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CRISPRs details
NC_019776_6
Flanking alignement tool
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NC_019776_6                                                                                                                 
top
Strain :
Cyanobacterium aponinum PCC 10605
RefSeq :
NC_019776 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019776_6
DR consensus (37 bp) :
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
38
Begin Position :
3180046
End Position :
3182768
3180046
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
TGGTTCTTCAAGTTCTGGCGGTTCTTTGATTTCTG
3180117
3180118
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
AACAGCAGAACTGCGATAACCAGAAGAAATTATTACAG
3180192
3180193
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
TTCCATAAATTACTAACTACTTTTGTTACAACTA
3180263
3180264
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
TCAGATAACATTTCACTAAAGCCTTTAGCACTGGTGA
3180337
3180338
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
GGCTTCAGCCCACGTCAAGGCTCTTTCCCATGTGCCGA
3180412
3180413
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
TAGAACACCCCATGAGCAAAACCCAATGGAAAAAT
3180484
3180485
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
CTACCTCTCTCCATTTATAACCAATGCGAATTTCCGT
3180558
3180559
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
GCAGTCGTAGGAAACTGCTTCTAACCAACGATT
3180628
3180629
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
GCTACTACTGTGCTTTTTTGAGCAACCTCATCGTA
3180700
3180701
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
TTTGTTTTCATCATAATAAATAGCTTCATAATTGGT
3180773
3180774
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
CAAACAGTGCCTATAGGTTATGCACAACTTGTTA
3180844
3180845
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
TTCCTCCCAATTATTTAATGCGATTCTTCTGGTT
3180915
3180916
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
AAGTACTCTTGAGACTTCTCTACCAATTCTTTT
3180985
3180986
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
ATTATCTAAATCTAATAAAGAGTTTGACGATTTTA
3181057
3181058
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
CACCTCCAGAAGGCATAGAGCTTAATTTTCTTCCTTT
3181131
3181132
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
AACCTTCGCCTTCTTTCTCCCCCAATTAAGATGC
3181202
3181203
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
CTATTCCTCCTTTTTATTTCGATTATCATCCTCAT
3181274
3181275
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
ATTTAACAAAATCATTGGAGAATTAAATTATGAGCT
3181347
3181348
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
AAAGTTTTGTTGCTTCAAATTTAATTATAATTTAATTATATGG
3181427
3181428
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
CCAAATCCTTGATTCCCTAGCTGATTAGCTGTATTTAAA
3181503
3181504
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
TCTAACTCAATCCCTCAAGGGCAGTCGTCTTGTCAA
3181576
3181577
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
ACATTCTGGACAATAATGAATAGCCCAATCACA
3181646
3181647
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
AATTATGCTACTTTTAAAGGTTAATTCTAACCATGA
3181719
3181720
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
AATTTTAAACGAGTTCATTGTGCAAGGGTAAATACC
3181792
3181793
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
GCCCCCCAAAGCAATAGTAGTTTTTTCAATTCT
3181862
3181863
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
TTGACTCCAAAAGAAGACGCTCCTTACCCCATTGA
3181934
3181935
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
CTGATTGTGACGGATTGTGACTAATGTGACGGATGGG
3182008
3182009
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
ACCAGAATTTTTCTTTAACCAATTTTCCCCCGAAT
3182080
3182081
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
GAAGATAAAATAAATTTGCGCCCAGTGATTGAGGT
3182152
3182153
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
AGTACAATTACTTGATCCCCCACCGAGGGCATGGAG
3182225
3182226
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
GCTTCATCGGGATTGACCAAACCACAATTATT
3182294
3182295
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
AGACCCTAGACGCTTATTTAAAACTCAATTTAACA
3182366
3182367
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
TTTCTTGTCGCATCAGGACATAAAATGTTTCGT
3182436
3182437
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
TTTTTATTAGTTTTGAATCTCTGTGCTAATTTACCA
3182509
3182510
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
ATTAATTGGATAGACCATTTCAACCTCCGTATTTGTGT
3182584
3182585
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
GTTCCATATCCTCAACTTGACGAGTAATAGCAGTCC
3182657
3182658
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC
GAGGGCATAATCAGGACAATTATCAGGACATACTAT
3182730
3182731
GTTTAAACTCTAATTAATACCTATACATTAGTTAGAA
3182767
Left flanking sequence : Till position 3180046 (length
bp)
TAAAGGGTGGACATTAAAAATGAATTTATTTATAATTGAAGCTAGGCTTACGCGATCGCACCTTGAAAAC
CTTATATTTCAAAGACTTCGATTATGGGCG
Right flanking sequence : From position 3182768 (length
bp)
TTAAAGTTGCGTGCAATTTGTCAAGTATATAGTTACAATTATTAATTATAAGCTCAATTCTTTGCTAACT
CTGTCTCTTAAGACTTTTCTCTGTTGACTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp