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CRISPRs details
NC_019949_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_019949_2                                                                                                                 
top
Strain :
Mycoplasma cynos C142
RefSeq :
NC_019949 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019949_2
DR consensus (36 bp) :
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
Number of repetitions :
19
Begin Position :
948179
End Position :
949402
948179
GTTATTGTTTACTCAAATATTGTACAACACTAAAAC
TTTGATGCTTCATTTATTCAGCTAGAATAT
948244
948245
GTTATTGTTTACTCAAATATTGTACAACACTAAAAC
TTGATGATGAAGAAATTTTAACAGCAGAAA
948310
948311
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
TAAGTGGTGTTGTTTGACCTTTAATTTTTA
948376
948377
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
AAAGTTAGAATAGACTTCCCTTTACCTGAA
948442
948443
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
ACCTTTTTACCCATAAAATTCATTATTATG
948508
948509
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
TATTATGTTACAAGTTTGATTATATAAGTC
948574
948575
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
AACTGGAAGTAACACCTGGAATATAAGTAG
948640
948641
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
ACCTTTTTACCCATAAAAGACATTATTATG
948706
948707
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
AATATAATTTTTGCTTTTGATGTAGTTCAT
948772
948773
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
AAGGGTTTAAATATTCAAAAATTTGACTAT
948838
948839
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
AAAATATCCTTATCGATGTTTTTAATGTTT
948904
948905
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
AAAATGTTTTTATCTATGTCTTTAATGTTT
948970
948971
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
TTCATCGCTAGAATTGTAAGCAATTCTCAA
949036
949037
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
TCTCTTTAATGTTTAATGCTATACACTTAA
949102
949103
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
AATTATGTTGCATGTTTGATTGTATAGGTC
949168
949169
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
TTTCGTCACTAGAATTGAAAGCGATTCTTA
949234
949235
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
ACTCTTTTACCCATAAAGTTCATTAATATG
949300
949301
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
TTGTGATTGAAAATAATTATTATTATAATG
949366
949367
GTTATTGTTTACCCAAATATTGTACAACACTAAAAC
949402
Left flanking sequence : Till position 948179 (length
bp)
TAATAAAATAATGGTTGTTGTTTTATTGCAATTTTAAAAGAGATTGGAAAAATTAAGGAATGTAAAATAT
TTGTTATAACAACATAAAAAGGGATAGTCT
Right flanking sequence : From position 949402 (length
bp)
CTCATTACTTAATAATTATTTTAAAAATAGCGATTTTTTCATATTTTCCATAACATCTTTAGTATAAATC
GCATCTTCACCTATACAATCAAACGGTTTC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp