Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_019701_5                                                                                                                 top


Strain : Pseudanabaena sp. PCC 7367 RefSeq :NC_019701 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019701_5
DR consensus (35 bp) : GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGNumber of repetitions :15
Begin Position : 3106132 End Position : 3107206

3106132TTTTTTGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGCTACCCAACCTTATTCATCCTGGCTTACCAAAGGTTCTT 3106205
3106206GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGTCCTCGAAGGTTTTACCCAAAACTCAGGAGCAAAAAGA 3106278
3106279GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGAATGCTATTTCTATTCACGCATTTAATTCAGTACAAAGAATT 3106355
3106356GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGGAACTAACGCGTGCAATGCATGTATCGGTTCTTGGGA 3106427
3106428GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGAAACTGGAAAAACTGTTGTTGTCCCAGAGGATTATTTGCA 3106502
3106503GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGATGCACCAATTAATTTTGCTGTGTTGGATGAAACCGCCA 3106576
3106577GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGTTTCCGCTATTTGTATAGCTGCGGTCTTTTTGGGGGCATGTTCA 3106655
3106656GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGCAGTATTTATAGAGGATCCAAAACAAGGAAGGAAAGAGG 3106729
3106730GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGATACTCTGATTTATATGATCTCTATTTACATTACAAGT 3106802
3106803GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGGCTTTGAAGTAGTTGGCGAATCCCTCAAAGGGATC 3106872
3106873GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGCTCAGTTTATACTTGGCCTTAAAGCTAAGGTAGCTGCAT 3106946
3106947GTTTCAGTCCCCTTTCGGGGTAGTTGGGATGTCAAGGTCTACCCTGATGGTTGCTGGAGTACATGAGTGCTTCA 3107020
3107021GTTTCAGTCCCCTTTCGGGGTAGTTGGGATGTCAAGTTTAGAAAGTGTTGCGAACACTTCTAACTCATCTACTTG 3107095
3107096GTTTCAGTCCCCTTTCGGGGTAGTTGGGATGTCAAGGCTGCATGAGTGCGTTTAGCTACTTATATTATTAACCCCG 3107171
3107172GTTTCAGTCCCCTTTCGGGGTAGTTGGGATGTCAA3107206
Left flanking sequence : Till position 3106132 (length bp)
TCGCTGGTAGTAATTCGAGTTCCCGCTATTTTACGATCGGGTGATCAAATTGTACGGGGCGATCGCACCT
TAATTGGTATTGATTTAACGGTTTTTATTG
Right flanking sequence : From position 3107206 (length bp)
GAGCCCTGATCTAGAGCCCCTACCCAGAGTGGCATTGAGAGGTACAAATCTACGGAGGGTATAATTATTG
AGAATTGACCTTCATTATTGCCAATCAAAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp