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CRISPRs details
NC_018016_4
Flanking alignement tool
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NC_018016_4                                                                                                                 
top
Strain :
Ornithobacterium rhinotracheale DSM 15997
RefSeq :
NC_018016 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_018016_4
DR consensus (47 bp) :
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
Number of repetitions :
17
Begin Position :
2221618
End Position :
2222892
2221618
GTTGTAATTAGGTCTCAAATTATTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
ATGAACCGCTTAACGGCTAAACAATATCTA
2221694
2221695
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
CGAAGGGATCACAGGATTAAACTTAGGTTA
2221771
2221772
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
TTTATGTAAATTAAAATAGATTAAAAATGG
2221848
2221849
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
TTATAGAATTTGAAGCTGACGAGGAATTTC
2221925
2221926
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
AAATTTCAGAAGCTAAGTTAACGCACATA
2222001
2222002
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
CAATTTCTTAATTGGTGATAACCAACACC
2222077
2222078
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
AAATGGTCAGAATGTGACGGATGTTTATGT
2222154
2222155
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
TGGCATTCCCTGCGAGTGGACTTACAACA
2222230
2222231
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
AACACGCAAAAGATTTAGCCACAGCGCAGG
2222307
2222308
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
AAACAGATGAAGTGTTTAAATCTGGTCCTA
2222384
2222385
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
AAACTTGAAAAGATTCGTTTAGACTATTTA
2222461
2222462
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
AATCTAAAAGAGCAAAGTGATGGAAGACTG
2222538
2222539
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
TATAGGGGGATATTACTGCAAGAGAGAGTT
2222615
2222616
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
ATCTTCTCGATTAATTAATAACCTCATAC
2222691
2222692
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
GAGAAAGCACAAGCTAAATTAAAAGAACAA
2222768
2222769
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
ACGATATTTAATTATATCGTGGTAGCAAGG
2222845
2222846
GTTGTGATTTGCTTTCAAGTTCTTATTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
2222892
Left flanking sequence : Till position 2221618 (length
bp)
CTTTTCTTTAGGCTCATGGGCAACCTTTTTTATAATGCACTACGGGTTTTTTTGTGTGAGTAATCACAAG
TCGATGCAAGGCAAGGAGATGGGGTAGGGT
Right flanking sequence : From position 2222892 (length
bp)
ATACTTCTTGTTTTTGCTTGTAAATCAAAAAGTTGAAAAGGTTGCTAGGATTATAGAAATCTGCAACCTT
TTTTTATTTGAAGTAAATTTTTGATAATTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp