Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_019684_1                                                                                                                 top


Strain : Nostoc sp. PCC 7524 RefSeq :NC_019684 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019684_1
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATNumber of repetitions :33
Begin Position : 996949 End Position : 999314

996949GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATTTCCGTGTGGGTTCCCGTGGAAGGAACTATCACCTTA 997022
997023GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATGCAAACATCGTATGGTGGACATCGGGATTTACGCTCA 997096
997097GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATAACATTATATACTACTAAAGTTCAGTACAGTATGA 997168
997169GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATTACCACCTTTCGTCAAGCCATCCATAATTTAAA 997238
997239GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATCTTCTTACTTCGTTTCAACTGCTGGCAATATCTC 997309
997310GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATCCTATACTCGTCTGAGATAAAACTAGCCATTAATTAA 997383
997384GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATCATTAACTTTGGGGTCAATTCGGTATTTTTCATC 997454
997455GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATAATCAGCATCTCAGCCCTCATCTGTCCACTACTG 997525
997526GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATTATTTACTGCTGTTGCTCAAGCTGCCCGTGTTTAC 997597
997598GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATTACCGCATACTACATCTGCATGAGTGCCTCTACAA 997669
997670GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATTTTACCTGATGCTGATTTGTTTGCTTCCCTAATAGGAATT 997746
997747GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATGCCATTTACGCAGCTAGGCAGAGTTTGTACAGCAA 997818
997819GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATGCCAAAGGTAAAGTAATGGTGTCTGCCATTGA 997887
997888GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATGAAAAAATCAAATTCCAGTCAAGTACCTTTCGTTAC 997960
997961GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATTGAAAAAGAGGGGAAAGGAGTGGACGATTTTATT 998031
998032GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATACCCAACCTAAGCAATTATCTCTGTTTTAGCC 998100
998101GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATAAGGGTGAGCAGTTATGCGATCGCTCAAGGGTACAAAAAT 998177
998178GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATCGAACCCAAAAACACGACGCAAGGCAGGCCAGACCCCAG 998253
998254GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATAAGCGATCGCCTGAGTGCGATCGCTCTAAATTA 998323
998324GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATTAGCCCATAAAACGGGCATATTGAGCAATTTTATT 998395
998396GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATGGAGTGTCAAAGTTGTGTAAAAGTTCAAGCTCTC 998466
998467GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATGTGAGGGAATTATTGGTAATGACAATGATTTTTT 998537
998538GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATTAGGGATTAGCTAGGGGTGACAACCATAGAAGTGAT 998610
998611GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATTGAAACCCCCGATGGGGTTGGTACTGCTGGAGGGAAAAGT 998687
998688GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATAAAATCGGAACTGTCAGAAATTGTAATAGATTCTA 998759
998760GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATAATACTAATAATATTATTAAGACTAGAAAAAATATTGCT 998835
998836GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATTTGGGGTTTTTCCCTGTCAACGGTTGAAAAATTTC 998907
998908GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATGTGTAATTCTCACGGGGTTAACAAAGGTACTAAA 998978
998979GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATGTTATCTTTTGCGGTCAAATTGTTAGCTAAAAATCTT 999052
999053GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATTTTACTGATGCAATAGGGCGATCGCTACCCACACCTA 999126
999127GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATGATCATCATCCTAATCAGATCATGGCTAAATCCCGT 999199
999200GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAATCTGAAACACCTTCTGGCTATACTTTCACACTACCCATACAA 999277
999278GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT999314
Left flanking sequence : Till position 996949 (length bp)
TAAGGGGGATTTAGGGGGATCTAAAAGTATTGGAGACACCATTAGGGACTTTTCAAATATCCTCTAAATT
GCCGATAAATTTGTCGGCGAGTTCTTCTAC
Right flanking sequence : From position 999314 (length bp)
CGCGATCGCCTGAAAGCTAATCTGTATTTGATTTTCAAGGTTCAGTTTCGCGGATGGGTAGATTATAACA
TGGTGACACATCAGTTGATTTAACAAAAAT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp