Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_019684_2                                                                                                                 top


Strain : Nostoc sp. PCC 7524 RefSeq :NC_019684 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019684_2
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATNumber of repetitions :51
Begin Position : 1073074 End Position : 1076785

1073074GTTTCAATACCTAATAGAGATTAGTTGAAATTGCAATTCTCGTCACTACTTTCTTGGATTAACAGATTAATTTCATT 1073150
1073151GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATAATACAGAACCAGAAGTGGCAGTAATGGAAATTAGC 1073223
1073224GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATATCCAGAAGTCTTAAGCCTGTTGGTACAAAGCTCTT 1073296
1073297GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATACCCATCAGGGGCAATGCTTTCTACTAAATCT 1073365
1073366GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATGATTGATGGCAGCAGTAAATTCATCGCTTATTT 1073435
1073436GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATCTTGGCTTGTCAGAGGGGCAAGTGGAAGGGCTTGC 1073507
1073508GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATTTGTATCTACGAGATTTTAATCCATTAATAATCG 1073578
1073579GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATCCGACAATAGCACCGGGTTCCCGGCTTGGTATCTTTAC 1073653
1073654GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATAATGGTGGTTGATAACGGCACCCCCCTTACTCCCGCCGCC 1073730
1073731GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATGTGAGGGCGAGGAGAGGGGGGGTTAAGGCTTTGATC 1073803
1073804GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATAGAAGCATCATCTTTTGGGCGGACACCATACTTAA 1073875
1073876GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATGCTATCACTGCCAGAAGCCCAGTCAATTGCAACTT 1073947
1073948GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATAAGGGTGAGATTCGGCACTATCTCAGAGATAAGGCT 1074020
1074021GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATGTTTGTTCTAGCTTGTTGTTTGGTTTGGTCAT 1074089
1074090GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATACCCAAGCCAGCACCAACAAATGTACCAGAAGCAGT 1074162
1074163GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATTCACCAAATAGCGATCGCCGCTTTGTCTGCTTTTAACCAACC 1074241
1074242GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATGCGTATTTGCGTAAAAGTTGACCAACACATGAGCCAT 1074315
1074316GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATGGTTATCAGTTATCAATCATCGGTCATGGCTTGAT 1074387
1074388GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATTTTTCATCTAAGACGGCGATCGCTGCATTCACTG 1074458
1074459GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATCTTACCTCTGCATCTTTCGCAAAGTCATACAAGTTTATAT 1074535
1074536GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATATTTGGGGCTGTGTCATTAAATTCGGTCGGATACCGTC 1074610
1074611GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATCCCTGCTACTTTCTCAGTAAATGGGGATTCAAA 1074680
1074681GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATGAGTGAGGAGGGGGTGGCGAGTTTCGAAGCCACCGCC 1074754
1074755GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATCCTGGATGTGCGCGATCGCACTCTCCGGAAAA 1074823
1074824GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATTCTGAGCGCAGTTGTTTAAGTTTGGCCTCCTCATGCTGTAA 1074901
1074902GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATGTTTCTGGGCAGAAGTACAAGCGCATTGCTCAG 1074971
1074972GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATACCGCATCGTCCAAGGCTCTGCCACCGCAGCCCCCGTTAA 1075048
1075049GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATTACCCAAGGTCAGCCTAGAAGTCCTGATGACACAGC 1075121
1075122GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATCCTAGAAGATCCGATGGCTCCTAATGGTCAGATCGT 1075194
1075195GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATTGGGCTTTGCGTTTAAGAAAAGATGTACGTGGTCA 1075266
1075267GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATTGCTGTTGGCCAACAAGTTTACGCGCTCCGTTGGAA 1075339
1075340GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATCACTAATCGCTAGTAGTTGAGTTTTCAAGGTACAGTACGGT 1075417
1075418GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATCTATATTAGTGAGTTAGATCAGAAATTAGTAGATAGAG 1075492
1075493GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATCAGAAATCTCCTTAAAGGAGATGTTGGCGGAGGGTGTAATCAA 1075572
1075573GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATAAAAGCCTACCGCTACCGTTTTTACCCAACTGCCGAGCAAG 1075650
1075651GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATCCCAGTCCTTACTTAATAGAGGGGGCAAAATATCCCGT 1075725
1075726GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATAAAACGCGAGAACTTATTACAGTCGCCAACATCAA 1075797
1075798GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATGATGAATCCAGACATCTCCGGGCAATTTAAAAGG 1075868
1075869GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATAATACTTGGCACAACGAGCATATTCAACTTCAGTT 1075940
1075941GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATAACACAAACAGTTCGAGCCTCTGGGCTGGCCTACAAA 1076014
1076015GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATATTACAGAGAGATAGAGGAGTTATAGAGTAATGA 1076085
1076086GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATACTAATTACTGATTCTGATGAATTAGAACAGGTATT 1076158
1076159GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATTAATTAACTACAGGCTTAGACCCGGTATTCCTGAT 1076230
1076231GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATTTTGGTGGTTTTCCAGGAGTGACACGCGATCGCGGTTAAGGA 1076309
1076310GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATTCTCCTCTCCCCTCCAGTCCTTTCCCCCCTCCAATAG 1076383
1076384GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATAGCAGCTAAAAAATTAGCCAGTGCAGGTAAGGATAT 1076456
1076457GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATAAGTATCGTTGCAGATCGTCAATTCGACTTCCCAA 1076528
1076529GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATTTTAAGGAAGTTCCTAAATTGGTGATATATCCTTCTAA 1076603
1076604GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATTCCTCACAGCCTGATTATGTCTAACTTTGTCAAT 1076674
1076675GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAATCTCACGCGCAATTAAAAGCCAGATGTGCTGGATTTCA 1076748
1076749GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTGAAATTGCAAT1076785
Left flanking sequence : Till position 1073074 (length bp)
TAGTCAGGACTTTAGTCCTGATCATCTTTTACTCCAAGCTAGCGATCGCACCAATCAATCTTTATTTATT
TTAGTAGCGCGATCGCAGCAAAACTTGACA
Right flanking sequence : From position 1076785 (length bp)
CGCCGGAGGCTGAAAGCTAGACTGTATTTGGTTTTCAAGGTTCAGTTTCGCGGATGGGTTGATTATAACA
CTAGGAAATGTCAGTTAATTTGCTAGGAAT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp