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CRISPRs details
NC_019682_29
Flanking alignement tool
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NC_019682_29                                                                                                                 
top
Strain :
Calothrix sp. PCC 7507
RefSeq :
NC_019682 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019682_29
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
Number of repetitions :
42
Begin Position :
6528939
End Position :
6531966
6528939
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TTAAAGCAGAGTTTCGTCATAAGGATAAATCCT
6529008
6529009
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
ATTCTGTGCAATTTGATTGTTTGGGGTGTAACTG
6529079
6529080
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
ATAGATGGTGAGTGGTTCCCGTGTGAGGGAATCATGCT
6529154
6529155
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TTGATAGCTTTTGTAGCGCGCTGTTGTCAGAAAAGTATCCT
6529232
6529233
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
ATAACTCTGGAGTCCAGGGATACGCCCTAAGATT
6529303
6529304
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
ATATTGGAGTTTGCGCGATCGCTGGATAACGGTTT
6529375
6529376
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
AGGCTTAAAACATGGCTGTCACAGCAAGGAGCAATTTAAAAA
6529454
6529455
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
AGGTGAGGTTGTATGTTGGTAAGCTGCGATATAGC
6529526
6529527
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TATATGAGATACTGACTTCATCCGCGCTACCTGAG
6529598
6529599
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
AGTCCTGCTATGAGCGTTTACGCTACGTTTTATCT
6529670
6529671
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TCTGCAAGACAGTTGAAAAACAGAGCGGCACCCACTAT
6529745
6529746
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TTATAACATTCAGTAAGTGTACTGAGTGCAACAAGTAT
6529820
6529821
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TCTTTTTCGATCCTTATCTGTGGTGTAATCTGTGT
6529892
6529893
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
ATCTAGAGAAAGAGCTTAAGGATCTAGGGTTGGAC
6529964
6529965
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
ACAAAATGACATACTGGACTGCGGCTTGAAGAT
6530034
6530035
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
AAGAACTACTCGAAGACCTTGTTTTTTGGAAAGAAA
6530107
6530108
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TCTTTGCTACAAGGTAATCACAGAAGCTTACCCC
6530178
6530179
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TATTGAAGCTGGGTACGTTGTTGCTAACAGTGTA
6530249
6530250
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
AATTTGATACTTTCTACTTCCCCCTTTAGTCGCCCCCCA
6530325
6530326
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
CAGTGAATTGAGTGTGAACAACATGCACAGTATCAAGCTCA
6530403
6530404
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TCCAAGCGGTAGTCATCGCCCTGCAAGTATTAGT
6530474
6530475
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
GCAGCTGCCACTAGCGGAGCAGTGCCAAGCGGG
6530544
6530545
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
AGTATTGCTCTCGCAGCTCATGAAAACCACCATCA
6530616
6530617
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TATCAGCCCAGCGGTGCCCAGGGCGAATATGCGGG
6530688
6530689
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TCAGTGCGTGCAGTATTGATGGCTCTTTTTTTGGTTG
6530762
6530763
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
GATTTTCCTGCTCTTTCGCCCAGCTTATCCAAGCGC
6530835
6530836
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TTAGCTTCCATTCCAGATTTATTCTGTGAATATGTTTTGCCT
6530914
6530915
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TCCCCTGCCTGCATCCCCTTCTTTTCACTACCAAAATG
6530989
6530990
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
CCGTAGCTTTGTGAGCTATCGATTTGCACTAGAA
6531060
6531061
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
CTTAAGGTATTTAAAAACATTCTGTGTACGC
6531128
6531129
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
ATGCTAATGAGTAACATGGGATATCAGTACCAAA
6531199
6531200
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TTTGCAACACATCTTTAAAGCTAGCCACAGATGACAT
6531273
6531274
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
GAGGAAGTCTGGGAGATTATGGCAAGGAAAAAA
6531343
6531344
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
AATACTCAAGGTTCAACCCAAGTCTGGTAGCAACG
6531415
6531416
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
CCCTGGCTTGCAAACTTTCTTCTTAGCAGTTGTACT
6531488
6531489
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
CTCGCAGAGCAAGGCGAAATCACAGAAGATTTTAAAG
6531562
6531563
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
CCTTCTATTAGCAGGTTAAGATTTATGATGGAA
6531632
6531633
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
CTCCTTCCAGAAAACAAGGTCTTCAAGCAGTTCTT
6531704
6531705
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
GTAATAAGATAAATTCTCTTGTCACTGCTATCTATTTA
6531779
6531780
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
ACCTGTATGTTAAATCTGTTTCTACAGCTGCCTCA
6531851
6531852
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
TAAGGACAACTTTTGCAAGCAACCTTGATGTACTTCTCCCA
6531929
6531930
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTTAAGTTAATTGCAAC
6531966
Left flanking sequence : Till position 6528939 (length
bp)
TCGCGCTAATTTCGATTTCGCTATCGGGGATGATGATTTTGTGAGAAATTTGGAGCATAATTTAATATAT
AGCGTTATTAGTGCTACCTGCTCGCTGAAA
Right flanking sequence : From position 6531966 (length
bp)
CGCCAGCATCCAGAAGGCTTGGTATATTCGGTTTTCAAGGTGCAGTTTCGTCAACCTGGACATAAGATAG
CTTTCGGGAGGTTGGGTTGTCAAGGTGTCC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp