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CRISPRs details
NC_019678_31
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_019678_31                                                                                                                 
top
Strain :
Rivularia sp. PCC 7116
RefSeq :
NC_019678 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019678_31
DR consensus (37 bp) :
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
23
Begin Position :
6751356
End Position :
6752970
6751356
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATAACGAGGCAGAACAAGCAAGAAAGCAATTAAAAA
6751428
6751429
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTGAATTGTAGTGTTGTAATGTTGTATGTAAAT
6751499
6751500
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AATCGGGCAATGGCAAATGATTCACAACAATGGG
6751570
6751571
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ACCTTTAAGAACAGTGAAGTTGCTAAGGACTTGTTTAG
6751645
6751646
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TATGGTACGCTCTTTTTCTTGCTTGGGATTAATAG
6751717
6751718
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTAATCTATTTTCTATCTTGCCGCTAGAATGATTAAAA
6751792
6751793
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TAATTATCGCGTTAAGGTTAAGGAATTGTTTACAA
6751864
6751865
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TATTTAGGATGCTTTACCACGGCATCCTTTTTG
6751934
6751935
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AAGGAAGAGAGTATAGATACAGTTTGCAATCAG
6752004
6752005
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AACAAGCCTCAAACCTAGTGATAGCAGTCAATTGT
6752076
6752077
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CTTATCCTACAAACATGACTACATTTTCTTCTGCTC
6752149
6752150
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CTATTATGGGAAGGGGGAGGATTTCTATTATCTC
6752220
6752221
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AATTACATCCTGTATTTGCTCTTTCTTTGAATTA
6752291
6752292
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATCAGTCTTTAATTAGATATAATCATTTAAAACAA
6752363
6752364
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATATTCTTGCTGCAATTTCAGGATGCACTGTAT
6752433
6752434
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTCAATCGCCTTAAAGGAGTCTTTAAACGCTTTA
6752504
6752505
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTTAACTTCTAGAGAAGCTTTCTCAGATTCTC
6752574
6752575
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GATGATTTTAGACATTTGAATAGTTTGAAGAATA
6752645
6752646
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GGTACTTTGAAAGTTTGTGAGGAGAATGAAATACT
6752717
6752718
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GCATCAACCAACTTTCCTTACTGCCATTAGCTGAT
6752789
6752790
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTATAAGAATTTGTGTAAGCATTATGGAAAAGTAG
6752861
6752862
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CATAACCTCTCAAGATAAACCTCTGAGGAGAAAAA
6752933
6752934
GTTGAAACTCACCTTAATCCCTATTAGGAATTAAAAC
6752970
Left flanking sequence : Till position 6751356 (length
bp)
ATTTACCCCCTTCTCAATCTCAATTTTTCATGCTAATATTTACCCATCCGTGAAATTGAACCATGAAAAC
CTTATAGTAAAAGGGCTTCAGAACCCAGCA
Right flanking sequence : From position 6752970 (length
bp)
TATTGCTTGCACGCAGCTAATTAATCGCTTGAATAGGGAGCTAAAGCTAGGTTTTTGTTGCTATCAAGTA
GAACGCGATCGCAGAGTTTAAGCAGTTCTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp