CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_019693_61
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_019693_61                                                                                                                 
top
Strain :
Oscillatoria acuminata PCC 6304
RefSeq :
NC_019693 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019693_61
DR consensus (25 bp) :
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
Number of repetitions :
24
Begin Position :
5789196
End Position :
5790985
5789196
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
CGGAATACGGGTACTTTGGCTATCAGCTCAAGGATATGGCGTTTCCAACG
5789270
5789271
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
AACAGGGAAAGATGTTCCCACCTGGCTGATCATCATGGCTAAGTTGTTTCCAACG
5789350
5789351
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
ACTACGCAACCCGCGAAGTGGTCTACAACACAAAAATGCTTTCCACCG
5789423
5789424
AGTCCGATTTTAACTAATCGGGAAA
TTGCCGCTATTGCCAAAGCGAACGGGATGGAGAAAACTGGACGGTTTCCAACG
5789501
5789502
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
TATCTGATAGTCGCATCGTTACGCCTAACAAACCTTTGCTGACTATCCTGTTTCCAACA
5789585
5789586
AGTCCGATTTTAACTAATGAGTAAG
CATTCCGTTCGACGGATTTATCCCTCCAGGTTCCCCACGTTGCCAACG
5789658
5789659
AGTCCGATTTTAACTAATCGTTAAG
AAGCTGAACAAATTGCCAAAGTCTCAATTGATGCAATGTTTCCAACA
5789730
5789731
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
CTCTCGGGAATTGATATCGACCGTGCAGCATACCAAGAGATGTCTCCAACG
5789806
5789807
AGTCCGATTTTAACTAATGGGTAAG
GGGCAAGGGTATGATGTTCTCTTGGACTTCAACCCCGCTACGTTTCCAACA
5789882
5789883
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
GGTTTCGTACACTGCGTATGTGAACTATGCTCCCGTGGTAAATAGGTTTCCAACG
5789962
5789963
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
GTTTCAAGGAATCGATAACTCAATCGCAACCGTGGTGTTGCAGTTTCCAACG
5790039
5790040
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
TTTCTTTAACCTCGATAGTCAATCCCATTCCTCAGCGTTTTCCGTGTTTCCAACA
5790119
5790120
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
AGTCACAAACCAGCTAATCATTAACGAAACTTTCTTCGGGGAGTTTCCCCCG
5790196
5790197
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
TCAAAGACTACATCGCCGCCCTTGAAACCGCTGAAATCGTGTTTTCAACA
5790271
5790272
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
ACGCCCCCGTTGTGGATATAACCACTACAGGTACGAACGACAAAGCCTTTCCAACG
5790352
5790353
AGTCCTATTTTAACTAATCGGTAAG
GGAGAAGCAGTTGTAGGTCTCGGAGTGTCAACCGGCACCCGAGGGTTTCCAACG
5790431
5790432
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
TTTTCCGTGTAAATAGTGGAACATCCTGGACGGTAATCAGTTTCCAATG
5790505
5790506
AGTTCACTTTTAGTTAATCGGTAAG
GTCAATTTTTACAAGACGCTACAGAAGCCATCTACACCGTGTTTCCAACG
5790580
5790581
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAA
ATGCTTCCGTAGTTTTCGACTAAGCTACCCTATGCTAATTTGTTTCCAACG
5790656
5790657
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
CCGAAGAATCCCGTTCCGAGGTGTATTACCGAGGATAGTTTCCAACG
5790728
5790729
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
GGGAAGGTAACTCCTTCACACGAGCCGATGCAGGAGCGATGTTGTTTCCAACG
5790806
5790807
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAG
TTCAATGCTAATGCTGAAATCACTTCCAATTTCTCTGCGAAGTTTTCAACG
5790882
5790883
AGTCCTATTTTAACTAATCGGTAAT
GGAAACCAACGATTGACACGACTATCGAATGGTTTAATAATAAGTTTCCAACG
5790960
5790961
AGTCCGATTTTAACTAATCGGTAAT
5790985
Left flanking sequence : Till position 5789196 (length
bp)
TGCCATAAATTGACGCAGAAACCCGGTTTTTTGCTCTTTTGCCAGGAGTTAGAAACCGGGTTTCTTTCAT
CTTCCTCGTTATGTAGACAAGTTTCCAACG
Right flanking sequence : From position 5790985 (length
bp)
TCCTCTGCCAGGAAGCCTGACTGAGAGGGGGGTCAAAGACCAGAGCCGCAGATATGAGTTACATCTTTTG
GAACACAAGCATCTTGCTCGTTATTATTAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp