CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_019765_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_019765_1                                                                                                                 
top
Strain :
Stanieria cyanosphaera PCC 7437
RefSeq :
NC_019765 (plasmid pSTA7437.01 )
CRISPR id :
NC_019765_1
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAAC
Number of repetitions :
8
Begin Position :
32009
End Position :
32557
32009
GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAAC
TTTTATCTTTTCTCAATCAATTGATAAAGGTCGTA
32080
32081
GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAAC
AATGAGTTTAAAGATTTGCTTATGGCGCAAGTTTG
32152
32153
GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAAC
ATAGATGGAAATTCCTCTTTCTTCGGAAAAAATTATCGA
32228
32229
GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAAC
ATTGTTTCTCAGCAAACGTAATTGGTTGCCAGTCAT
32301
32302
GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAAC
GTGCTACGTTCGTAAACTTGCGTTTCAAAAGTCCCT
32374
32375
GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAAC
GTGAGGGAATTGATATGTTTGCTCGTAAAGGTGAT
32446
32447
GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAAC
CAATCCCCCCTTCGTCGAGGAGCAATACAGAGTTAG
32519
32520
GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAAC
32556
Left flanking sequence : Till position 32009 (length
bp)
ATAGCGATAATTGATTAGTAAATTTTGAAACTTATTCGCTAACCATAAAATTAGATTTAGTTTAAACTTG
AAACTTTCGTAGAAGCTGAGAATCGTAATA
Right flanking sequence : From position 32557 (length
bp)
TTTGATAAGGTATTATGTTATTGAGGATAAATAAGTTTCAATTCAAACGGGTGTCGCAGGAACATGGCAA
CTATTCTGGGTATTATGTTATTGAGGATAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp