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CRISPRs details
NC_017857_1
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NC_017857_1                                                                                                                 
top
Strain :
Methylophaga sp. JAM1
RefSeq :
NC_017857 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017857_1
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAAC
Number of repetitions :
106
Begin Position :
2646109
End Position :
2652436
2646109
CTTCATGCTGCCTATTCGGCAGTAAACC
CAGTTACCTGAACTCGGAGCTACGAGAAAGCA
2646168
2646169
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CTGGTCGCGTGGTATTTTGACGGGCATGTGAT
2646228
2646229
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TGTTTAAGTGAGGTGCGTTCGGTGCCGGAACT
2646288
2646289
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GTAGCCGGTGCAGCCAATAGTGTATTCCCGGC
2646348
2646349
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AATCGCGCCCATTTTCGGCAAGTCGCTGATTT
2646408
2646409
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AGCCGCGCATCCGGCGAATATTCCAGGCGGTT
2646468
2646469
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ACATGGTGCTTAATTAAATGAGGTGTTATTAT
2646528
2646529
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TGCCCCATGTATATACATAAAGAATTGCTTCT
2646588
2646589
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AATGACCTTCTTAGATGCTTTACAGCATGCCT
2646648
2646649
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GTCCAGCAGCAGGGCAGCCAGAATTTGCTACA
2646708
2646709
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AATGACAATGGCAGCGATAAAAGGCCAGATTT
2646768
2646769
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AAAACAACCAGCTACGTGCTGATGTTGATGCT
2646828
2646829
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AAGCTGAGACAGACGTTTTATTGCTTGATGCT
2646888
2646889
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CTATAGCTCACCCTCACGGCTATTCCGATCAG
2646948
2646949
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CCAGAAACAGTTGAGGCCTCGGCATCGGTGTA
2647008
2647009
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CGGGGGCGGCTCCATTATCCACGCTGGAACTA
2647068
2647069
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GACGATAACTAACAGCAGCAAAATACAAGTCA
2647128
2647129
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CGGCAGGAACTTCTTACGATAATACATCTTCT
2647188
2647189
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TTTGTTTATTGCATTTAACAGCATACATTGAC
2647248
2647249
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GCCGAAATCAGTCAGGCGTTTTTAACCGCACA
2647308
2647309
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GGATGAGTGAATTAATAAAACCATATGTAAAA
2647368
2647369
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GAGCCAGCATCTACCGTAGCTTACATGCCGTG
2647428
2647429
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ATCAGAAAGGTTATCGACGGTACACGTGGTGA
2647488
2647489
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CCGTTTTTGTGCCAATCAATGACGTTCTGTAT
2647548
2647549
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CAGGTTTTTGCGTTTGAGTCAGATGGCAGTCA
2647608
2647609
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AATGGCAATCCCTAACCGCAAACGGCACAAGT
2647668
2647669
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TTTAAAAGCGACCATTTAGGCGTTGCTGATTT
2647728
2647729
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CAAAAAGCGATAGACCGCAGAAGCGACTATCA
2647788
2647789
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TACCTGAGACCCTGCCACCCCTGAAAATGTCA
2647848
2647849
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CGAGTAAAACTGTGATTAAAAAAACGGTGATT
2647908
2647909
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TATCAGGAATTTTTCTGTTAATTAAATGAATA
2647968
2647969
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TCAGTGGAAAAGCGGGATTCTGATATAGCTTA
2648028
2648029
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AACGACATAAGCGCGCCACAAGCATCGAGCAT
2648088
2648089
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ATCATCTTTGCAGACGGCAAAGTACAATGCTC
2648148
2648149
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AGATAAAGCAATTTTTTGAGGGGATGATAAAT
2648208
2648209
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TGGTAAAGGCGAGCTAAAGCCAAAACGCAACT
2648268
2648269
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GCGCTATCAAGGGTGCAACATGGCATATCCAA
2648328
2648329
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AACCACCCTCAGCAGATAGCACAACTGGACTTG
2648389
2648390
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GTGGATAGTCGTGAGATGGGTGATGAGCTAAC
2648449
2648450
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GAAGGATCACCTCTAGGTTGTCAGGATGCATA
2648509
2648510
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TGAAAAGCATTTCTTTGAATACCAACAGTTAT
2648569
2648570
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CGTTTAAGTGAGGTGCGTTCGGTGCCGGAACT
2648629
2648630
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GTAGCCGGTGCAGCCAATAGTGTATTCCCGGC
2648689
2648690
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AATCGCGCCCATTTTCGGCAAGTCGCTGATTT
2648749
2648750
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AGCCGCGCATCCGGCGAATATTCCAGGCGGTT
2648809
2648810
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ACATGGTGCTTAATTAAATGAGGTGTTATTAT
2648869
2648870
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TGCCCCATGTATATACATAAAGAATTGCTTCT
2648929
2648930
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AATGACCTTCTTAGATGCTTTACAGCATGCCT
2648989
2648990
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GTCCAGCAGCAGGGCAGCCAGAATTTGCTACA
2649049
2649050
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AATGACAATGGCAGCGATAAAAGGCCAGATTT
2649109
2649110
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AAAACAACCAGCTACGTGCTGATGTTGATGCT
2649169
2649170
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AAGCTGAGACAGACGTTTTATTGCTTGATGCT
2649229
2649230
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CTATAGCTCACCCTCACGGCTATTCCGATCAG
2649289
2649290
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CCAGAAACAGTTGAGGCCTCGGCATCGGTGTA
2649349
2649350
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CGGGGGCGGCTCCATTATCCACGCTGGAACTA
2649409
2649410
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GACGATAACTAACAGCAGCAAAATACAAGTCA
2649469
2649470
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GCTTACGCGGATTAAAACGCTTAGCTGATGAA
2649529
2649530
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TAGAACTTATTTCTGACTTGGGTTCTGGTGAT
2649589
2649590
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AGAAACTTCACATTCAACAGTAACAGGCCATT
2649649
2649650
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GGCGTGCTTCTGTTTCGACGTCAAGAGTGGCT
2649709
2649710
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GAATTGCTTTAACATCGCTGGCCACCTTTTCA
2649769
2649770
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GTACCCTTCTGTCTGCTGACTGATATAGTTCA
2649829
2649830
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CATTAGTTCACCTTTGATAAATTGCGGGGAAA
2649889
2649890
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GTGCCTCTTTGGGCGTGCTTTCGTTATAGTTT
2649949
2649950
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TTATCAATAATACTTGAAGATGCAGCAAGTAA
2650009
2650010
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AAGGCAACCCCCCATACTGCAATAACTGAAGC
2650069
2650070
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ACAGGGGGGTCTTCGGACCCCCCCTTTTTTTT
2650129
2650130
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TTTCAGAAGAACCCCATGGGGAAGAGGTGAAT
2650189
2650190
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GCAGAGCCGGAAGCGGTCGAAGTGGTCAACAT
2650249
2650250
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CTTCAAACCCATCAACCAGCAATCCTTTAATA
2650309
2650310
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ATCATTTCAACTTGAAGTCCCTAATTATGTCT
2650369
2650370
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TCAAGCCGATCTGGATGCGTTGGCCTTTTAT
2650428
2650429
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TGTTGATGCCCATCGTTCAACTGGCAACGGTT
2650488
2650489
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CAAGTGATGCCCATCCTGTAAGTGAAATCGGT
2650548
2650549
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GGGTAATAAGCACTTACATTCGATTAGGCGCA
2650608
2650609
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TTTATGACGGACTGTTTTCTTTGCCCTGTTTT
2650668
2650669
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TTCCAGCGTTCTTTGAAACGCCATTTCATTAA
2650728
2650729
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ATATTTTTCGCTGTGTTCTTCTACGCCATAAA
2650788
2650789
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AGCACATGAATACATAACCCAATACAAGTTAA
2650848
2650849
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GCCAACTTGCAGCGGGCGGTTTAACGCGCTCA
2650908
2650909
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TTTGCAGCACCTTCATCGGCTTGCTGACTGAT
2650968
2650969
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GTCGGATGAATTGGCGCGATGTATTAAGCAGT
2651028
2651029
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GAAACCGCTTGCCGGAAAATCATCACCAGCAA
2651088
2651089
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AACCGGTCATACAGCCAAAGTCGTTCACTCAT
2651148
2651149
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CTATCTGTGCGCTGCGGATTGGCAATCGGCGT
2651208
2651209
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GTCTTTCAATCACATCATCAGTCAGCGGTTTA
2651268
2651269
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GTTTTCTTTGCTCTGTTTTGGGATTTGGTCAG
2651328
2651329
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CCTGTGCTTTCTGTTTCTCGTGCTGCTGGTAT
2651388
2651389
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GCTTGCGGGGATTAAAACGCTTAGCTGAAGAA
2651448
2651449
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TCATGATGAACCTCTGAAAAAGTTTTAGGAAA
2651508
2651509
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ACATGGCGCTTAATTAAATGAGGTGTTCTTAT
2651568
2651569
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ATGGTCAATGCGTGAACGAATGGTTTCATGGT
2651628
2651629
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ACCTGTTATTCCTGATTCTACTATCACTGATG
2651688
2651689
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ACTCTAATCAAAACCGTTTAACTGTTGCTGGT
2651748
2651749
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GCGGCTATGACGCAGCCCCATTCATTGAGTCT
2651808
2651809
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ACTTGGTACACCGATAACCATAAAGGCTGGCA
2651868
2651869
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CAGCAATTGAGACTGGCGCCTCTTGACCGTCT
2651928
2651929
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACC
CCGTAAGTGTCGCGACCTCATCAAGTCAGACT
2651988
2651989
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TCAACCACCGCGACCGCTATTGATCTAGCTAA
2652048
2652049
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ACGACTATGACCCAAATGCCTATGCCGGATAT
2652108
2652109
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
ATCGCACAGCCTCACCACTAGAAAGGTGGAAA
2652168
2652169
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GATAGCTATGGACGCGCTCAAAACAAGATATG
2652228
2652229
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACA
AAGTTATGGCCGAACACGGGCAGAGTGATAAA
2652288
2652289
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACG
GCTGTGGTTATGGCGGCTACCAAGATTTGTGA
2652348
2652349
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
TGGGTTAGGATTGAAATGCCTACGGGCTTAAT
2652408
2652409
TTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACT
2652436
Left flanking sequence : Till position 2646109 (length
bp)
GCACTGCCCGCCCGGCACATCGGGAGTGAGGGCTTCAGAATATTGCTCTTACATATACCTAAAAGTTGTA
ACAACAAGCTTCTCATTATTTTAATGATGA
Right flanking sequence : From position 2652436 (length
bp)
GAAGTTTAACGCAAAAAAAATAAGTTACAACAATCATTTACTCTCATTCTTCAGGTTTTATGAATGATAA
AACGATTACATGTAACTTATTAATAATTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp