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CRISPRs details
NC_019677_2
Flanking alignement tool
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NC_019677_2                                                                                                                 
top
Strain :
Nostoc sp. PCC 7524
RefSeq :
NC_019677 (plasmid pNOS7524.01 )
CRISPR id :
NC_019677_2
DR consensus (36 bp) :
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
Number of repetitions :
63
Begin Position :
27800
End Position :
32404
27800
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
AAAATACCTTCAGGTCGATAAGGTAAAAACGATGATT
27872
27873
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
AGATAACTTACAAGAGAATTCTTGGACAATAGAAGA
27944
27945
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTTCCTATCAACAGGATTTTACCTTGATGGATTTCAA
28017
28018
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
CTGCTTCTCCAGTCAGGAGGTTTTTAGCAGCCATTGC
28090
28091
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTTACAATGTTATCCCTGACTCCTTTATCTAACTG
28161
28162
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
CAAATATCCCTAGATGTTGCCGAGTGGTTAGCCAA
28232
28233
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TCCTTAAGTCTGTATAAGGTTCATTGCCATATACAA
28304
28305
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
GAAAGAGAGTTAAGTAGATGGCTATGCAACTAACA
28375
28376
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
CTGATGTTTGCGCGTAAATTTGATTTAGTGTTGTCAA
28448
28449
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
GTTAATCAAATCAAAGTGATAGGCGATCGCATATTTTT
28522
28523
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
CATCCTGTCAGCATCTTGGAAGGTTGGATCATTGAGCAAA
28598
28599
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
AGTTCAATTACAGTATGTGTTCCAGCAGGATTTAAAA
28671
28672
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TCAGGGAAAGTAATCTCGGTTGTTACAGGATCAAAT
28743
28744
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTTGTTCCTCGTGCGGGTAGTAATGAATGCGTTCACGC
28817
28818
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
ATGAATACCCTTCTTCCTTATTACCATCAATAAATTCTTT
28893
28894
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
GCAGTTACTCGCATATCTTTTATCTTAGAGGTGCGAT
28966
28967
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
CTAGAATCGCCAACCAAAGCCGCTAAACGTTGGCGA
29038
29039
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
GTTACTTCTAGAAATAAGTCGCTCATGCAAACTTTGC
29111
29112
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTAACTGCATTTGCTCAACTTTTTGATCATCGG
29180
29181
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
AAAATGAGGGGTAAAAGTATGGATAGAGCAATTCACCCCGAC
29258
29259
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TCCAAAATAATTGTTTCACTTTTGTGCTGCACGCCGTACAC
29335
29336
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TCAATCTTGTCTAGCTGTGCCTGGAGGTTGCCTAGAGC
29409
29410
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TCTATCATTCCATAAACTCCTCAAGGATAGTTAAGATA
29483
29484
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
GGTTTCAAGGGTATCCCATCTTTACTAAAGGTATACCCG
29558
29559
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
ATTCAGAACTAAGACCGGGGGCTTTGTTTGCCATAC
29630
29631
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TAGCTCAAGGCTGCTACCGTCTAGCTCATCACGATCG
29703
29704
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
CTCCTGGCACTACTCCTTATGATGTGTGGCAGCAG
29774
29775
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
GCAAATGGGCGCAAAGAGCCTATCCTAATAGCCCC
29845
29846
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
ATTGATGTTTTCATTGTTTTTTCTCTAATTTGATTTTGATAA
29923
29924
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
ATCATAAATATCCATAGAGCTTTCTCCTTTTAAAAT
29995
29996
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTATTAGAAATAAATGAATAAGTAATGGTTAATTCAG
30068
30069
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
AACAAAACAACCATAAAAAGAATTAAAGTAACATACTGAG
30144
30145
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
GCCGTTACCCAATCATCAACAGTTGCTTTAACGATAT
30217
30218
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTCAGTATTAATGAAGAAAGGAATTTCTAATTGTTCT
30290
30291
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
AATGTCACTAGATAGCCACTGTTTTACCTCTCTTTCTG
30364
30365
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTAGAGTTTGTCATTGACGGAATGCAATACGGGG
30434
30435
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTGACCGGAAAACATGGGATTACCGTCGCCTAGAAA
30506
30507
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
CTCAAAGGAAAAAACCTATGAGCTATAAGATACAGAGC
30580
30581
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTTACTATTCTCCTGAGATTAAAGGTTATCGCTGGCC
30653
30654
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
GTACAGAGGATACACGCACCACGGGAGAAGGACTTTA
30726
30727
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
AGAATCTGTGATACTAGAATCTATCTACCAGTGTTAC
30799
30800
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
ACATCGGCTGATTCTTTTTGTCGAATCGAGTGTATA
30871
30872
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
CAAATCACTAACAAATTCACCCTGGTCAATAAGTTCTA
30945
30946
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
CGTTCTCTCAGTGCCGCTAACCAAATGGTTAACTCT
31017
31018
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
AGGGGCTATTCTGTTTCTCGGATCAAGCAGCACTACA
31090
31091
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TCTCTACTTAAAACCTCCATCTTTATTTTTTCTACC
31162
31163
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
CGACAAAGATTTGAACTTTTAGCATATAATTCCT
31232
31233
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TGGTATTAAGTTTTCAAGGTTTAGATCGCGAGTACAAATC
31308
31309
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TAGATGGTTATCTAAGGCATCAATAATGGCATCAT
31379
31380
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
CCATAACATTTGTTTTGCGCCCCTTGAACTTGTTGATAAA
31455
31456
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
ATCGCATTAATAACTAACATACAAAAACTCATGCAAAGCTG
31532
31533
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TGGAGGAAGGGCGATCGCATCATCCTAAGCTTCATCCAG
31607
31608
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TCATCAACTAAAGTGTCGGGAACATACCACGAACCAA
31680
31681
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
ACTGGTTGCCTTGCTCGTCTCGTCCGTTATCGTCAAT
31753
31754
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTTCTTCAGTGAAGTTAAACATGACAAACTCCTAGATTAGA
31830
31831
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
ATGTTGGGAGATAGACTACAACTTTCCTATGCTTAACTTAA
31907
31908
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTTATCATGCCCTGTAGCACAAGCCAGAAGCATTTTATG
31982
31983
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
CAATGACCAGGTGGCTTTGGGTCATGCCATCATCCTT
32055
32056
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTTTACTTAGATCAGCTAGGAGAGTTCTCTGCCTAGCTG
32130
32131
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTTTGACGTTCTAACAATTCTACTTTTGTTACTTGTTT
32204
32205
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
AACCATGCGGTGGTGCTGATACTTCGCCCAAAAGTGGC
32278
32279
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
TTGAATGACGGAGATTCGTGTTCCCGCTCAATGATTTGGCGCACAAATTTAGCT
32368
32369
ATTCCCACTCGCTGGGGATATTAATTGAATGGAAAC
32404
Left flanking sequence : Till position 27800 (length
bp)
GTTTTAAATGGTTGCTTTGTGGGCTGTTTGGCGGTGGTTTTTCCTGACCTTCGGAAACCGTCTCTGGATT
TCTTACGGAGTAATGATTTAAAATCTAGGG
Right flanking sequence : From position 32404 (length
bp)
GCTTTTAGATATGACTCCTAAAAAGGAGTATATACTTTTGAAGTATAAAAACATACTTACAAAATCAAAG
AAATACACATGAACTATCACAGATGAACAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp