Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_018089_2                                                                                                                 top


Strain : Streptococcus mutans GS-5 RefSeq :NC_018089 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_018089_2
DR consensus (28 bp) : GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATNumber of repetitions :21
Begin Position : 1419393 End Position : 1420640

1419393GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATATTGAGAGACGCTATAGAATTTCTAGAAACTCA 1419453
1419454GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATCAGTAGCAACGGCTATGGAAGTAAAATCAACAT 1419514
1419515GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATCCACAAATCAGCTTTAACTTTAACGACCTTTCA 1419575
1419576GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATCAGAAATAAATAATTTAAAATATAAATTATCCA 1419636
1419637GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATGATAAGGTCTATAATTCTATCCACTAACGACCA 1419697
1419698GAATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATTAAAAGAGGCGAGATTATTCAACAAAAAAACCA 1419758
1419759GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATAAAATCAGATGATGAACTTGAGGACGCGCGTCG 1419819
1419820GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATGGCTATTTAGGCCTTGCAACTGACAAATCAGTA 1419880
1419881GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATTTAGAGATGTTGAAGTTGATGGCATTAAGTCTA 1419941
1419942GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATTTAGAAAGTTTGGAAATGACACAGTCAATATCA 1420002
1420003GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATTTGTATATCGTGATTGTCAAGTCGTTGCTTGCA 1420063
1420064GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATCTCAGAGACTTCTTCGCCTTTGCCAAAACCAAG 1420124
1420125GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATCATTAAAGCCTGAAGCAGTAGATGAGATTGACA 1420185
1420186GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATTAAAAGAGGCGAGATTATTCAACAAAAAAACCA 1420246
1420247GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATCTACAATCAAAACAATGTCAGTTGCTGTAGTTA 1420307
1420308GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATTAATATGTCCGCAAGCTTTGACGAAGCTAAGAA 1420368
1420369GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATTGTTCTGCGTGACAGCGAGGACATACAGTGTAG 1420429
1420430GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATCAATCTGATGTAGTGACTAAGACTATACATGTA 1420490
1420491GGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATTTTCCAAGCATTGACGGGGCTAGGTGGTGGCAG 1420551
1420552AGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAATTTCTAATCGTTTATCACTGATTTGCTTAATCAG 1420612
1420613AGATCACCCCCGCTCGTGCGGGTAAAAT1420640
Left flanking sequence : Till position 1419393 (length bp)
TTCCTTCTATCCAAAAGAATCAATTTCAATCGGTCTAACATCACAAGTCTATATGTGTAGGTAAAACATG
ATTTCTGTATCTGATTCGTTGTTGTCACTG
Right flanking sequence : From position 1420640 (length bp)
ACTAAAAGATCCCAATAAAACCGCTACTTCTGATTGATCCCTTTCAAAAATTTATTCATTTTAGTTGACA
AGTCATAAATCAGTTTAGAATCGTGAAGAG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp