Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_019678_24                                                                                                                 top


Strain : Rivularia sp. PCC 7116 RefSeq :NC_019678 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019678_24
DR consensus (36 bp) : CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACNumber of repetitions :101
Begin Position : 6181145 End Position : 6188351

6181145CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTGGGGGAAGTTTGCATATTAACTCGTTACCT 6181212
6181213CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTTTACCAATGAAGTTTCCAGTGATAGCAATTATGTTA 6181286
6181287CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTCATCGTCTCCACCAGTTTCACGTATAACAGAACTTT 6181360
6181361CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGCTAAGCATGGCACTTAGCCTATAAACTGCTTGATC 6181432
6181433CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTGGTTAGACATTTTAGCAATCCTTTAAAAATAA 6181502
6181503CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGTGTAGTTCGGTAAAAACCTAAAGGTTCTTCACGGTG 6181575
6181576CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTCTACGAGCAAGCGGTTTGCTGTTGGGGTAGGCA 6181645
6181646CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTGCGGGTGTCAACGGTTTCACCACGGACACCATG 6181715
6181716CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTACTTGCTGGTTTAAACAATAAGCTAAGACAA 6181784
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6181858CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACATTTTTTAGAAACGCAAAAAATTACTTCCTAAAAGC 6181929
6181930CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTTTAGGTTATTTTTGTAATAAACCATAGTAGATCTAG 6182003
6182004CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTGAAGTAAGTCACAAACTAACAACAAATCGTT 6182071
6182072CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAATTACTTCTCCACAAGCAAGGGCTTGAGAAGGTTGA 6182144
6182145CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTCTGTGATATTCTCTTCTTTCTCTAACCACTTTTA 6182215
6182216CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAAATGTGCTTTAAATGCAGTTTCAAGCGATTCAAAAGCAT 6182291
6182292CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACATTAATTGCTTTTAATTTCACTTGTTGTTTCCTTT 6182362
6182363CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCTTGAAGAGAAAGAATAGTTTTTTCTTTTTGTTCAGCTT 6182437
6182438CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGTTTGGGCGAGTAAGTGAAACTTTTTTTCCCGCAA 6182508
6182509CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACATAAGCTAAGACAATAATTGCGCCTTCGTGTCCCCC 6182580
6182581CCCCAGCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTATAAACTGTGTTTTCGTTAAAACCCCCAACAGCA 6182651
6182652CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAAAAACAGTGTCAGCATTGACTCTACCAGCTTTC 6182721
6182722CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTTACATCTTGAATTATTTTCTTTATTCCTAAT 6182790
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6182859CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTCCATGGTGATGATACCATTACAAGCACGGGCAACA 6182931
6182932CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTAACAAGGGATTATGCGATTCAGATCGTAAAAAAAATA 6183005
6183006CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCTGGAACTTTGCGTCCACAGATTAGACCTAGTTC 6183075
6183076CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCATACATTGTTGCCCGTGCTTGTAATGGTATCATC 6183146
6183147CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGGAAACCCAAATTCCTGCTCACCAAGGGGGGCATGA 6183218
6183219CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTTCAAATGACCGAATACGAACAACTTTTGCAGGTGAA 6183292
6183293CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCATTCCATTACTGGATTAGCGACAGCAGGGTTCAC 6183363
6183364CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCATAGATACGGCATTAAGAGCTATAATTCTT 6183430
6183431CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGATAGAGCAATAAACCCTAAAGCAACACTGACTAT 6183501
6183502CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTATATATTTTGTAGCGGTTTTAAATTCTGAAG 6183570
6183571CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTGGCTACATAACTTTGATTTTCTTCTATGTATTCTT 6183643
6183644CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGTTAGTAAATTACTTTACAAGAAAAATCTTGTAATTG 6183716
6183717CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTCTACTTTGTTAGCGAAACCTGTTGCAAACCTAGCAA 6183789
6183790CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTTTTCACCAAGCTCTGTTTTCAAAACTTGTTGAACTTTA 6183865
6183866CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAATGATATGTATCCCAATTGAAGCACGTTTTATTAT 6183937
6183938CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTTAAAATATTCACTATGTAAAAAGAAATAAACCTAT 6184010
6184011CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCACCATTATTTGTTTGAGTGGTAGGGGGATGA 6184078
6184079CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGCTAGGGCCCGGCTGGGGAGAGGGCTCCCTATTAG 6184149
6184150CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTATTACCTTCATGCTTGGAAAAAATTCTAGACAC 6184220
6184221CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACACTAACCCACACAATGAGGCTGAATGAATTTTTT 6184290
6184291CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAGCTGTAGCAATCTTTAAGTAAATCTTAGAAAA 6184359
6184360CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCATCGGAAACATCTTTATTACCTTCATGCTTGGAAAAA 6184433
6184434CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAAGCTTCCAAGAGCGATTTTGAGACTTGCCAGATGCAA 6184507
6184508CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTCGACTGAAAGCGATTGGGCGAAATTTTTTGCTA 6184577
6184578CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCTGAATGGCATGATGGTAGTTACTTTTGTCAATT 6184647
6184648CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTGTAACAGATCCAAGAGCAGCAAAACAGGCACCAGCAA 6184721
6184722CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTTAAAAATTAAAATATTACTTAAAATAATTTT 6184790
6184791CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGATTGGCATCGCACTTGCAATTTTCTCCGTATAGCCTA 6184864
6184865CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGATATATAACTCCCACGTTCAGATGAACGTCTCT 6184934
6184935CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTTGGTTAAAAGAGTCGAAATAAACAAATATTACGTTT 6185008
6185009CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTGGCTATAACTATGGTGGTAAGCCACAGGCAATACGCG 6185082
6185083CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACATTTTTCTCCACAAAATTATAGAAAGAAAAAAT 6185151
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6185225CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAGTAAGTCCACCAATCTCAAAAACTGTAGTTCCATTT 6185297
6185298CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAAATATCTCCTAATTTGAGAAATTTCGGTTGCGGTT 6185369
6185370CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTTAATCATTCGACTACTCATTCTAACCCGAACAAAA 6185442
6185443CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAAACTTTACTAGATTGTGGCATAATTTTACCTACCT 6185514
6185515CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAACTAGGAGAAAAACTTGTTTCAGCAACTAAAA 6185583
6185584CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTAGCTATTGCGGATTGCAGCAGATAACTTGATAACT 6185655
6185656CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTAAAGAAGTTGTGTAGCTTGCCCGTATATCAA 6185724
6185725CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAATTATACTAGCTTCTGAACTACCAGACATTTCA 6185794
6185795CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAACTTGATTAACGTCAAATTTGTTAAGAGTTTCTTCAATCC 6185871
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6186087CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGTTAGTGGTTTTTTGCGAACCTGCAAATCCG 6186153
6186154CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAATGCTGCAACTAACGTTAAAACCACAAATACCAAAAAATA 6186230
6186231CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGTTCTTCCTCCATCTCGCACTTAGAAGGGTGTG 6186299
6186300CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCATCTAAATAAGAATAATACAACTACCACATCTCGCA 6186372
6186373CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGATTGATCTTCATAGTCAAAATTTTCTTCTTTC 6186441
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6186516CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTCTCACTTCTTGCAATCTTTCAACTGCTTGATTAT 6186586
6186587CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAATTCATATCAGTAATCGTTTGATTTCTGATATAT 6186657
6186658CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTTCCAATGCTAGAGTTACCAGAATTATTAAGTTCGGATT 6186733
6186734CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAAGAAGGGAAACCATGGTTTCCATGTATTTAGCGGAATA 6186808
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6187025CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACGATTGGTTAGTCAATGCACACAACTTAATGAATGCAAT 6187098
6187099CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACATTCAGATGAATCTACGACTGTGCTTCCTTGAC 6187167
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6187237CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACACGTATTCTCGGAAATATAGTGACGACCTGCTAAA 6187307
6187308CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCTATGATGAGGAAGATCCACAAAGGATAATCTC 6187376
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6187450CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCCTTTATCTCATTTGCAAGAAAATTCTGAACATTTGGA 6187523
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6187737CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTCTCAACTCTTGCAAGCCTTTCATCAAGCTCTTTT 6187807
6187808CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTTTTTGATGGTTGAACACTTTTTAGGAACTTCATATTTATA 6187884
6187885CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCGTATTCATCAGATACAATGTTAAAATTATCAAGA 6187955
6187956CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCTTGAGCTTGCGTGTGATCGTTTCCCATCTTCAGT 6188026
6188027CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACTCTGCGGGTGCAGCTGCAAAAAATGTGCCTAAAATCAG 6188100
6188101CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACATTGTATGTTCATTAGAAACTTTCACGTCTCTGT 6188170
6188171CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACAGAATTTGATCATGTCTAACCAAAAGAATGTATTCATC 6188244
6188245CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAACCTACCCAGTAAGGATAAATGCCAACGTTCTTCATC 6188315
6188316CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC6188351
Left flanking sequence : Till position 6181145 (length bp)
CGGTGTTTTGCTTGATTTTCGGGCTCATATATAATGTTTTTCAGAGATGCGTCGATTTGGCTCCTGTAAC
CCTTACTGGGTAAGGGCTGCTGAGCGAACT
Right flanking sequence : From position 6188351 (length bp)
CTTCGTAATCAGGTTCTGTCACTATACCCAAAAGCTGTCAGCCCCTGGAAGCATAACCAAGTAATTTAAG
GGCTGAAACCCTTATTGTTGCGTTAATCGA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp