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CRISPRs details
NC_019676_27
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_019676_27                                                                                                                 
top
Strain :
Nostoc sp. PCC 7107
RefSeq :
NC_019676 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019676_27
DR consensus (37 bp) :
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
21
Begin Position :
5817107
End Position :
5818597
5817107
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ACATGAACCAAGCGGACTACCACAGGGGGCAACAA
5817178
5817179
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTTATTCTGAAATTATATTTAACTTTAGCCATCAGATTCT
5817255
5817256
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ACCCAACGGGGTTCCTTCAGAACTAACAAAACAACGCGGAG
5817333
5817334
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAAAATATAAGAATCAGCAATGGTAGGAAAACCAAGCC
5817408
5817409
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TCGTTTAGCAAGAGTTATTGATGATGAGACTCAGGAG
5817482
5817483
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CATGTGTATGTCCGTGCAGGTGAATGCTCTTGC
5817552
5817553
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATCAGTTAACAACTGTTCACTGTTTTAGTCGGTA
5817623
5817624
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ACAAATTCTTAAACGGTCGACAGACGCGATCGCCC
5817695
5817696
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAGATTCAAGTGAGCGTGTTACTCAAGTCGCAAA
5817766
5817767
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTCCGCTAATGAGTTGAGGCGATCGCCTGAGATA
5817837
5817838
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTTTGGAGCAATGGATTTGGCATAAAGCCGATCATA
5817910
5817911
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GAGCGTTCAGGTAATAAATATTGGTATTACCGCT
5817981
5817982
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GAGTGGATAGCGTGGTGTATGAAAACATACAACT
5818052
5818053
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTTATTAGTATCTATATGAGTGTAGATATCAGCTT
5818124
5818125
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATTCTGATCCTGGGTAAATATACGATTTAACGCAAA
5818197
5818198
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TAAAGCTAGAGTGCCAATTTCAGATAACTCTAAATCTAT
5818273
5818274
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GAGAAAAGTTGGACTAATTCACCTACATCAACAGCC
5818346
5818347
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TGAGTATTTTGCTAACGATACTGCCAAAAATCAGT
5818418
5818419
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAATTAACCGCTTGAACTGTTTTTTGAAGGTTTC
5818489
5818490
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ACACAGCAGAAGTCAATAGAAAAAACATCTGAAA
5818560
5818561
GTTGCAATTTCTATTAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
5818597
Left flanking sequence : Till position 5817107 (length
bp)
ATTTGGTGTCAATCAATTTTAATTTTTTGATGTTAAAATCAATTCATCCGCGCAATCGAACCTTGAAAAC
CAAATACAGATTAGCTTTCTGGCTTCAGCA
Right flanking sequence : From position 5818597 (length
bp)
CACCGCGTGCGATCGCATCTTCGTAGATGAATCATTGTTAAAATATTATTTGAATTTTAGGCGTTGTTAT
GAAAACCATTGGCATTCATCATATAGCGAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp