Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_017766_3                                                                                                                 top


Strain : Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 RefSeq :NC_017766 (plasmid pSHJG1 linea)
CRISPR id : NC_017766_3
DR consensus (29 bp) : GTGCTCCCCGCGCCCGCGGGGATGGTCCCNumber of repetitions :13
Begin Position : 51788 End Position : 52548

51788GTGCTCCCCGCGCCCGCGGGGATGATCCGCCGCCCTGCCCCGCCTGAGCGCGAACGTGCCG 51848
51849GTGCTCCCCGCGCCCGCGGGGATGATCCCTGCGGGAGGCCATCCGCCGCGCTGTCTGTGAG 51909
51910GTGCTCCCCGCGCCCGCGGGGATGATCCCAGTTGCAGACGCTCCCGCTCGCCGCTCACCAG 51970
51971GTGCTCCCCGCGCCCGCGGGGATGATCCCCCCGCCGCGCTCGCCCTGGCCACTCTGGGCAT 52031
52032GTGCTCCCCGCGCCCGCGGGGATGATCCCACCGTCCAGTCCAAGTACACAGCTCCCTACCG 52092
52093GTGCTCCCCGCGCCCGCGGGGATGATCCCCTGAACTTCGGCAAGGCGGTCGGTGCACGCTG 52153
52154GTGCTCCCCGCGCCCGCGGGGATGATCCCCAGGCGGCGCGCACCGTCGCCGACACCCACGA 52214
52215GTGCTCCCCGCGCCCGCAGGGATGATCCCGAGCTGTGCACCGCCACGATCAACGACCGACG 52275
52276GTGCTCCCCGCGCCTGCGGGGATGGTCCCGGTACTCGCGTCAAGGCGCGCGGGTCAGGCGT 52336
52337GTGCTCCCCGCAGGCGCGGGATGGTCCCACCGCCAACGTGGTGGCCGAACGGCTGCGCCC 52396
52397GTGCTCCCCGCAGGCGCGGGGATGGTCCCTGGCGGTGCATGCCCGTGCTCACCGGCGCCAG 52457
52458GTGCTCCCCGCGCCCGCGGGGATTGCCCCGATACCAGCAATCTCTGTGAGTCGGCGTCCCG 52518
52519GTGCTCCCCGCGTCCGCGGGGATAATCCC52547
Left flanking sequence : Till position 51788 (length bp)
CGGCAGTCCGTCTTGGAAGCGTGCTTTGGGTTGTATGCCGGATTCGGTGAAAGTCATGGAAGAGGAGTCG
ATGGCGCAGTAAGAATGCAGGTCAGTGAGT
Right flanking sequence : From position 52548 (length bp)
GGGTCAGGTCGCTCATCGGACACGCCCGCGGGGATGGTCCCTTCCTTGGCTGGCCGCCCTGTTGGCGGTC
ATTGGTCCCGTGATTTCTGGGTCGGGGTTC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp