CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_019745_6
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_019745_6                                                                                                                 
top
Strain :
Gloeocapsa sp. PCC 7428
RefSeq :
NC_019745 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019745_6
DR consensus (36 bp) :
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
Number of repetitions :
45
Begin Position :
3442926
End Position :
3446127
3442926
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
ACGGGCTTGCCTGTATCCTTGTCCAATGACATAGATA
3442998
3442999
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TTTTGATTTTCTAACTCAAGCTCCCGAATGCGATCGCT
3443072
3443073
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
GGAACTAATCGCTATTTCGTTAGCGGAAGTCTTGG
3443143
3443144
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
GCTATATTTAATTCTTTTTTCACCCAATTACGAGC
3443214
3443215
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TCGATAGCCGCGCCGCTCGCCATCAGCCGTTCAGGA
3443286
3443287
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
ATCATCAATTTCCAAAACAGCACAGACATCCTTAG
3443357
3443358
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TTTCTGATCCTGGAACGTATGGAAATCCGTTAAAGT
3443429
3443430
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
AAGCTGTGCGCCAAAACTTCGGAAGTCTTCAGATGCT
3443502
3443503
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
GTGTAAGTCAGTTAGAATCTGACCTACAGCGCCTT
3443573
3443574
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TGTTTATTTCTAGCTGCACTAACTTTAGGTACCATCAACAT
3443650
3443651
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
ACCTTCCCTAGCTTGACTGCGCGTCGTAAAAATCGC
3443722
3443723
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
ACGCACGCGGGATTGGTGGGCGTTTATTGCAGCA
3443792
3443793
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TTTACGTCGAAAGCGTGGTTTGACTGAGTAAACGC
3443863
3443864
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
ATACCGCTGTTGCGATTGGTGACGACGAAGTTACTCTA
3443937
3443938
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TGATAGTAAATACGCCTTAGAAGTTGCAAAATGTG
3444008
3444009
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
ATTCAGGCAGCGGGGAGAATCAGAGCGAACAATCG
3444079
3444080
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
AGTCTCGTAATGGTGCGCGCGTTGAGTTTTTAAAGA
3444151
3444152
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
AATAGCGCTAGCGCGTCTTACACACGCGTCTAGGCG
3444223
3444224
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
GCATGATTGGGCTTGCTGAGGCTGCTGAGGATTTTAA
3444296
3444297
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TGTAAGGCGCGTTACACCATGAAATTCAACAGAT
3444366
3444367
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TGCTGGGAAGCTTTCTGCCCGTGTACGGATTGACAA
3444438
3444439
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
AAAACCGTAACACCATCAACCCAGTTATTCAAAGC
3444509
3444510
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
GCAAACCAGATGCGATTGCGCGCTGATTTTAGCTTA
3444581
3444582
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
ATCCAGATATCTGCGCCCAACGACTCAGCAATTTCT
3444653
3444654
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
CGGCGTGCCTTGCGGCTGTAGATTTTCACTGTGAG
3444724
3444725
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TTTTATCCTGCTTTTCTGATGGTGTGGCACTATACTG
3444797
3444798
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
GTCGCGTTGTGGGAACTAGCAACAGCGCCACTAACA
3444869
3444870
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
ACTACATGTGCGGTTACCGTAACGCAACGCTAACTCT
3444942
3444943
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TTGATGAGGAGATCGGATGGATTTCTAGTAGAAGCG
3445014
3445015
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
AATGAAGATGAATGAGCAGCCAAATTCACGAGCGAT
3445086
3445087
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
ATATTCGTTACTGTTTAATTATTGTAGTAAGCTA
3445156
3445157
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TTACGTGGGTCTAGTGCTTCTCCTTTGCCCAAACCT
3445228
3445229
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TACCTAACCATTCCACGCGAAGACTTCGAGAAAAA
3445299
3445300
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
CTAGCTGCATCAAAAAGTACGTCTGCACTAAAGCT
3445370
3445371
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
TCTATAGGTTTGTAACTCATGGTCGTCTGAATGTT
3445441
3445442
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
CTTCCCAAAGTTCTTCTCTGAGTTCGGGCTTCTCCT
3445513
3445514
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
AAGATGAATTCCTAATTTACGTCGTAGATGAGGAGG
3445585
3445586
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
AGGATAATCAGCACTGGAGACTACCCAAATCAGAGTCTG
3445660
3445661
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
AAAGTCTACAGCAGCCAAGCACGCTGCATAGGGTTC
3445732
3445733
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
AGCGAGCAATCAAGTCGATTGACTTTTTAGCAGT
3445802
3445803
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCTTTGATCAC
CCTTAAACAACGTGCGCCAGCTATCAGGCTTACCTGC
3445875
3445876
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
GAGGAGTAGGTAAATCACTGCTCTCCTACGATATT
3445946
3445947
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
CTAAATCGGCCGTTTTTATCCTACTTCTTACAGTCT
3446018
3446019
GTGTTTTCACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
GGAATTAGTACCGATTGCTAGCGATCGCTATGAGGAT
3446091
3446092
GTGTTTTAACCTTAGATGCCACAAGGCGTTGATCAC
3446127
Left flanking sequence : Till position 3442926 (length
bp)
TATGTTTTTATTGTCCAATTGGTCATTTCTGGTCATCTATGAGGAGGTGCTTGTGTAATGTAGCAGGAAT
ACTTACCAAGAAATGGTTTCAGCGTTCGGC
Right flanking sequence : From position 3446127 (length
bp)
TGGTGATTGCCCGTGACTCGATTCAACAGATTCATCGATGGTGTTTTAACCTCACGCGATCAAGTGCTAA
CATTCCCTATTGAGATGAGTCCTAGCGATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp