Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_020125_3                                                                                                                 top


Strain : Riemerella anatipestifer RA-CH-2 RefSeq :NC_020125 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_020125_3
DR consensus (36 bp) : GTTGGGACTGCTCTCACTTTGAAGGGTATTCACAACNumber of repetitions :17
Begin Position : 2162272 End Position : 2163516

2162272AACAATAATGCACAGCATTTGAAGGGTATTCACAACACCAATAAATACAGCTTATTTGCTCCTAA 2162336
2162337GTTGGGACTGCTCTCATTTTGAAGGGTATTCACAACTAAAAAATAGAATAAGAAATATTCCTATCA 2162402
2162403GTTGGGACTGCTCTCAGTTTGAAGGGTATTCACAACCATTTCAGAGTTGCAGATTAAATTGGTTGA 2162468
2162469GTTGGGATTGCTCTCAGTTTGAAGGGTATTCACAACTTTAGCTTCATTCTCTGTACCTTTTAGAAT 2162534
2162535GTTGGGACTGCTCTCATTTTGAAGGGTATTCACAACAAAGGCTTATCGCCTCTATATTTTCAAAAT 2162600
2162601GTTGGGACTGCTCTCATTTTGAAGGGTATTCACAACCTGTTGTTGTAAATATAATAGGTCCTATTG 2162666
2162667GTTGGGACTGCTCTCATTTTGAAGGGTATTCACAACCCTTTTCCTCATCACCTTCGTAGATGCAGA 2162732
2162733GTTGGGACTGCTCTCATTTTGAAGGGTATTCACAACTTCATTTATACTTCTAGGTAACTTAGTTAA 2162798
2162799GTTGGGACTGCTCTCACTTTGAAGGGTATTCACAACAAAGGAACGCTACTCGTTGTAGGAAGCACA 2162864
2162865GTTGGGACTGCTCTCACTTTGAAGGGTATTCACAACGGAGCCACCAAGATATCCCAAGGGTTCGTC 2162930
2162931GTTGGGACTGCTCTCACTTTGAAGGGTATTCACAACTAAGATTTCTGGATTTTCGTATATGTTGCT 2162996
2162997GTTGGGACTGCTCTCACTTTGAAGGGTATTCACAACTGCTTTGTTCTTCTCCTTCTTTTGTTGCCG 2163062
2163063GTTGGGACTGCTCTCACTTTGAAGGGTATTCACAACAGCCACAGCGTTTGATGGTTCTACTGCTAT 2163128
2163129GTTGGGACTGCTCTCACTTTGAAGGGTATTCACAACAGATCATGAAAACATTCAATTCTACCTTCCGTTGGGACTGCTCTCATTTTAGCTCACAGCTTTGTTGTAGTTTCAGCGGAG 2163245
2163246TTCGTGAATGCATAGCATTTGAAGGGTATTCACAACGAGTTAAACAATGGCGTATTATTCGTCCAAGTTGGGACTGCTCTCATTTTAGCTCACAGCTTCGTTGTATTTTCAGCGGAG 2163362
2163363TTCGTGAATGCGTAACATTTGAAGGGTACTCACAACTTTTTTCACGAGTATCTGCTAAGTCTGATTGTTGGGACTGCTCTCAGTTTAGCTCACAACTTTGTTGTCGTTTTCAGCAGAG 2163480
2163481TTCGTGAATGCATAACATTTGAAGGGTATTCACAAC2163516
Left flanking sequence : Till position 2162272 (length bp)
CCTAAAAATAGAACAACGCGATTTAAAAGCGTTGTAAAGAAAAGCGTTCTTTGAAACATCGAGATAAAAC
AAGCACCCAAAAAAGACAATACCCTATCAT
Right flanking sequence : From position 2163516 (length bp)
TTTATTTTGGTATTTTAAGTTGTTGTGAGTGTTGGGACTGCTCTCAGTTTAGCTCACAAGCTTTGTTGTT
GTTTCAGCGGAGTTCGTGAATGCGTAGCAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp