Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_019678_4                                                                                                                 top


Strain : Rivularia sp. PCC 7116 RefSeq :NC_019678 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019678_4
DR consensus (37 bp) : GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACNumber of repetitions :57
Begin Position : 286960 End Position : 291024

286960GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTGGGAGAAAGTAAGAAAGCACGGTAAAGCGACCCGC 287032
287033GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTGCTACCTGCATCTTTATTATCGGGCTTTAT 287101
287102GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTAGATAGGTAGTACCTACTGCTAAAGCTTGCCAA 287173
287174GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTATTAATCTGAATAACCTTCCTTGAAGTGTTGAG 287245
287246GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTATCTGGACCTTTTTGCCTGGAATACTCATACTCAAA 287320
287321GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTGAGTATATCTGACTCAAAAAGGGCAGATTCAAGAA 287393
287394GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAAAAAAAGACTATAAATCCTCAAATAAGTTGAGTT 287465
287466GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTATATCTACAACTTTTTTCTTCTCTTTCTATGAAAAT 287540
287541GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTAACAACTCTAAATACATCATACATTGTCTCA 287610
287611GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAAATATATGAATCACAACAAACACAAAAAAGGAAA 287682
287683GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACATCCTATTGATTTACATGTAAATAATGATAGGAAAA 287755
287756GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTCTAACAGATCTTTTTCGTAAATATTCCAAT 287824
287825GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAGATTCCATCCCCGCTTCGATAGCGCTCCAGTTT 287895
287896GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAATCATGGATTAAATTATTTAATTGGCGCATACAA 287967
287968GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAAAATAAAAATATGAAAAAGAACAAGAAAAATCA 288038
288039GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACGCAAAATATATTTCTGGAAGATTTGCTTCGGAAATT 288111
288112GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTAGCAGATAAAAATAGTACACAAGCAGAAAAAA 288182
288183GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCAAGCTTTTTACCGTTTGTAACACCACTAGAACC 288253
288254GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTGAGAAACACGATGCATTCTGCTTGAATAAAAAGA 288325
288326GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACATCCGCCAGTAATTTTACATTTATCTGCCAGTGAT 288397
288398GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAAAGAATTTAGCACTACGGCTGCACCTGCTGAAT 288468
288469GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTACTTTACCTTTCTTTAAAAGCCATTCCCACATCAAT 288542
288543GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTGGAAAATACTAGAATCATAGGCTTCAAACAAATT 288615
288616GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTCAATCTTGAAATCTTCTAAGCCTGAGCCTATGA 288687
288688GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCAACATCTAAGGAATCCGTACAGCTTTGACTAC 288757
288758GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTGAAGCCTTATAGAAGCTTTTAATTGCAAGTTT 288828
288829GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTATTGAGATTAATGAAACTTGGGAAAATAACCT 288899
288900GTTGAAATCAACTTCAATCCCTATCAGGGATTGAAACAAATTGCATATTTTAGCCTAGACTGAGATGTAATA 288971
288972GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCGTGACAATGAATCTCCACTTCTTTGCCCCTATC 289042
289043GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACGTTTAGATAATTTACATTAATCTTTGCACGAACTAAT 289116
289117GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTGATTCAACTCTTGAGAAAACATTTGTCTATCTA 289187
289188GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTTCCTGAAAAAATGCAGGGAATAATCCACAGTT 289258
289259GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCCCCGAAAAAACCAAGCCCAGCAACTCTGATTGA 289329
289330GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTAAATTTACAGCACATCAACTAAGACATACTTTTG 289402
289403GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTATGCCTGGAAGGAAATCAGGAAAGATCCAGAT 289473
289474GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAATTGTCCTTTGGGACGATAAACTCTTAATGTTGCAA 289547
289548GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTAATAGGAACTGCTGTTATTGGTGGAGTAACTACT 289620
289621GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCCTCCTTTTGTGTATATCTTTGCAATCTTCAGATT 289692
289693GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACATTGTTGCTAAATGTATTTATAAAATCAACAGAA 289763
289764GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTATAGTAAAAATAATTGTAGATGGAGTACCAAAA 289835
289836GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAATATGGTAAAGTGTATGTCCAATGGGATAGGATACTT 289907
289908GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAATGCTTTGCGAAATGCTAAACATTAACTTATATG 289979
289980GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTAAAAGATTAATATTACAATCTTCAAAAATTGATA 290051
290052GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTTGTGACAGCCCTACCGATATGACCTTATACAA 290122
290123GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTTATGCTCCTGAAGGCGTGTTGTTTGTGGATGA 290193
290194GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACATCAAAAAGATACGGGAACTTACAGAAAACAAATC 290265
290266GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACGCTAGCCTCAGCGTAAAACACCTTAATATCCTCG 290336
290337GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAAAATAATTAAGAAACAAAAATAATCCATAAAAAAT 290409
290410GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTACAAGCCAATGCCCATGAGATTCTTCAAAGA 290479
290480GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTAAGCAAATTCTAAAAGATAAATTTGATTTTTAT 290550
290551GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAATACTAAGTTTGCTATGGCATCTTGCCTTATCAG 290622
290623GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTCTGTAAGGACAGATTTATTACCTTTGCAAGATAA 290694
290695GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTAAAACATAATAAGCGCCACCTTCGTATACCTGCCCTTTTTGGGAGA 290772
290773GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTATCAAAAATATTTCATTTGAAGAACCTTTCAAA 290843
290844GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACGAATAGATTCAACATATAATCCATCCAAAACTTT 290914
290915GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAGATAAGTCTTTTCGATAACATTTTTTCTTACTAAA 290987
290988GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAT291024
Left flanking sequence : Till position 286960 (length bp)
ATTCCGACCCTTCTCATTTCAACTTTCACGTGCTATGATTAACCCATCCGTGAAACCGAACCTTGAAAAC
CTCATATTGAAAGGCTTTCAGATGCCCACA
Right flanking sequence : From position 291024 (length bp)
AATATCATTTTTTAAACTCTTTTCTAGTACTTCACCACATTAAATATCAGGAGAGATTAATTGGTAGGTA
GTTGGACTATCTTCCCTATCCTATCTACAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp