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CRISPRs details
NC_018610_6
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_018610_6                                                                                                                 
top
Strain :
Lactobacillus buchneri CD034
RefSeq :
NC_018610 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_018610_6
DR consensus (36 bp) :
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
Number of repetitions :
17
Begin Position :
1941773
End Position :
1942865
1941773
ATCTCTAACCTGATTGATTTGACATCCTTCTAAAAC
TCACATTTTCCACAGCTAGTGGATCGTCGG
1941838
1941839
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CCATTAACTGAATCATCATCAGAACTGTCAT
1941905
1941906
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CCACAATCTCGGGATCCACTTATACATTAA
1941971
1941972
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
GTCTAAAATGGACACTATTTATTCATCCAT
1942037
1942038
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
AATGATTTGGAAGTATGTAGATTTGATTTG
1942103
1942104
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
ATTCATTGTAATACCCTCCAATTGATTTCC
1942169
1942170
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CATAATTACACCGCCTTTTATTGTTCGATA
1942235
1942236
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CGGTGTCAATGCTTTGATTTGTGCTGCCAA
1942301
1942302
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
AAGACAGATGGTTGACCACCATCCATCAAT
1942367
1942368
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CATATTATATCATTAGCAAATAATCTTCAG
1942433
1942434
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
GGGTTGCGGCATACAAAAAGCCACCCCCGT
1942499
1942500
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
TTTTACAGCAGCGAAAAAGGTGCACGGGAA
1942565
1942566
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CAACCGCTGAACTGATTCCTTTTCCTGAAG
1942631
1942632
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
AGCGATGACTGAAACCTGTTGATTCTTGCA
1942697
1942698
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CAATTCAATATTAAACCAACCCAATTGTTT
1942763
1942764
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CGGCGAATGACGAAAGCGCAAAAGATTGGG
1942829
1942830
GGGGTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
1942865
Left flanking sequence : Till position 1941773 (length
bp)
TAAATAAACACAATAAGTTCCCTGCTTAGCAAATACTAGGCGGAGAACTTATTTTTTAGTGGTGGAAGAT
GATCCAGAATGAATGATCTGTTGAGAAGCC
Right flanking sequence : From position 1942865 (length
bp)
CGATTTTTTATAACCGAATTTTAATGCATTATAAATGCCAATCAACAAAGTCCTCGTCGATGTAGTAAAA
GTCGCAATTGGTATAAAGCTCCTGTGACTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp