CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_019682_24
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_019682_24                                                                                                                 
top
Strain :
Calothrix sp. PCC 7507
RefSeq :
NC_019682 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019682_24
DR consensus (37 bp) :
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
47
Begin Position :
5067421
End Position :
5070798
5067421
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTCTTATCAAGATGCCGCGATCGCGGCATTAA
5067489
5067490
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAGGTAGATTAGCGGAGTTTACCAAAGATATTAA
5067560
5067561
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TCAAAAAAAGGAATCACGATGAAAATTTTAATTTACTCTATG
5067639
5067640
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATCAGTATCGTTACTATCATAATGGGTCGGATCA
5067710
5067711
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GCCCGTAAACACCTTATCTTCAATATCTAAAAACCTT
5067784
5067785
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GAAAGTGTATTCCATAACTGGATTTGTTGATCGA
5067855
5067856
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTGCTGACTTTGAGATCATAGAATAGCGTGTCCTT
5067927
5067928
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TCTTTTTCTCTTTGAATTTCTTCAATTAACTCTTTA
5068000
5068001
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TGAAAAGTAGTATAGGCATAAGCAATGCTATGGC
5068071
5068072
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAGAATTCCAAGCCAAGAAAAAAAAGTCAATCCT
5068142
5068143
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AATCCTAGTGCCGGATTGTATTCCCCAGACAGCGGCAG
5068217
5068218
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GCGTGGTGGACTCCCAGTGGAATACCTGGAAGACATGATTC
5068295
5068296
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TCTTGGCAGAAAAAATAGAAATTTTAAACTGCTGA
5068367
5068368
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CGGTGGTGGCGGTGGAATGCGACCCGAAAAAACTC
5068439
5068440
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TCCAATGTATGCCAACAAAATCACTAACGAAG
5068508
5068509
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TAGAAAATAAAAAGAACCTTCGTCTATAGTACTTC
5068580
5068581
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GTAGTAACTGATAAGCAGCCAGGAGGTATATTGAGT
5068653
5068654
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATCCACAGCAGGTATATCTTAATCCCACCTCAG
5068723
5068724
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGAGCCGTTGGTTGAGGTGTAACTACCACTGCTTG
5068795
5068796
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CCTGCTCTATTTGCGGGTAAAAAAGATGGTGAAGGAGCAAA
5068873
5068874
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGAAACTTTATCTTCACCAGATAAAAAATAAACAT
5068945
5068946
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CACGTATTCATACCCATGTTGGGTGATGTTTCCCAA
5069018
5069019
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ACACTCGTTCCTGCGGATATTACTGGATTAATCAC
5069090
5069091
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTTTGAAGCCAACGACCGTGACGACTTCACCACCG
5069162
5069163
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GGTGGTTGACAGTGGCTCGTTGTTTTCTGTCCCAAT
5069235
5069236
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ACTTCTCTTTCATCTCGGCCACCTAGCGCTTTCCG
5069307
5069308
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTTCGGCATAAGAGGTAATGGCTCTGTCACGCTCG
5069379
5069380
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATCCTTATCGGATATATAATCTTCAGGATTTATA
5069450
5069451
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATCTATCAGGATATTTTTTACTTCTTCAACACT
5069520
5069521
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GAAATAGGTTTGCTTCCCCCAGAACTTTACTCAG
5069591
5069592
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTCCTTATGGATTTGGTAAGCCTTTTGCTTTCCC
5069662
5069663
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATACTTTGCCTTGATACTTTCGCCGTCGCTCCAAACTC
5069737
5069738
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TAGGCGATACCTTGAGCGATCCTAGGGCTTGGGGGTATATTGA
5069817
5069818
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AACACAGCAACTAGACGAGCAAACAGCATCCCTA
5069888
5069889
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TGGAGAAATAGGCTTGACAGACTGAGACGGCACCT
5069960
5069961
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATGGCGTTTATCGTCGGTTCAGGAGAATATTTTTA
5070032
5070033
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTTGTAGCGCTGGCATTCATCGACTACGAGCATG
5070103
5070104
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TCCGTACTCATAATCATCTCGGAAAATTTCCCGTT
5070175
5070176
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAAAAATCTTAGAGAAACTAGGCATCCTCGACTTAG
5070248
5070249
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CCATCTGATTTAATCCCAGCAAGCTAGCTATCCGATTG
5070323
5070324
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TAGCTACGGGCGTGAAGAAGAACCGCAGATTAATT
5070395
5070396
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTATTGGGATTCTCACGTTTTTGAATAAAAAAAGTA
5070468
5070469
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGCAGCCATAGTGTTCCATTACGACAATTCCTAGAAGG
5070543
5070544
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TGAGCCAGTGCCGGGGTATTGATTGTTCCTGATG
5070614
5070615
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TCAAAGTTGGGTTTTTCGCTGTAATCCCATCTCTCAAA
5070689
5070690
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GCCGGAAACGCCATCAACAATATCAGTGGGGCTGC
5070761
5070762
GTTCCAATTAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
5070798
Left flanking sequence : Till position 5067421 (length
bp)
CTTCACCTTGACAACCCAATACCTAAAAAGCTATCTTGTCTCTAGGTTGACACTATTGAACCTTGAAAAC
CAAATACATCAAGCCTTCTGGACGCAGGCG
Right flanking sequence : From position 5070798 (length
bp)
ATTTTCAAAAAATAATTCCATACGATCGCCCCGGAGTCGAGTCACGCCATATTCAATGACATTACCTATT
TGATCGACGTTTACCGACTCTGCTAACAGG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp