Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_017477_1                                                                                                                 top


Strain : Lactobacillus johnsonii DPC 6026 RefSeq :NC_017477 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017477_1
DR consensus (36 bp) : GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACNumber of repetitions :28
Begin Position : 1199794 End Position : 1201611

1199794AAGAGTACCATATTTGATCTAACAACCATCTAAAACGTTATAATCCTCTTGTATAATTATATTTTT 1199859
1199860GATCTAAACTTTATTCATCTAATAACCATCTAAAACCTTTTGCTTTATCTTCAACATCATCCATAG 1199925
1199926GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACATCAATACCGTACAGGTTTTTAATTGTATC 1199991
1199992GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTAAACGTATCAATCTCTGTATGTTTGCTTA 1200057
1200058GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTAAATTACGTCTCGAATTAAACAACATTAA 1200123
1200124GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTATTTAAAGGCTAGTAACTCACTAGCCTTT 1200189
1200190GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCA 1200255
1200256GATTTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCA 1200321
1200322GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACATCTTCTTGAAGAACGAGGATATATTGTCA 1200387
1200388GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTGCTTGCTTAGCATTCATCCAAGTTGTATT 1200453
1200454GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTCCTATCTTTTAATAATTCACGTATTTCTT 1200519
1200520GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCAAAACCATCTGAATCAAAATCACAGCAGG 1200585
1200586GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTAATCAGCTGGGCTGTGATTGCCTCCTTAG 1200651
1200652GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGGAACAACAAGTTCTGAAAGAACAACGAGA 1200717
1200718GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGGAGCGTTAAATACACTTTTGACTAATTTG 1200783
1200784GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTGAGGCTGGTGTGATTGTACCTAAAGAGGT 1200849
1200850GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTTCTCAATTTAATAAACAATATCGTGAAG 1200915
1200916GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAATGATAAGAGCTTATATTGTAGAGCCACG 1200981
1200982GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGCACTATTGGGAATATGTTTACGGTACATG 1201047
1201048GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTGATGATACCAGAGATACTGATAGCAACG 1201113
1201114GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGCTTCCCATGCAGTCACTAGAATATTGATA 1201179
1201180GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGAGAATGAAGAACGGCAATCAGTCTTTGAA 1201245
1201246GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAGAATTGCTGCTTAATCTTCTGAAATGCTG 1201311
1201312GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGAACATTAGTTGTTAATAACGTCTGATTAA 1201377
1201378GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGTACTATCGGAAACATGTTTTCAGTACATG 1201443
1201444GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCAGCAGGTATGCCATTTTTAAAAGGATAAC 1201509
1201510GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTTCTATGATGACAAAGGTACTGTTTTAGG 1201575
1201576GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC1201611
Left flanking sequence : Till position 1199794 (length bp)
AAAGGTAAAAGAAAATGGTAATTTAGATAAGATCCCCAAATTCAACAAAGCAAAAAGTCATTAATATCAA
TATTTTTAATTAATACTAATGACCTTTATA
Right flanking sequence : From position 1201611 (length bp)
CGACAATTTATAATTATCTTTTAATGATAGCTGTCAGTACCAATCAACAAGGTCCTGATCAATGTAGAAA
TAATCAGCATCTTTCGGATAAACCAGAATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp