Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_019689_3                                                                                                                 top


Strain : Pleurocapsa sp. PCC 7327 RefSeq :NC_019689 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019689_3
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATNumber of repetitions :42
Begin Position : 1226682 End Position : 1229689

1226682GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTCTTCCTGCGAATCCTCCTATGATATTAAAAGATTT 1226754
1226755GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATGACCTGCCAAGTGTTTCCAAGTATTTTTCTTCGCTCTGT 1226830
1226831GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATAGGGGATTGATGAGGTACTGAGTAAGCTTAAGGA 1226901
1226902GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATATCATGATTCCGTAGGGTATGTTTGCTTAGTTTTC 1226973
1226974GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTCGCAGCCGTGGATTAAATCGGGAGATGTCCATAA 1227045
1227046GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTCGGGTGGGCCAAAGAATATTCGAGAATGGAGGCCTGCTT 1227122
1227123GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATGGGCGATTCCTGCGAGTCCTTTTGCTTCTTGGGCTTCTCG 1227199
1227200GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATCCAGGCTTGTTTGTCGTTGTACAAGTCAGGT 1227267
1227268GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATATGAAGAAATGAAACGCCTGATCAGGCAAATCGACCAAAC 1227344
1227345GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATGTACAAACGTTCGTCCGCAACGGGTTACACCTT 1227414
1227415GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATCTTTGATGAAAGCTATTCTAGTGAAACTGGAAT 1227484
1227485GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTTTTTTCGGGAAGATTTACTACGAAAATCTTCCCG 1227556
1227557GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAACCAAATCGGCTATTTGACGCTCTGATTTTTTGTCC 1227627
1227628GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTGATCTAACTAGTGCTAGAGGTGCATTGAGAACGG 1227699
1227700GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTCCCACATCCGCCTCAAGAAGGAGGTGATCGGTGA 1227771
1227772GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATATTGGAGTCGCCGATCGTTACTTTGTTTTTTTC 1227841
1227842GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTTAGGAAATATCTAAAAAAATGTCCCTCGAACGCATCCT 1227917
1227918GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTTAGGAAATATCTAAAAAAATGTCCCTCGAACGCATCCT 1227993
1227994GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATCTTACCAAGCTTTTGGCTATACGGGGGTTTGGGA 1228064
1228065GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTTATAGGTTTTATTTTTATTAAAATTCTTCCTTAA 1228136
1228137GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATCGAGACGAAAATATTCCTGTCAAAAATCAAGCC 1228206
1228207GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTCTTACACGGTAGCGTCCAACCAAGCGCGGCTTATCC 1228280
1228281GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATGGTAGGAAGATTTTCGTAGAAATCTTTCTAGCCGA 1228352
1228353GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATCGGGAGAGTTACTGGAATGGAAAAAAGCGCAGT 1228422
1228423GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATGCGAAAGCCTCTCCCAATCGGCATCCTGTCAGA 1228492
1228493GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATCTAGAAGCAAACGGGATGCCTTGGACTATAAAATTT 1228565
1228566GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATCTAGAAGCAAACGGGATGCCTTGGACTATAAAATTT 1228638
1228639GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTTGGCAGGAATCAATGTTCCCACCAGCCAAAAGG 1228709
1228710GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTCAACAGCTCGACGAACAGAAAAAAGAATTTGAGCGA 1228783
1228784GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATCGGGAAGGATGCTGAAGTGGATGAAGAAACAAG 1228853
1228854GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTTTTGGAATCCAATGCGGAGGATATTATGGAAATCTG 1228927
1228928GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATATAATGGGTGAGGCTCGTTCATGTAGAAGGGCACGAA 1229001
1229002GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATAATTCTTTTTCGACATTTCCCTTGTTTAAAAAATA 1229073
1229074GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTCTATTAGCTTAAGGTGGGTATACGAGCAATTCTC 1229145
1229146GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTACATTAGTACTATCCGAGCGCACGTAACTATTAA 1229217
1229218GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAGATAAATGGTTAGCCCGGCGATACTCGTACCCA 1229286
1229287GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATGAATCGCTAGTTACGCTTGCTCCAACGTTAATGTCA 1229359
1229360GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTGCTGAAGTTCCCAAATGGCTGCTCGATATTGAA 1229430
1229431GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATCCGTAATTAGGATGGGGAGGCGAGGGGTTTGCTT 1229501
1229502GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTTGAAAAATCATTTCAATTTCCTCAAAAATTAATA 1229573
1229574GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAATTTGGTTCCCCTTCCCCGGTTGTTGGTTAAAAGCTTTTATCCT 1229652
1229653GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT1229689
Left flanking sequence : Till position 1226682 (length bp)
GAGACGCACAACAAAATTGCTGAGATTTTAGAGCGATTGACAAAACAAGAAGAAAGATAAGCTTCGCTTA
CATGGGGAAAATATACATATATGGTTAAAG
Right flanking sequence : From position 1229689 (length bp)
ACCGATGTCCGAAAAGCTGACTATATTTAGTTTTCAAGGTACAGTTGCGCGAAACCTCTTTAAATTTAAC
ATAACCGTGACAAAAAATCCACCTGGAAAT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp