Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_019745_5                                                                                                                 top


Strain : Gloeocapsa sp. PCC 7428 RefSeq :NC_019745 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019745_5
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACNumber of repetitions :30
Begin Position : 2248605 End Position : 2250739

2248605ATTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACTTCAAGTGTTTATCCTTGCATTCCCCGCAATGCTAA 2248677
2248678GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACTCTTCGTAATACGAGTTACAAGGTACTTCAGCAATA 2248750
2248751GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACCAAGCTCCTAATAATTTCAGCAGAGTAAGCGCTTT 2248822
2248823GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACAAAAGTTGAGTACATCGACAAAGTAATCACAAAA 2248893
2248894GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACGCAAAAGATTTGGCTTTGGACCAAGGACGGCATC 2248964
2248965GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACCGCAGCTTGCTATTGGCGAACAAAGACTGGTAAA 2249035
2249036GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACGCGATCGCATGGCTAAAAGTTATTGAAAATTCTTT 2249107
2249108GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACGTTTTTATTGCGATCTTCTACGATACGTCTTGCGAC 2249180
2249181GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACCTCTTTAATATACCAGCCCGCAACGATAGCGGTAT 2249252
2249253GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACGCCCTGTAACCGCAAAGCAAGCGATTTACACGGAATCC 2249327
2249328GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACAGCACTCAAGGTGGCCCGTAACATTGCAGAGATG 2249398
2249399GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACGAAGAATCGTGGAAAATCTTTTACGATTTACTGC 2249469
2249470GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACTTGATGCATTTTGTGGGTATACGGAATCAATCGCT 2249541
2249542GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACTTAATTAAGGCACCCGTTTTATTCCCTTCCAAGTCCTGC 2249617
2249618GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACAAGTTTTTTAAAGTACCCAAACAAGGTGGTGCTAGT 2249690
2249691GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACGGGTTTTGGGACACAGCTTCGATCTGGCAATATATT 2249763
2249764GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACCTGCGGGGGCAGGAGCTTTTACTGGAATTACGCTTG 2249836
2249837GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACAAAGTTTAACAAAAACTTGTTTAAAAAAACAAAGGC 2249909
2249910GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACTCAATATTGCCACCACGCACAGCAAATTCAATTTTTT 2249983
2249984GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACCGAAGTAAGTATTCGTCGTTATACTTGCTTAAAAT 2250055
2250056GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACCGCAAGGAATTGTGCCTAACGCCATCCATTTCGCC 2250127
2250128GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACGCGCGTAAAGCAATGAATCAAATCACAGAACAC 2250197
2250198GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACGAGTATTGCCCTCGCTTGTGGCGACTCAACTCTT 2250268
2250269GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACCGACGGCTAACCCAGTAATATGCAGCGAGTTTTT 2250339
2250340GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACTTGCGATCGCCTAATCAATACATTTGCATGGCTTCAAA 2250414
2250415GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACCTTGGGTGTATCTACAGGACAAACTATGGCTTTTGAT 2250488
2250489GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACTTTGCAGGGAAATACAAAGCTGTTGCAGTAAGTC 2250559
2250560GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACAGTACTTCGATTGCTAAACTTTGCAACTTCACTCA 2250631
2250632GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTACACTATCGATTACGTTAGAAAAGGGTTACAATCCG 2250702
2250703GTTTCAATTTAGTCCCTTCAATAAAAGGGATTTCTAC2250739
Left flanking sequence : Till position 2248605 (length bp)
TATTAAAGCAGCATCAGTGAGGTGATTTATTGCACCATAAAATGGTCGTGAATCCTGCTATTAGTTAATT
CACACTTTACTTGTGTAAGCTCCATATTGT
Right flanking sequence : From position 2250739 (length bp)
AGCGGCTCTCTCGAATTTTTTCTGTATGAGGTTTTCAAGGTTCGGGTGCGCGAATGCCTTCGCATTTGCC
AACACAATTATACTCATCACTGTTTCACAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp