CATATCTTCTCCTTATTAAATTATTAATTAGTTAA
1384581
1384582
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
GCAGCTTCAGGCTCATACTTAATCGCAATTGAATTG
1384647
1384648
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AGAAACGAATCAGCTTTTCCGGGATTTGCGGTAATGT
1384714
1384715
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AAAGCTTTACCAGTTCCTCGGCATGGCCGATATTTATCG
1384783
1384784
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TAAATTGCCCATCTTTAAGGTAAGACTCATACAACA
1384849
1384850
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTACTTGGCCAGCGTAGAATTCGTCAAGGCGTTTTT
1384915
1384916
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTTGTTTATCACCCCAATTAGTTGAGGGGTGATTTGATA
1384984
1384985
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
GCATTCTTTAACTTCCACTCGTTACGAATGATTTTG
1385050
1385051
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CCTCCTTTCAAGGACTGGTTTTTCTCCACCGCCCGC
1385116
1385117
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
GGCGATATTATCAAGGTAACATATATCGGTTCAAACA
1385183
1385184
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CGGGATCTGCCGGTATTTGCCCAAGTTTTGAAGTTTCC
1385251
1385252
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CATTTGAGCTATCTTAATAATGGTCGGGCGATTAGATAC
1385320
1385321
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TGTTTTTTCTCCAAGTATCTTTTCTCAAAGGCCTTAG
1385387
1385388
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTTTTAGTTGTTTTCATGTTTTTCTCCTTTTTATGT
1385453
1385454
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTTCGTAATTCTAAGACCCAACAAGGGATTCACCCTTG
1385521
1385522
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTGTTCATATAGGTTTTCCTTTGTCTTTTGCGCTTAAA
1385589
1385590
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TGTCATTTTCTTTGATGACGTATTGTATTGGTTCATCAA
1385658
1385659
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AACTGTGGCATAATGAATGCCTGTTTTATATGATTCT
1385725
1385726
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AACCGGCCCAACCACTGGTACCTAATGTCCTTATGGA
1385792
1385793
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AAGACTTGCTCAGGTCTTATATTTATTCCTCTAGTTC
1385859
1385860
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CTGACCAGCCCTTTTGAAATAAATTCATTGATGAATAG
1385927
1385928
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TATCTCATGTTCTTGCAGGTCTCTCACTTCGTTGTCCTG
1385996
1385997
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CGCTTTTCTCTCCATTTCCTCAGTAAAAGCAAGCATC
1386063
1386064
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTGCCAAATACACCGTCATCTTTCAGTAATCTGACTTTAAG
1386134
1386135
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TGTCATTACAAATGCTTTAATAATATAGATACCAAGTGTA
1386204
1386205
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AAATGTTTAATAATGATACACTATCCATAGGTTCATTA
1386272
1386273
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
GATTAAGTGGACCGCACGGATTAGGTGCGTGTTAATCC
1386340
1386341
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TACCTTTACTGCTGTTCTTTCCGGAGAATCAATAATA
1386407
1386408
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CAAAGCTTGTTCTTGTTCTGAATATCTCCCTGATTA
1386473
1386474
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
GAAAGCTTGCCACAATATAGATGTTATATGTATCAAGCGG
1386543
1386544
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TGGTGAAACACATTATTATAATCACCCTCACGGACGTA
1386611
1386612
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTTGCTGAGGCTATCCTTCAGAATAGCCTCAAACAAA
1386678
1386679
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CCGTTGGAGCTGGCAGCATTTCTATGAAGGTGCAAAG
1386745
1386746
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTTGCTGAGGCTATCCTTCAGAATAGCCTCAAACAAA
1386812
1386813
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TGCGCAATAAAACATATCTAACATCCTTTTATCTTCA
1386879
1386880
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
AATTACTATTTTGTATTTGTTCGGCTTCCCGTATAGCC
1386947
1386948
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
ATATTTCGGGAATTGCTTGTTGTAATTGAAATAATTTT
1387015
1387016
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
GCAATATGGCCCGCTTCCATTGATTTATGGAGACAT
1387081
1387082
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TCATTGCACCTCTATTTTATTTTTATGTTAGACCC
1387146
1387147
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CGTTTGAACATTGGCACCAGGTCTTACAGATACTGGA
1387213
1387214
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CCGGTAATGGTATTCTTATTTTCTGCCGGGATCTGC
1387279
1387280
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TAAAATTCCATTTGCACTTGAGTCCCACTCTATTAA
1387345
1387346
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TATAAATCAAAATTCAGAACACAGGATGAAGATATTGT
1387413
1387414
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
TTCCATAGAATTGTCTCTATGTTTATTGAGTGTATTTC
1387481
1387482
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
CTCAGCATTTGGAGACTATGGTGGGACTGGCAGTGG
1387547
1387548
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
ACAATTCCCTTTGCAAAAACTTTTATTTTTGGAATAAAA
1387616
1387617
GTTTTAATCGAACCATAGTGGAATTGAGAC
1387646
Left flanking sequence : Till position 1381767 (length
bp)
TTTTTAAAGAAAAAAAGGTTCCAAAAATTTTTTTTAAAATAATTTTAAGAAACATTTGATTTTTTCAAAT
AAACAAATATTTTTGCCCAAGAAATGGTGG
Right flanking sequence : From position 1387646 (length
bp)
TAAAATCAAAATAATAACAAAACAGAAAAATGAAAAACAAACTAAAAAACATCATAAAATACATCGGAAT
AGGAATAACTAGCGGATTAACAATAATCAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp