CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_019677_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_019677_1                                                                                                                 
top
Strain :
Nostoc sp. PCC 7524
RefSeq :
NC_019677 (plasmid pNOS7524.01 )
CRISPR id :
NC_019677_1
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
Number of repetitions :
38
Begin Position :
10998
End Position :
13699
10998
CGCGATCGCTCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
TCGTCTATACCTTTGTGTTATGTCTATGCGAGTAAA
11070
11071
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
GTTATGCGCTGATTCTGCGTGGTTCACGGATAGTTAC
11144
11145
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
AGAAGGCGAATATAGTGCATACCGAGATCCTGGCTAT
11218
11219
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
GACAAACTCAGTCTCAAGCTGATCAGATGATATT
11289
11290
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
CCTCAGTGTATGCAGCAATCATCTGTTGTTTGAC
11360
11361
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
AATTAGAGGTTAAGTATGAAACTTGTACTCTTG
11430
11431
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
CAGTATCAGCAAGTATTTCTGCCCTCTGTAAGTC
11501
11502
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
GCTCGCGCACCTAGCCCAATTGCTTGCTGATAGG
11572
11573
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
TGAGGAGAGATTACTTGCAGCGCACGCCGACTTGTT
11645
11646
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
TCCATAACTGTGATGCCCGGTGGGATTATGCACCAC
11718
11719
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
CAGTATCAGCAAGTATTTCTGCCCTCTGTAAGTC
11789
11790
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
TAAGCTCATTCCAGGTGATTTGCCCTTGAGCT
11858
11859
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
CTCGTGAGTTTCTTCATGCTTTAAAACAATCTCTC
11930
11931
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
TTGGCAGCGATGAAGAATCATACGTGTCACAATAT
12002
12003
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
TTTTCATCGTTCTCATCAAGCTTATTAGTTTG
12071
12072
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
TCCCCCTTAAGTATTATCACATGGTTAACCTAGTATGTC
12147
12148
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
CAGTCAAGGCTCAAGGCATCGATAAAAGCAGCCCT
12219
12220
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
ATGGGGGCAACTGTAGCGGCTAGAGCTAGCATTAA
12291
12292
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
TACATTCTCCCAGTAGCGATCGCCAGTAGCAAGGTC
12364
12365
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
ACCAATAAGGTGTCCATCAAGAATATCTTTCTCTTG
12437
12438
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
CCCGCTATAGCCATCTTTGGGGTTGCCGATCAGCTTG
12511
12512
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
TAGACTTCATCCTCTTGAGTACCGTTCAGTCTTGCCA
12585
12586
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
AACGATATTGATAAAGTACGATGCCTCTATAAA
12655
12656
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
AAATCATGGTTGATAATCTGCAAAGCATAAGCT
12725
12726
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
AAAACTAGGTAGTTCAGTTTCCACTACCCACCACA
12797
12798
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
AAAGCAGGGGAAAACGGCGCAAAGGGTAGCTTT
12867
12868
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
CTACCAAAGTAAGGTGTATACTCACTATAGCATTCG
12940
12941
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
CGAAAGCAGTAGAAAAACCCTACATTTAATAGGTTATA
13015
13016
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
TATGATAGCTAGCTAGTATCTTTATAAATAAATT
13086
13087
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
ATACTTGGATAGAAGCAATTAGAAATATGAATACT
13158
13159
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
AAGCAATACTTTTGCTACTTCTTCGCAGAATTTTTC
13231
13232
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
GTACAGCCTGGGCGATCGCATTAGGATCTCCAGC
13302
13303
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
CAAGAACAAGTCGATGCAGAACTAGCCGCATATGCC
13375
13376
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
GGTAGTCAAATAAATCCGGTCTACATCATCCCAA
13446
13447
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
TAGGGGAGTTTATAAATATTGCAAACCCACTAT
13516
13517
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
CGCACCACCAAAGGCACAACCAGAACCAAAGCCACAAA
13591
13592
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
ACACGGCGATTGCTCTCAGCATCACCACTGCCGT
13662
13663
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT
13699
Left flanking sequence : Till position 10998 (length
bp)
TGGGGTTTAATTCCCTCACTCACTACATACGACAGTCAAGATGTTTGATGCACTATCCGTTTTTTAGCGC
GATCGCACTTATCAGGATAAACACACGAAG
Right flanking sequence : From position 13699 (length
bp)
CGCGGCAGGCTGAAAGCTAATCTGTATTTGATTTTCAAGGTTCAGTTGCGCGGATGGGTTGATTATAACA
CGCGAAAATGTCAGTCGATTTACATGAAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp