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CRISPRs details
NC_017861_1
Flanking alignement tool
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NC_017861_1                                                                                                                 
top
Strain :
Prevotella intermedia 17
RefSeq :
NC_017861 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017861_1
DR consensus (47 bp) :
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
Number of repetitions :
39
Begin Position :
246278
End Position :
249242
246278
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
ATAAAATTTAAAATTATGCAAACTTTTTT
246353
246354
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GGACAACTTCAAAAAGTTATCTTTCAGCG
246429
246430
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CGCCCTATCGTCATTTCAATGCCACCGAGT
246506
246507
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CAAAAGCGGTCGTAAGGGCTTTTATCCCG
246582
246583
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TGGTGCAACCAAGTGGAGCGTATATTGTA
246658
246659
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TATCAAATACAGGCGCATACTCCTTGTACA
246735
246736
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TTTCTTCAAATAATTTCCTGTGCCTACGTT
246812
246813
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TTTTTCGTTTCGTTCACACGTTGATATTC
246888
246889
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CCTGCTCTACTTGTTGTATAGTTTCGTTCT
246965
246966
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
AGGAAAGAATAAACAGTGCTTGGAAATAAT
247042
247043
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CGCCTCAACATTGCCAATATCCTCTCTCTA
247119
247120
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CTTAGGTATGTTAGTTAGTGGTGCTGTTGG
247196
247197
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GGCTATGCGCTCGATGCATATAATACTAA
247272
247273
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CACAGACACATCAATAATAGTAACTTTCTC
247349
247350
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GCGGGTGCAGCACTTGCCTACTTATACACA
247426
247427
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TTGAAAATTATTGACATTAAAGGAAAGGGC
247503
247504
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
ATTTAATCTAAAAACTTTCATATTTATTTA
247580
247581
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CACGTGTAACGATAGCACAGTTTCCGTCCT
247657
247658
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CTGCCACCGTAACAACGTTTGAGCCATTAA
247734
247735
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
AATAAACTGTAATACTTCTTTTAGGTCTAC
247811
247812
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TATACGACCAAATATTGAAGCAGAACCTTA
247888
247889
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TGACGCTATGGGTTACGAACTTACCCCAAT
247965
247966
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GGAAAGATGTTGTTGTATTGCTTGCTGCAG
248042
248043
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CAACAACGTTAAAAAGTGGCAACCCATTTA
248119
248120
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GCCCGTCAAATACTCGGCTTAGCTTATCAA
248196
248197
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CCACTCGAAAAAGGTAGTATCGGACGAAGA
248273
248274
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
AAGCTCAAAGCCTTTACAATGCTGCTATTA
248350
248351
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
AGGGGATTTAATAATGACATACCACTAGGT
248427
248428
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CGATTGTTTTCTCGTCGCCTTTCACGAGT
248503
248504
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GGAAACATAAAACCTAAATTCATATCCTTT
248580
248581
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TGTCAGCCTTTCCGTATTTGTCCTTTGGCA
248657
248658
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TTCTATTTGGTCTGATAATTTAAATTATGG
248734
248735
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GGTTATTCTCTCGACCCTAATTGTCAGAAT
248811
248812
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
ATGCCGAAGATGTAAGTAATGGTAGTGCCA
248888
248889
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TAAAAATTTATATTGAAAAGATATGATAAA
248965
248966
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
AAACAGTCTTTGAAAATCTTGTGAAAATGC
249042
249043
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GACTATGGTATCTTCGTTATCGTCTACTT
249118
249119
GTTGTATTTACCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
AACCTCCGAGCACATTACGAAATGCCTACT
249195
249196
GTTGTATTTACCAATGCAAAGATACCAATTCTAAAGCAATCACAACT
249242
Left flanking sequence : Till position 246278 (length
bp)
AAGTTCCATTCTTGACGAGTGGAACTTTATTTTGCTTGCATTTTTCTTTCTCTCTAAGCTTTCGTAACAA
TACTGATGTTCATTACTTTAATCTACTTGA
Right flanking sequence : From position 249242 (length
bp)
AACGACACTTCCGATTTATTGTTCTAAAATCAAGTAAATGGGGCAATAAATTTAACACAAGCGAAAAGGG
GAAAATAGAGAAAAAGAGAGCTGGAAAATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp