Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_019729_10                                                                                                                 top


Strain : Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 RefSeq :NC_019729 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019729_10
DR consensus (37 bp) : GCCGCAATTAACCTAACTCCCTATCAGGGATTGAAACNumber of repetitions :11
Begin Position : 1286014 End Position : 1286766

1286014GCCGCAATTAACCTAACTCCCTATCAGGGATTGAAACTCCAACCTTAAATTCCTGAGCTGATCGCTTTTC 1286083
1286084GCCGCAATTAACCTAACTCCCTATCAGGGATTGAAACACCATAAACCCCATAGGGGCAAGGGCCACACCA 1286153
1286154GCCGCAATTAACCTAACTCCCTATCAGGGATTGAAACTCGCTCGGCTTGTTCTTGCAGCAATCGTGCGTACTG 1286226
1286227GCCGCAATTAACCTAACTCCCTATCAGGGATTGAAACTTTAAAATCTAATTGGACGGATAGGCTAATCAGAGTA 1286300
1286301GCCGCAATTAACCTAACTCCCTATCAGGGATTGAAACAGTTCATCTTTAGAACCGCGTACAGATCGGGATTTTC 1286374
1286375GCCGCAATTAACCTAACTCCCTATCAGGGATTGAAACCAGTCACGCTTGCTACCTTTTGAAGTTGTCCACA 1286445
1286446GCCGCAATTAACCTAACTCCCTATCAGGGATTGAAACAGTCATTCGATAATTCTTGAAGATTTACAAGCCAAGG 1286519
1286520GCCGCAATTAACCTAACTCCCTATCAGGGATTGAAACTGGTATTGTATTGCGGTCTGTAGCCATCGA 1286586
1286587GCCGCAATTAACCTAACTCCCTATCAGGGATTGAAACGTTGAAACTCCTGATGATTTCACCAAACATATTGA 1286658
1286659GCCGCAATTAACCTAACTCCCTATCAGGGATTGAAACGTGGAGAAGCAGTTAAGTTGTTAATTAAATCAA 1286728
1286729GCCGCAATTAACCTAACTCCCTATCAGGGATTGAAAC1286765
Left flanking sequence : Till position 1286014 (length bp)
TGTGGGTATTGACAAGTCGAAGGCTGAAATGGTACTTTTGTTTTACGCAGACGCAAATGAACCTTGAAAA
CCAAATACAGCAAAGCTTCTGGAACGGGCG
Right flanking sequence : From position 1286766 (length bp)
GCCCGCAAATTGATATTCAAGATGCGGACGCGGTGAAGCCGCAATTAACCTATAGCGGTTCTCGGAAAAA
TGAGGTATTCACGAATTAATTAACAATTCC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp