Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_019695_15                                                                                                                 top


Strain : Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 RefSeq :NC_019695 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019695_15
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACNumber of repetitions :57
Begin Position : 3356802 End Position : 3360948

3356802ATTTCAATCCCTAATAGGGTGTTAATTAAATTTCAACGGCGACGTAGACATCCAAGATCTACTATTAGCAAA 3356873
3356874GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCTTTTACCTTGACTTTTCTCGTTGTCGCTTCCATCAGTTAA 3356951
3356952GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCGCTTTATCTCTCTCTCTTTGCAATTGGCGCATTTC 3357024
3357025GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACATTCAACTTCCCATTGGTTTGCTATCTATGTTCTT 3357096
3357097GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACACAACGAATTCAAGCATAGACTCGATCATGTCAT 3357167
3357168GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCCTTAGAAATCCGCATTAACCGCTTTATCAAGCGC 3357239
3357240GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTTAAGGTTAATCTCAAAATTAAAAACTAGCTGCTTTT 3357313
3357314GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACATAGCCATTCGTACACCCATCGCACCAAGAACTAC 3357385
3357386GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCTGGATTTACACAACGCGATCGCTCAAAATTCACAT 3357458
3357459GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCAGAATTAGCCGCAATCTCGCGATAGCGGGAACGACT 3357532
3357533GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACATTGGGACAGGTGAGCAAACCTGGGACGTTTTCGAT 3357605
3357606GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTTCTCGGCTCTAATTCTTGAACCCACTGCTGAATAC 3357678
3357679GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACAGGCAAGTATAGGGGGCTTCTTTAAAAAGTCCTA 3357749
3357750GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACGCACCAGGACGCTAACAGCAGCACCTTCCTT 3357817
3357818GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACAAAAACGATTCTTGTCTGCTAGTACCTAATGCTCTAAACT 3357894
3357895GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTCTCGCCCTAATTCACAATAACCGCAATAAAAACA 3357966
3357967GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACGGTCAACCACCCAGCACTCCCAGCCGTCGTAATCTG 3358039
3358040GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTTTCACCGCAGGGTACATTGCAAAAATGAATCAAATA 3358113
3358114GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCCCTAGTAGCTAATCCCCTATCTCCAACTCCACTCACACC 3358190
3358191GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTCTAATAATAATTTCCTTTAATGATGCGATTTCCTT 3358263
3358264GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTTCCCGGTAGCAGTGGCTGTATTGTCCTTAG 3358331
3358332GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCTCAATCCTTGGTGCTGAAACTTGGGCGGGAAC 3358401
3358402GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCAGCCATTATTTATCTCTCTAGTTATTGTCTACGTTGA 3358476
3358477GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTCGCGCCGCGACCGCTGCGATCATATTTTTTCCCCC 3358549
3358550GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTTTAGCAGCATTTTCGTCTCGCCCGTTCACTGTTT 3358621
3358622GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACGCCCTGGGGGAGTCAATCGCGGGAGTGTATAAGC 3358692
3358693GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCTCATTGCTTTTCTACTCAAAAAAATCTAAGGAGTTTCTTACAATGC 3358776
3358777GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCGGCTAAATAGCCTTGCTGAACGGGTTTTCGCTT 3358847
3358848GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACGCTGTAGAATTAGCCACTACATTACCAGCAGCATCAAG 3358922
3358923GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTCTAGTAGGAATTGCAGCTTTCTTAGACAGATATTTC 3358996
3358997GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCCAACCGAGTCCCAACCGAGCGATCGATGAAGTCAATCGCGCCAA 3359078
3359079GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTCCCCTCGTAGGTACGTTATATGCATGCAGCTAGCGA 3359152
3359153GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACATCGCCTTCCATCTCCACCACCGCTTTCAAATGCT 3359224
3359225GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTTTGCATTCTTCCTACTTCAGTTTATGCCTCTATTC 3359297
3359298GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTGTTTTGTAAGACGTTGCATACATATTATTAAATCT 3359370
3359371GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACAAAGAAACTGGTTCGAGCTTTAGCAGATATCAGCC 3359442
3359443GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACGCAGCTCACCAGAAAGAGCATTAGCAGCATCACGGATAT 3359518
3359519GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTACCAATGTAGCCGCCAGTTCCAGCACCCAAAACAA 3359591
3359592GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCTGTCCTTCGCTCGTTTTAGCCATGTGGGAATTT 3359662
3359663GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCTGAAATTCCTCAAGGTGTGCGAGATTCTTTTGGGTTTCA 3359739
3359740GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTTCTAGCTTATCTGGAGTTTTAGGAGAATTCCTA 3359810
3359811GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACGCGATTAGTAGTCCGTCTTTCGCTGCCCGTAGCT 3359881
3359882GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACGTCATGTTTCCTGGCTCTCCGATAATGTCTGAAAGC 3359954
3359955GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTAAAACGCGATCGCTCCCCCTACTCCCTACCAAT 3360025
3360026GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTTCGCGAATTATCTTATTCGCAATCTTTTTGTT 3360095
3360096GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTGGTAAAAGCTGTCATATTCTCGGGTTAAAGTATCAGTACTA 3360174
3360175GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCATCAGCAAGTCTTAGCCCTAATTCGCCTGGTTT 3360245
3360246GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCGCAGAACTAGCAATTACAGAGTGTGTTGAATAAT 3360317
3360318GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTTCTTCCACGCCTTTATAGATTTACAGCACCACACACTAATAAAA 3360399
3360400GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACCTGTTGCCGGTCAAATTATCGCAGTTAGGTACTGGA 3360472
3360473GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTTGAAGGCGTTTGCGGATGGTTGCAACTACGTTAATCA 3360547
3360548GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACATTCGGATCGAACTCAAACTCGCCCACATAGGTATA 3360620
3360621GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACTTCCTTTGGTTTTCTTGGGTGGTTTGTCGCACTTCAGAGG 3360697
3360698GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACGAGCAGCCGTTCGTACAGCTCGATAGCAGTTTCCT 3360769
3360770GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACGGAGAATTAGAGGCAGATCCACGCTTCCGCTAT 3360839
3360840GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAACGGGAGAAGAGTAGTATAGGTGCTGTTGCCTCAGCA 3360911
3360912GTTTCAATCCCTAATAGGGCGTTAATTAAATTTCAAC3360948
Left flanking sequence : Till position 3356802 (length bp)
TGTTTTTCCTGTTGGGAAAGTAGTATAGGAGCTGATGCCTCGTCAAACTCAGTATTTCTCTACTGTAAGG
CTTTGATGCCTCATCACTGACTCATCACTT
Right flanking sequence : From position 3360948 (length bp)
GGCGGGAGCCTGAAAACTAAGCCATATTTAGTTTTCAAGGTTCGAGAGCGCGGATAAAGCAATAATAGCA
TCACAAAAGCTGGTTCATGCAAGGTACAAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp