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CRISPRs details
NC_017477_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_017477_1                                                                                                                 
top
Strain :
Lactobacillus johnsonii DPC 6026
RefSeq :
NC_017477 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017477_1
DR consensus (36 bp) :
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
Number of repetitions :
28
Begin Position :
1199794
End Position :
1201611
1199794
AAGAGTACCATATTTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GTTATAATCCTCTTGTATAATTATATTTTT
1199859
1199860
GATCTAAACTTTATTCATCTAATAACCATCTAAAAC
CTTTTGCTTTATCTTCAACATCATCCATAG
1199925
1199926
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
ATCAATACCGTACAGGTTTTTAATTGTATC
1199991
1199992
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TAAACGTATCAATCTCTGTATGTTTGCTTA
1200057
1200058
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TAAATTACGTCTCGAATTAAACAACATTAA
1200123
1200124
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TATTTAAAGGCTAGTAACTCACTAGCCTTT
1200189
1200190
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCA
1200255
1200256
GATTTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TTTCTTTCTGTATCTTTAGCTCCTATATCA
1200321
1200322
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
ATCTTCTTGAAGAACGAGGATATATTGTCA
1200387
1200388
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TGCTTGCTTAGCATTCATCCAAGTTGTATT
1200453
1200454
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TCCTATCTTTTAATAATTCACGTATTTCTT
1200519
1200520
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CAAAACCATCTGAATCAAAATCACAGCAGG
1200585
1200586
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TAATCAGCTGGGCTGTGATTGCCTCCTTAG
1200651
1200652
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GGAACAACAAGTTCTGAAAGAACAACGAGA
1200717
1200718
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GGAGCGTTAAATACACTTTTGACTAATTTG
1200783
1200784
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TGAGGCTGGTGTGATTGTACCTAAAGAGGT
1200849
1200850
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TTTCTCAATTTAATAAACAATATCGTGAAG
1200915
1200916
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
AATGATAAGAGCTTATATTGTAGAGCCACG
1200981
1200982
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GCACTATTGGGAATATGTTTACGGTACATG
1201047
1201048
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TTGATGATACCAGAGATACTGATAGCAACG
1201113
1201114
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GCTTCCCATGCAGTCACTAGAATATTGATA
1201179
1201180
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GAGAATGAAGAACGGCAATCAGTCTTTGAA
1201245
1201246
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
AGAATTGCTGCTTAATCTTCTGAAATGCTG
1201311
1201312
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GAACATTAGTTGTTAATAACGTCTGATTAA
1201377
1201378
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GTACTATCGGAAACATGTTTTCAGTACATG
1201443
1201444
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CAGCAGGTATGCCATTTTTAAAAGGATAAC
1201509
1201510
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TTTCTATGATGACAAAGGTACTGTTTTAGG
1201575
1201576
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
1201611
Left flanking sequence : Till position 1199794 (length
bp)
AAAGGTAAAAGAAAATGGTAATTTAGATAAGATCCCCAAATTCAACAAAGCAAAAAGTCATTAATATCAA
TATTTTTAATTAATACTAATGACCTTTATA
Right flanking sequence : From position 1201611 (length
bp)
CGACAATTTATAATTATCTTTTAATGATAGCTGTCAGTACCAATCAACAAGGTCCTGATCAATGTAGAAA
TAATCAGCATCTTTCGGATAAACCAGAATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp