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CRISPRs details
NC_019682_14
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_019682_14                                                                                                                 
top
Strain :
Calothrix sp. PCC 7507
RefSeq :
NC_019682 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019682_14
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
Number of repetitions :
18
Begin Position :
3375025
End Position :
3376306
3375025
TTTTCAATCCTTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
CTGAATTTGAAAAGTCTCTCAAAGAAGATGAGGGATCTA
3375100
3375101
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
AATAATTGGCAAAGCCTCATCTTTGACGGGCAA
3375170
3375171
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
TTTTACTGAAGAGGCTGAACGTGGCTTCACTGATGTG
3375244
3375245
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
TCGCATGTGATCTCCAAGCTCTTTTTCACTGGCTA
3375316
3375317
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
ATATACTCGTATGCTTCTTCTCTGCTTTCGTACTTGGCT
3375392
3375393
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
AAGTTTCACGGTTTATTTTGCGGGTTGATATGGA
3375463
3375464
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
TTAGCTAATCTGTCCCTTGATTTCTCTGAGGAAGAA
3375536
3375537
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
TTGGCATCAACTTAGTTTGTTGAGTGCAAAATCTT
3375608
3375609
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
ACGGCAGCATCAAAAGCGATCGCCAAAATGAAGGGCAAGGCTG
3375688
3375689
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
TCAAGCGAATAACATTACCATTGTGTTTGTCAAAT
3375760
3375761
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
AAGGTGTTGATCCTATCTCTATATAATCTGTAAAT
3375832
3375833
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
GCTGTCCATTGCCATTAGTTAAGCAATATGCTGC
3375903
3375904
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
AAGATTTACAGTCTGTGGGCGATCGCCCGGAAAA
3375974
3375975
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
CTTGCCTTTTTCTATTTTTAGAGGAGGGGTAGCGATTT
3376049
3376050
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
CCAAGGTCTGACAGGAAATTAAAAAGATTGCCAA
3376120
3376121
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
CTGGCTTCTGTACACAGCAGCAAGTCATTGTCTAC
3376192
3376193
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
GGTGCTGCTATACTTGGTTGGTAAGCAGGTAGTCCGTAGT
3376269
3376270
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC
3376306
Left flanking sequence : Till position 3375025 (length
bp)
TCCTCGGTTGTTGTTGTCTGGTCTATGAGGATTTTGCGAGCTGTTTCGTAATTCATTCACCCAGCTTACC
TTAAATTGTGCATCAGTAGTAATACTGAGG
Right flanking sequence : From position 3376306 (length
bp)
GCCCGCATCCAGAAGGCTTGATGTATTTGGTTTTCAAGGTTCAATGGTGTCAACCTAGGAATAAGGTAGC
TTTTCAGGTGCTGGTTTGTCAAGATAGGAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp