CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_019676_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_019676_4                                                                                                                 
top
Strain :
Nostoc sp. PCC 7107
RefSeq :
NC_019676 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019676_4
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
Number of repetitions :
19
Begin Position :
2728758
End Position :
2730094
2728758
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
TTCAAGGTCTGGGGTGTAGGGTTAGACCCCTCAT
2728828
2728829
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
CCTCTGTCTGCTCTGTAATCCTTAACTACTCCATC
2728900
2728901
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
CATTCAGAAAGATTCCAGCTTCATCAAGACATAC
2728971
2728972
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
GTAAAAATATTCGTCCAGTTAAATTAAATGATTC
2729042
2729043
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
TGACGCTGACTCACTGGCACTTGCTTGTTACCAATTT
2729116
2729117
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
TGCTAGAGGCTCTCCGCTTGTTGAAGGCGAAACACTTAACT
2729194
2729195
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
CATTTTCTTGATTATTCATTATCTAATCCTTAAG
2729265
2729266
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
CCAATGGTTTGAGTCGGTTTCTTTAGGGTTTACA
2729336
2729337
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
ATTTATTGTAAATCCTGGAATAAATAGGCGAAGAAA
2729409
2729410
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
GCTGACTCACTGGCACTTGCTTGTTACCAATTT
2729479
2729480
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
CTTAGTAATCAAAAATGTAATCAAAGGATGAACCA
2729551
2729552
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
TTGATAAGTAAACTAAAACCGAAAGTAGCAACGAGC
2729624
2729625
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
TGATTATCAACCTTCATCCTCTGATATTGATGGT
2729695
2729696
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
TACTAATATTCCTGATTCTGATGCTGATGGTGATGGTGTTCCT
2729775
2729776
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
CTGTTTTTCAGATTGAGCGATAAACAATACATACT
2729847
2729848
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
CCTGATTCTGATGCTGATGGTGATGGTGTTCCT
2729917
2729918
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
TTCAACCGTTCTTCTTGGGAGCAGCTTACTGAGC
2729988
2729989
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
TTTAAAGCAAATCGAAAACCACAAACAGTAGT
2730057
2730058
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGGTGAAGTTTAAAC
2730094
Left flanking sequence : Till position 2728758 (length
bp)
TTTTAGTTGATTTTTTAGACACAATTCAAGGAGTTTCGTCTATAAAAGCAAAAAGTTCATCGTAATGTAA
GTTTTTATGTCCAGAGTCTCATTAGGAATT
Right flanking sequence : From position 2730094 (length
bp)
TGCGGGAGCCGGAAAGGCTGTCTGTATTTAGTTTTCAAGGTTCGATTTCGCGGATGGGTTGATTTTAACA
CGAGTAAATGGCAGTTGATTTTAGCAAAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp