CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_019676_12
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_019676_12                                                                                                                 
top
Strain :
Nostoc sp. PCC 7107
RefSeq :
NC_019676 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019676_12
DR consensus (38 bp) :
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
20
Begin Position :
3446755
End Position :
3448198
3446755
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CTTTTTTACCGTTGTACTCAGTTGTGTGAACTGCAAA
3446829
3446830
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATCAAATCAGTTAAAGACCCTTACTGGGATGAAA
3446901
3446902
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TCCAGTTCGACAAGTCGGGAACTCGTGCGGGTAGTCGGTCA
3446980
3446981
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TCCAAGTTCAGGAAGCGTGGAAGGGCAAATTCCCGTTT
3447056
3447057
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TGGCCGTCCTTCAAAATATGGTGAGCCTTCAAA
3447127
3447128
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GTAGTCGCCTGATTGGGGGCGGATTGCCGGATAA
3447199
3447200
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GAACCTACCCAGAGTCAGCGTAGGTTACTAGGCT
3447271
3447272
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GATTTTGATTTCCACGAAGCCTGATTACGATTTTCAAAATTTCCGGCGACTGAA
3447363
3447364
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GATTTTGATTTCCACGAAGCGTTGTTTATCGC
3447433
3447434
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AAGAAGCGCTCGACGTGATGAGGTAGTAGACAA
3447504
3447505
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AGCGCAATCGAAAAACTCTATTAAGGTGTAAT
3447574
3447575
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGCTGCCTGGATTTGTCACGAGAAGTTTTAGCA
3447646
3447647
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AGAAGTAATCCGCCGTGGTCGAGGTTTAAAGCTTCA
3447720
3447721
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CTTTGATGCCTTGGCTATTGGCACTCAAGCGGTGAAA
3447795
3447796
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GACACTAAAGTTGCCAACAATAAAGAGTTTATC
3447866
3447867
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ACTTCACACTGCCACCCATGTTTTTTTGTTGTGCCATAG
3447943
3447944
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ACTATCGACTATTTCATACATTAAATAATTTTTGA
3448016
3448017
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTTTCTACTATTAAGCCTGAGCCTTTAACTCAA
3448088
3448089
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AGCTTCTGGCATCACAGCTTTAAATGCTCAGAT
3448159
3448160
AATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
3448197
Left flanking sequence : Till position 3446755 (length
bp)
ATTTAACAAAAATCAATTGACATTTCATCGTGTTAAAATTAACCCATCCGCGAAACCGTACCTTGAAAAC
TAAATATAGTCAGCTTTTCCGGCTCCCGCC
Right flanking sequence : From position 3448198 (length
bp)
TTAGCTATTTACTAATTCATTATATAGCTATAGCCAGTTTTATTAGGACGCTGCGTGCTTGAGAACGAAT
TCGATAGCATCACGTAAATGATCACAATTG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp