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CRISPRs details
NC_018018_1
Flanking alignement tool
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NC_018018_1                                                                                                                 
top
Strain :
Flexibacter litoralis DSM 6794
RefSeq :
NC_018018 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_018018_1
DR consensus (37 bp) :
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
Number of repetitions :
21
Begin Position :
11266
End Position :
12758
11266
ATCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
TAAACTTGTTTTATGCAGAGTTGATGAAGGGTTTGA
11338
11339
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AAAATTAAAATGTATCAAGACGAAATTAGAAGT
11408
11409
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
TCATTTTCAACATATCTGTCAGATACAAAGCCATCAA
11482
11483
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
GAAACGTGCTAATTTAAAAGGTTATACATTAGTAG
11554
11555
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
GTAAATTAAATTCGCTTTACACGCAATTAGGGACAT
11627
11628
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AAAAAAGATGAATAGATTTAAACAGTGCTTTTTAGCAAA
11703
11704
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AATGGAATAGTTACAAAGGATACTGTTCAACTCA
11774
11775
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
CATTGTCTCCAAAAATACCAACTGCTGCTGCTG
11844
11845
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AATTATATCATAAACGTATTTTAGCAGAAAACGCA
11916
11917
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
GCAACCTATAATAAAAACTCAAAAATAAACTAAATC
11989
11990
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AGGTTTTGAAATACTTGAATGCTTTGGAGGAAATGGA
12063
12064
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AAAAGGGCAATTTGCGCAAACAAGTGGAGGCAGTGC
12136
12137
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AAACATATCCAATAGGATGATACATACCTTACGGTAT
12210
12211
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
TCCCGATTTTTATCTTAACATATTAACCTTTTATA
12282
12283
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AATAAAAATCTTGTATAAAAAAATTTAAGGTAGTAGT
12356
12357
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
ATAAATTATGCTCAGAAATCGACCTCTAAAGTTGCAC
12430
12431
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
ACTCAAAAAGTGTCGGTTAAAATTCAGCATTTTTG
12502
12503
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
ACAAATAAAATATCTTAACTTGTACTCTTTAGATAA
12575
12576
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
TAGAAGCAACCATTTCATTTGCGAAAACAGAGCGTGGA
12650
12651
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AAGGATAAGTTTGAGAAAAGAATGTCGTATCATA
12721
12722
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
12758
Left flanking sequence : Till position 11266 (length
bp)
TTCAATGATTTATCAAAAAAGTTATAAACAAATAGTTTGCCTAAGAAATGAGAAATTGTAAAGTTATGAA
ATTGATGGTGAAGGAAACCCTGCTTTTAGT
Right flanking sequence : From position 12758 (length
bp)
ACCAACACTGACATTTTGTCAAAATCATTACTTTTTATCAAAAAACAGTCTTTATTTTTCTCTAAAAGCA
CTTTTTTGCTTTCAACCTTTCCCAAAGGTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp