Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_019779_8                                                                                                                 top


Strain : Halothece sp. PCC 7418 RefSeq :NC_019779 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019779_8
DR consensus (37 bp) : GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACNumber of repetitions :50
Begin Position : 2090436 End Position : 2094051

2090436GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTTTTGATTCAGGCCCCGAGCCAAATCCCGATCCC 2090506
2090507GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTCTAACTAAAAATAATCATAACACATTCTTTTAAAA 2090579
2090580GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACAAGCAATTTTATATTGCTCAGGAGTGCTAGGCAA 2090650
2090651GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACAGGGAAATATACCAGATGGTAGCAGTAAGGTAGCA 2090722
2090723GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACCTAAGATGACCGCAGTGGCGCAATAACAACTTCT 2090793
2090794GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACCTTTTCAGTCTTGCGATCCTCGTAGTCATCAAAT 2090864
2090865GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACATTAAAAGAGGGGTTAAAAGTTGTTGGATTCAAT 2090935
2090936GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACACGGACTGAATATTACAAAACCATCGGGGCAAAG 2091006
2091007GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTTTTTCTGTGGTCAGAATAGCCTAAGTATTCTG 2091076
2091077GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACGAAAGAAGAGCGCAACGACAACAGCAGTGACACCGCAACG 2091153
2091154GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTATTTTGTGGTTTCAGGATGAATCCTACCTAAAATC 2091226
2091227GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTTGCTCAAGTTTTGGCATCATTGTGTAGTCAAATACT 2091300
2091301GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACAGGGAATTTTGTAATATCTTCTATGCCAAGATTTTCGTTGATA 2091380
2091381GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTAACATCTGCAATGGTTTCTTCTAGGAGTTCCCACT 2091453
2091454GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACCCATCGCTTTGACTTTCATTCTACTAATGAAAAGGGAG 2091528
2091529GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACCTGGTCGCAGTAATGAATATCCTCATTGGCTCTTAGA 2091602
2091603GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTTATTAATAGGTAAATAAGGTGGATCGAGATATA 2091673
2091674GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACAAAAATAAGCCAGAACAACCGCTCCATGACACAGTTC 2091747
2091748GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTTTTCATAAACGAAAACCAAAGTACAAGAAATGCT 2091819
2091820GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACGAGAAAAGCTGCGGATGGATTTTAGGCGGAGCTTGCCCAA 2091896
2091897GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACCCGATATAAGATTTACTGGCTTTAGTTGCTCCTGTTCT 2091971
2091972GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACATCGACTCTCTGACTAGCGTTAATCTTCGCAGCACCTTCA 2092048
2092049GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTCCTTCCTAAAATGAGATATCTGTTAATCCTTTGT 2092120
2092121GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTGAGTATTCGGGCAACGCTCGAATATCATCCAGT 2092191
2092192GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTTTGAATAAAGTGTAAACTCTGTAAACTTAGGCG 2092262
2092263GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTTTTTGGTTGTGACAATTCTGAAGGGGGGTCAAGT 2092334
2092335GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACGTTGTTTAGCGATATCTTCGCCTGATTGCTCCCAA 2092406
2092407GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACGTCAACGCTTTACCAACTCGTTTGGCAGTTGACCAAA 2092480
2092481GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACCCGCTAGTTGTCCCCTCGGCTATGGTTGCGGT 2092549
2092550GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACGGTAAGTGTAATTGGGTCTTTATCATCATCTTC 2092619
2092620GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACCTTATCATGAAGAAGAACATCTACACTAATTTAATGT 2092693
2092694GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTGGCATTTTCAATTTTCTGCTCTAGTGAATCCAGATCTG 2092769
2092770GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACCATTTCCAGCATTGGCTCTCCCCCGATGGTAATTGC 2092842
2092843GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACGCTGGGCTGACATTCCCCCGGAAAACAACCCAGA 2092913
2092914GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTATTAATTGCTTACGGTAGTCCTGATTACGGACTAAGCACA 2092991
2092992GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTTCTACAATTAGATAATTAGCAAGTTGCTACCAGTGACTACC 2093070
2093071GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTTACAGCAACTCGTAGAGGCGTACTGTGAAGGAGATA 2093144
2093145GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACTTCCCCACCCTGAATATAAGCAGAATAAAAATACGG 2093217
2093218GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACATTAATCCCAGATACAGACGGCATTTTAACCTCCCA 2093290
2093291GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACAAAACTACTCGCTGAGGAGTACCGTCGCTTAACA 2093361
2093362GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACAGAGTATGGGGACCAGAAATAGCAAATACTTCAATG 2093434
2093435GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACGTTAGGGTCGAAGGGATGCTCCCTAAACTCAAAAGCA 2093508
2093509GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAATAACGCTACTCAGCAACAAGTCCTTACTCTTATGA 2093579
2093580GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAATTATTACCCCAGTTATTGCGCTCTAAAGGAACAGGT 2093651
2093652GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAATCCTTTTTTTTGCCTCAGCTTCTAGTCGATCTTCCA 2093723
2093724GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAATCAAAAGTTAAATTATTGTTGTTGTGCGGGCTTTAAAC 2093797
2093798GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACACAGTGTTTACAGGTGGGCTTGTTGATGCCGAT 2093867
2093868GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAACATAATTGTGATTACTATCCTTTTTATATGGCTATT 2093939
2093940GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTACGTTGAAACTCAATTTAGTCCTACAAATAATGAGGATTAAAACAAGT 2094014
2094015GTTTAAATCCCCGATCCTCAGGGGACTAAATTAAAAC2094051
Left flanking sequence : Till position 2090436 (length bp)
TAATTTGGCAAATTTAATTTTGAGAATCGGCTAAAATGATTAAGGATTCGCGCAACTGGACTTTGAAAAC
TAAATATGACAAGGGGTTCAGATGCAAGCT
Right flanking sequence : From position 2094051 (length bp)
AAACTGAGAGCAAATGCAGAAAGTTACAGCAGATCCCCCCTTCGCCCCTCTTAGTAAGGGGGGATGAGGG
GATCGTTGTGTAGCACTAGTTGATCGAGAG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp