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CRISPRs details
NC_019729_4
Flanking alignement tool
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NC_019729_4                                                                                                                 
top
Strain :
Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112
RefSeq :
NC_019729 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019729_4
DR consensus (36 bp) :
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
Number of repetitions :
20
Begin Position :
603426
End Position :
604860
603426
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
TACTTGAAAGTATTGTAACCATCACAAATGTTAGT
603496
603497
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
TCCACTATTTTCGTATTAATTCTAGCAGGATTAA
603566
603567
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
ATTAAAACTAGCTAGATGTCAGAGAGCCAGTTTTAG
603638
603639
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
CTATGACAATTTTTGCTGTTTCTTTTGGGATGATAAG
603711
603712
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
GCACCTTTGCCAGGTTAGCGGCAACTAACACAGTATC
603784
603785
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
CGCCATGGGAGGCGAGAAGTTCTTCGAGTTGAGCTAAA
603858
603859
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
CAGACCCCCACTCGTCGTAAAAATGCGATAAGTG
603928
603929
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
AAATAAAACTCCTCCAAAATCTGGAATTTTATAACC
604000
604001
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
AATAAAGAAAAAGAAGTGGGAAAACAAAAAATCGAAGC
604074
604075
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
CAGAAGTATCGGTGTCAATAATATCGAAACATTGA
604145
604146
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
ACCCGAGGGGGCACAGGCTGGGGTAAAAGCAATCGTGATCATT
604224
604225
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
CAAAAAGGTAATGCTCGTATATTTCTACATTGCTA
604295
604296
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
CTTCTAGAGGAGTTTCTCCTGGTTCAATTTTTTCGCTGATT
604372
604373
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
CGGAAAGTCCGACAATTCCTCGTTGCCGCACGCTTCC
604445
604446
CTCCCCACTCGCTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
CGATCAGATTTTAGAAAAGATTCTAAAGATTTTTGAG
604518
604519
CTCCCCACTCGTTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
TCATTCAGTTTCATCTGAGCCTCCTTTGCTTTCCAA
604590
604591
CTCCCCACTCGTTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
TTTATTCGGGATTCGTACATCGGCTCCGAATTTAATTCTTCCAGGGTAGG
604676
604677
CTCCCCACTCGTTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
AGGAACTGCACGGGCCCTCCACCGGCACCGCACCCAAAACA
604753
604754
CTCCCCACTCGTTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
AGGAGACACTGGAGTTCTGTCATATTTTCACCCCG
604824
604825
CTCCCCACTCGTTGGGGAAACTAATTGAATGGAAAC
604860
Left flanking sequence : Till position 603426 (length
bp)
TTATAGTTCGATGCTTTTTATCGTTTACCTGTGCTATATTTTAGCGGTGCGTCGATTTGACGGCTGAATC
CCTCTCTGGGTATGGTCTCTGCGGCGAACT
Right flanking sequence : From position 604860 (length
bp)
GCTAAAACAAAATTAGTGGAAGTCTTCTATTAATGCGACAGTTTAAGGGCAACCATAAATAGCTGTTGAC
AAAAGACTAGATTTCTAATAGTCTAATTTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp