Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_019954_5                                                                                                                 top


Strain : Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 RefSeq :NC_019954 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019954_5
DR consensus (30 bp) : GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACNumber of repetitions :46
Begin Position : 237324 End Position : 240394

237324CTATAAGGAATTGAAACCATTTGAGGATCTGATGTTAACTTTATAAACATAAATGCAGACGAACT 237388
237389CTACCTATAAGGAATTGAAACAGAAACGACCATTTGAGGATCTGGAAGGGCTGACCTTAGCCTCCGGAG 237457
237458CCTATAAGGAATTGAAACCGGCTAACCGCAAGAAACGACACGACAAATTATGAAAGAAAGCAATTT 237523
237524TACCTATAAGGAATTGAAACGTTGATGAACCGGCTAACCGCATTATAATACGTGATGCAAGTGGCCGG 237591
237592CTACCTATAAGGAATTGAAACATTGGAGAAGTTGATGAACATTCCATAGATAGTTTGCAATTTATGTGT 237660
237661CCTATAAGGAATTGAAACAAAAAAGATATAATTGGAGAAACTTTTAATAGAGCATAAAAGGACTGA 237726
237727CCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTGATTGAAAAAAGATATAGTTTTTTAGAAGTCTTGAATGATGAAGG 237796
237797CCTACCTATAAGGAATTGAAACCCATAATCTTTGATTGAGGATATATTCCTTGCTAATGATATAGCTTTT 237866
237867CCTATAAGGAATTGAAACTATTCCATTTTGCCATAATCAGTAACTATTTCTCTGCTAGCATTTCTT 237932
237933GCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGCTTTTATTCCATTTTGTGTTTTGTATAGTTACCAAATCACCAAGC 238003
238004ACCTATAAGGAATTGAAACGTCACAATTTGTTGCTTTGATGAGGTAGCACTATTTTTAGAAGTTGAG 238070
238071ACCTATAAGGAATTGAAACAGGCTTGCCCAGTCACAATTTGGGCAATACCATGTTTCCATAGGCGTG 238137
238138CCTATAAGGAATTGAAACTTTGCGGGTAAAAGGCTTGCCCAAAAAGCGGAATATTATTTGTACTTT 238203
238204CCTATAAGGAATTGAAACATGGTGAAGTTATTTGCGGGTAAACAATAAGGCAGAAAACACAATAAC 238269
238270ACCTATAAGGAATTGAAACCATTTATTGCAATGGTGAAGTTATAGAAGATGATACTAGTAGCACTAA 238336
238337CCTATAAGGAATTGAAACAACTCTTCTAAACATTTATTGCAAACTATGCACTTTCCTTTGCTTCAA 238402
238403TACCTATAAGGAATTGAAACTTGTAATAACAACTCTTCTAAAAAATCATTAAAACTAACTTTTTTTAC 238470
238471CCTATAAGGAATTGAAACATGAAGAAGCAGTTGTAATAACAATATAATGATGCAAATAAATAAAGC 238536
238537CCTATAAGGAATTGAAACTACCTTGGAACTATGAAGAAGCAGAGATTGACAAGCCAAGCTATGCAA 238602
238603CCTATAAGGAATTGAAACTAAGACTCAATCTACCTTGGAACTGTTCGCTCATGATTATAATAATTC 238668
238669ACCTATAAGGAATTGAAACTGAAACCCTTTTAAGACTCAATCCAACTTTCCAAAAATTCACGCAAAG 238735
238736CTACCTATAAGGAATTGAAACGTCGAAGAGTGAAACCCTTTCTTCATTTTTGGCCAATGAGCTTCTAGC 238804
238805ACCTATAAGGAATTGAAACGCAGCAAGTTTGTCGAAGAGGAGGTGGCGAATTGACGAGGGAAGAGCT 238871
238872CTACCTATAAGGAATTGAAACTGCCTATCCGCAGCAAGTTTTGCGGCACCACTTTTGGCGATATTGAAT 238940
238941CCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGAATATTGCCTATCCACTGTGGAAATGGCTGCTCTTCGGGCATTTC 239010
239011ACCTATAAGGAATTGAAACCAGGACTATATTGGAATATATGGTCCGGTATATGTTGATCTGTAGGAA 239077
239078TACCTATAAGGAATTGAAACTGATGTAATCCAGGACTATATTGGAAATATTCAAAGATGCACTTATTG 239145
239146TACCTATAAGGAATTGAAACTCGGGTCATCTGATGTAATCATTGATTTCTTTAGGATTAAAACCACAT 239213
239214CTATAAGGAATTGAAACCACTAATGTTGGATCGGGTCATCAGACTGATCATCCAGTGTTGCCACC 239278
239279CCTACCTATAAGGAATTGAAACATAACAAGCACTAATGTTGGATGAATCATCACAGATACAAAATGAAAC 239348
239349GCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGAAGCTATAACAAGATTGAATTCAGTCAAAAGGAAATGGATAAGGCA 239419
239420CCTATAAGGAATTGAAACACTGGTACATGGTGAAGCTTGATGACATGAAGAATATCCTTAAAACCC 239485
239486CCTATAAGGAATTGAAACTGGACTACCAGAACTGGTACATGGCCGCAGTCTGTTCCTGTATGCTGG 239551
239552CCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGTAAACTGGACTACCAGACACAAAGAGATCGCGCCGATAAGGCCGA 239621
239622CTACCTATAAGGAATTGAAACTGGAGGTGTTTGTAAACACGCCCATCTCTAGTGACAGTATATGTCTTT 239690
239691CCTATAAGGAATTGAAACCTTTGCACGAGTTGGAGGTGTTGTAAATGGCATACAAAGGCCAACCCG 239756
239757ACCTATAAGGAATTGAAACCAGAATACTACCTTTGCACGAGTATGAAAACAGCCTCATCTTGCTCCC 239823
239824GCCTACCTATAAGGAATTGAAACCATGGGGCAGAATACTACCTCTCCTTGCCAATCTTGTTTTAAACCATC 239894
239895CTATAAGGAATTGAAACGTTGATAATTGTACATGGGGAGTGCTGGGCAAGACTTCGTAGACGAAG 239959
239960TACCTATAAGGAATTGAAACACGACAGACAGTTGATAATTGTATTTTTAATTTACTGTTTATCCTTGT 240027
240028CCTATAAGGAATTGAAACCTGAAAGTAGGAACGACAGACAGGATATAGAGGATTTGGTTACACGTG 240093
240094CCTATAAGGAATTGAAACAGGATAAAAGATCTGAAAGTAGGAAGCCGACCGGCATAAACAAAGCCA 240159
240160ACCTATAAGGAATTGAAACCTATCTCCTGGAGGATAAAAGATAACTGGCAAGTGTTTCCTAGCAGGG 240226
240227TACCTATAAGGAATTGAAACAGACATGGCACTATCTCCTGGTCGCCTTCAGCCAAGGCGAACATCCTT 240294
240295CTACCTATAAGGAATTGAAACTGGACGACAAGACATGGCATTGATTTCTTGGGATTCAGGACCTTTATG 240363
240364AGGAGATGTTAAAAAGGTGCGATGAGCTCT240393
Left flanking sequence : Till position 237324 (length bp)
TATTTTTTACCCCAAATTACGGGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGATGTTAACTTTATAAAC
ATAAATGCAGACGAACTGTTTATAGCCTAC
Right flanking sequence : From position 240394 (length bp)
GGTATTCGGAGAGGTTATAAGCGAGGGAATGGCCTCCGAGATAGAACGTTTATAGCCTACCTATAAGGAA
TTGAAACTTATAAATGGGGTGAAATTATGG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp