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CRISPRs details
NC_019753_18
Flanking alignement tool
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NC_019753_18                                                                                                                 
top
Strain :
Crinalium epipsammum PCC 9333
RefSeq :
NC_019753 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019753_18
DR consensus (37 bp) :
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
31
Begin Position :
5029582
End Position :
5031781
5029582
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
AAAAAACAGTTCCCACCAATAGCAGTAATAGCAG
5029652
5029653
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
ATCTCTAGCCCAAGAGAAGCCAGCCATCCAATCACACC
5029727
5029728
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
CAGAAATTACGACAGACGCGCAAGCAGGATCAGCCA
5029800
5029801
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
AGCCAGATAATGATGATAATGCTAGAGGCTGTCC
5029871
5029872
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
GCTGCTTTTTTATTGATAGTTCTTGATCTTCCAT
5029942
5029943
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
AAAAAATTAACTATTTACTTAAAAGTTAATTTTTTA
5030015
5030016
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
TTGAATTCTTGTTGTGTCATAACCAAGGTGGCTATG
5030088
5030089
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
AGATAGTAATAATGAACTTTTAAGCAGTGGCAAATA
5030161
5030162
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
AATTTCTTCAATACGCTCCCCCATCTGGCGTAATGA
5030234
5030235
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
ATGGAAGAGTATAAAGCCAAGGATGGCAAGATGA
5030305
5030306
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
TCGCCAGTTTGATTAATCAAAAAACTCCGGTC
5030374
5030375
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
TAAGTGTCTAAACTCTATCCCTAATTCTTCTAGTT
5030446
5030447
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
TCTCTATTGATAAAATCCACTCGATTAATTGCTTCA
5030519
5030520
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
CAGACCTCCCCGACGAGACAGCATACTCAGAGGGA
5030591
5030592
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
ATCAAAACTTACTGGTAGCAGCTAAGGAACTATG
5030662
5030663
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
TACGAGAATCCTCTAACCATTCACCGTGGCTTGTA
5030734
5030735
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
GAATTGTGATCGGCGTTGATACAAAGCTTTGAAAAC
5030807
5030808
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
AGCATCTTCTGGATGTGAGCGTTTAAATTCC
5030875
5030876
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
TTTTACCTTTTACTTTGACGCTAGAAGGTTGCCGT
5030947
5030948
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
GAGGGATAGTAAATCCTCCTCAGTTAAATCGTATAA
5031020
5031021
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
TCATTAGACTTTCATACAAGTGAAGTTTTAAATA
5031091
5031092
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
ACATACAAAGGCATTAGCTGGTGGTACTACTAAT
5031162
5031163
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
CCCTTATTAACTCTCTTTCAAACTGTGCAATAGC
5031233
5031234
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
GTAACATTTAAACGCCATACCATGCTCCTGGATCA
5031305
5031306
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
TGAAGCTTTATTAATATCATGCACAATCAAAGCA
5031376
5031377
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
CTGATGTAGTATTTCTTAAGCAATTAAATTATGGCTATAG
5031453
5031454
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
GTTTATTGCGATCGCCTTTACATTTTTCTAGGGGAA
5031526
5031527
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
AAATGATTTAGTTATAGATGAAAATGTATCTCAGGC
5031599
5031600
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
GGTTCTGGTGCAGTTTCCATGCGATCGCTAATCGA
5031671
5031672
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
GGTTGAGTGAATAGTGATAGTTGCATAATTATTCGC
5031744
5031745
GTTTAAATGCACCTAAATCCCTTTTAGGGATTGAAAC
5031781
Left flanking sequence : Till position 5029582 (length
bp)
ATTGAAATGCGGTACTATCTAGCCCAAATGCTATGTTCAGTATTAATCCGCGCAACAGCACCTCGAAAAC
TAAATACAGCAACGCTTTCATGCTCCGGCA
Right flanking sequence : From position 5031781 (length
bp)
CAATAAAAGCCAACAAATCTAATATAAAAATCCGCCTCGGTTGAAATTAATCGAAAAATATAAACTTTTG
TAACATATAGACAAAAAAGTAGTTTTTTAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp