Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_019757_28                                                                                                                 top


Strain : Cylindrospermum stagnale PCC 7417 RefSeq :NC_019757 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019757_28
DR consensus (36 bp) : GTCACTTCTATTCTGAGAAGTGGAATTAATGGAAACNumber of repetitions :17
Begin Position : 4707333 End Position : 4708567

4707333GTCGCTTCTATTCTGAGAAGTGGAATTAATGGAAACCAGATTGAAAGGTTGCTTCCAACTCTTCTTTCTGTAGCCACGC 4707411
4707412GTCGCTTCTATTCTTAGAAGTGGAATTAATGGAAACCTCGCATCTACCGGTTCGTCCGGGGATATTTGCAG 4707482
4707483GTCGCTTCTATTCTTAGAAGTGGAATTAATGGAAACTTGCAACAATATGTACCTTACTGGGTACGTTAACAA 4707554
4707555GTCGCTTCTATTCTTAGAAGTGGAATTAATGGAAACGAGATACGACGAAAGCAGAAGGTCGCCCTTCGTATTC 4707627
4707628GTCGCTTCTATTCTTAGAAGTGGAATTAATGGAAACCGACTCTAGCTCAAGAGAGCCTTCATCGTTGCAAACTCATTGTGCAGC 4707711
4707712GTCACTTCTATTCTCAGAAGTGGAATTAATGGAAACTTTGGCTCTCTAACGGACGTGTCTATTCGGAAT 4707780
4707781GTCACTTCTATTCTGAGAAGTGGAATTAATGGAAACTTACCCGATTATCTTCTGCCTGCAAAACTCGTTGAATA 4707854
4707855GTCACTTCTATTCTGAGAAGTGGAATTAATGGAAACCATACAGACGGGAATTGGTTCCCGACGTGGTGATCA 4707926
4707927GTCACTTCTATTCTGAGAAGTGGAATTAATGGAAACTTGCCATTAGGCTTGTCGTAATTGGGTGATTTATGCACCTCTTTT 4708007
4708008GTCACTTCTATTCTGAGAAGTGGAATTAATGGAAAAATCGTTGGAATTGCGATTTTTGCCGTATCACCTAGAACT 4708082
4708083GTCACTTCTATTCTGAGAAGTGGAATTAATGGAAACGTATATGTGTCATCGGCTTCAAGATGAACAGTGAGA 4708154
4708155GTCACTTCTATTCTGAGAAGTGGAATTAATGGAAACAACGGATATGCTTCTTTCAAAGCAGGATTAAGCTG 4708225
4708226GTCACTTCTATTCTGAGAAGTGGAATTAATGGAAACTTGACTTCTCCGCCAATCAATCTTCCATAAAGGGCATAGGC 4708302
4708303GTCACTTCTATTCTTAGAAGTGGAATTAATGGAAACATTTCTATGACAGGGATATCGATGCCACGTAACACA 4708374
4708375GTCACTTCTATTCTTAGAAGTGGAATTAATGGAAACGAGGATGCCATTGACAGCATGCCCAGCCCATCCCAGCAGGAGGA 4708454
4708455GTCACTTCTATTCTTAGAAGTGGAATTAATGGAAACACCCAGAAATTATCCCAAAGCATAATCACAGGGTTTATACC 4708531
4708532GTCACTTCTATTCTGAGAAGTGGAATTAATCAAAAT4708567
Left flanking sequence : Till position 4707333 (length bp)
TTTTTCTGCCTCTAGCTGACGCAGATAAATTCTGTGTGCACAGACCCCGTCGCAAACGGCAGCTGGACAT
TAGGCATAGTCAGGGCTTAAAGTATGAGGG
Right flanking sequence : From position 4708567 (length bp)
TAAAAGGTCGGGATATTAACATCCGACCTTTTTTAAAAACCATTAAATATAGTTTAAATATTTACTTGTT
ACTCGCTATAAACTTTAACAATATCCTCAC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp