Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_019765_2                                                                                                                 top


Strain : Stanieria cyanosphaera PCC 7437 RefSeq :NC_019765 (plasmid pSTA7437.01 )
CRISPR id : NC_019765_2
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACNumber of repetitions :35
Begin Position : 32662 End Position : 35193

32662GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACAGTTCGTCGTGCAACTAAGGTGCAGAAATAATGGAATT 32736
32737GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACCCATTAGCAGCAAACCAATTCAAACCACGAAGAC 32807
32808GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACGTTTTAAGCTCTTCAATAGTTTCATCAATTTGCTCTTTAT 32884
32885GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACATTTATAACGATTGTTTGCAATATGGCGTAGGTAAAG 32958
32959GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACACTTAAACGAATCCGACCCCGTAAAAGTTGACCTGTCCTT 33035
33036GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACAAATTTGGCGATCGCTCGATAAAAAGTAGCTGAAGA 33108
33109GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTTGATGGAATGGTTCGGAGTCGAATTTTTTCTGAT 33180
33181GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACAAATTTGCCCGTGTTCGAGCGTCTGTCCAATCCA 33251
33252GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACATAGTTCTCGCTTCTGCTTCGATTTTTTGAATTT 33322
33323GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACACTGCTGGTCGTATTGCTTTCCATAATTGGTCACAGGCTA 33399
33400GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTAATAAAAATCTAGATCAAGATGATTTAAATGTACT 33472
33473GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACGTAGGTAGCAAGATTTGATCGACTTCGGGGTTGGCGTTGATA 33551
33552GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTTAGAGAGAATTTAGATTACAATCGCAATCTTTTA 33623
33624GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTATCTTCCGTCGATCGCGATTTGAGTTCTTTTG 33693
33694GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACATCGGCTGCATCTAATGCAGGTGCAGCACTCCTGGCT 33767
33768GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACCGATTCAAAAGTAAATACCTCAGAATACTTTATTT 33839
33840GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACGTAAGTACTGAGCGAACATTTTACTTAGTTCTTCTTT 33913
33914GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTTCAAGATTTATTTGAAGATGTTACTGATTCTAA 33984
33985GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACAGTGGAGAATGAAACTAAAGTAGCTTGGTATGCT 34055
34056GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACGTAGTACATACTCAGTAGTACCATCATCGGCGGTATA 34129
34130GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTTAATAACTGGAAAAATATTAAAGGGTTTAACTAC 34201
34202GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTTGAAAATATATATTTTCTCCTTCTTCCCAATTTT 34273
34274GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACCTATCCCAGTTATCTTTTTGATCAAACCAATCAAT 34345
34346GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACCCAGAAAAATAAGCTAGATTTGCTATTGTATATTTAGT 34420
34421GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACCATTTGAGAATTAGAGAGAGCAAGAGCAATAGATC 34492
34493GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTGGAAACTACAGCACCAGTAGAACTACAAGCTTCT 34564
34565GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTAGACAGATCGATTAAATTTTGAACTGTTTTAATTGCGGCC 34642
34643GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTCAAGTCTTACCACAGCAGCTTGAGCCGTATCCGCAG 34716
34717GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACACAAAGTAGTTGATTATTTAGAAATTGATTTTACTTTT 34791
34792GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACGATTTTTTCAATGGCTGGCTGTAGCTTTTTGAG 34861
34862GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTATTTCATTCAATGGGCGCACTACTCCACCAGAAAT 34934
34935GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACACATGGTAATTCAACCGTTGCCGTATCATTGGAAGT 35007
35008GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTAGCTGAAACTTTAGCAGAATTATGGGGAGCAATTTT 35081
35082GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTAATCAAGTTGTAAATAAAGATTAGTTGTAGTTCCCAA 35156
35157GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAAC35193
Left flanking sequence : Till position 32662 (length bp)
ATAAGGTATTATGTTATTGAGGATAAATAAGTTTCAATTCAAACGGGTGTCGCAGGAACATGGCAACTAT
TCTGGGTATTATGTTATTGAGGATAAATAA
Right flanking sequence : From position 35193 (length bp)
CGCGGTAGTTCAAAAACATTGATATATTTAGTTTTCAAGGTTCGTTTGCGCGGTATTGGGTTGATGATAG
CACAAAGGACAAGAAAAACAGAGCCAAAAT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp