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CRISPRs details
NC_020411_9
Flanking alignement tool
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NC_020411_9                                                                                                                 
top
Strain :
Hydrogenobaculum sp. HO
RefSeq :
NC_020411 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_020411_9
DR consensus (29 bp) :
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
Number of repetitions :
51
Begin Position :
1088952
End Position :
1092284
1088952
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACTTATGCAAAAGTATCTATTACATTAGAACTATCAAAC
1089019
1089020
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CCTGACAAAAATGAGAGCATAACACTTCCTACTTTTGCAA
1089088
1089089
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTATCACACGTGCAAGTGTTTTGTGTTTTGATATGA
1089153
1089154
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTGTCTCGTAACATTAAAATTCGTTGGAGTTGTAT
1089217
1089218
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCTTCAAAGCATACGTCAATAGTCTGCCAGCTTTGAGA
1089284
1089285
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTAAATTTTGAAAGTGTGGAGGATATGAAATCTTTTT
1089350
1089351
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTTCTTGAGATAATTTGATGATAGAAATATTTTTCT
1089416
1089417
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GTTAAAGAATCGTTTGAAAAACAGCAAATAGCAGAA
1089481
1089482
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATCTCCTACAGCACTCCATTGATAATATGTTATTT
1089545
1089546
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTGCAGTTAGCTTCTTCAATAGATTGATGTTTATA
1089610
1089611
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTACAAGTTTGTAAAACATCTCTTAAAAGCTTGTTT
1089675
1089676
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCGCACAGCTAAACAGCAACAGACTACTTGCTAAAATA
1089742
1089743
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AACTCAACATCATGCAAATCTGGGACTGCTTCTTTTTGC
1089810
1089811
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CCAAAATATACTTGATAAAAACGATAAACAAGCACATTCG
1089879
1089880
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTATCTCATCTTTTTGTAGGTATCTCAATACTCCTTG
1089945
1089946
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTTTTAGCATCACTTTTTAACGATGCATTAGGTTTAA
1090012
1090013
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTGTTGGATAAGTGATTTTTACTTTGTACTTCATGG
1090077
1090078
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAAGCTGTCAATCTAAACACTACTTTGTAATTATTTG
1090143
1090144
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTTGCATCAAGCGTATCAGGAACCAAAACTTTCGC
1090208
1090209
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GCACTTGCAAGTGCCACTTTGCGAGCCAATGCGAATAGA
1090276
1090277
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTAAAATGGCGGAAAGTTCTTGCGATCTGTCTAGT
1090341
1090342
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTAGAGCTTTGTCTTTTTTCAAGAAAGACTCTATTC
1090407
1090408
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTCCTTGGCGCTCTTTCTACTCTTGATATCACAGAA
1090472
1090473
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTAGAAGAGCTTCAAGATTAAGTTGCTTTTCCATCT
1090538
1090539
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AAATAGCAGCCCAGCTCCAACCCCACTGTCTTTCAG
1090603
1090604
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATGTCAACATGTATTGGTCAAAAGCTGAAGGAAGGC
1090668
1090669
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TGAGCCATATTCTCAGAGATTGGCTGGTGTAATAGCA
1090734
1090735
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GACGGTGTGCGTGGTCTTACGGGGGATGTCATTTTA
1090799
1090800
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GACAAAGACTTGATTGAAGATTTGCACTCAGTCAAAAA
1090866
1090867
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CGTTGAGTTGTGAGTATCACTTTGATATTTTGCATGA
1090932
1090933
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TATTCTATTTGCAATCTCTTCAGGCTTGAGGGCTCT
1090997
1090998
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTTAATCACTTCAAGCCGCAGATGTGTATCTCCTTG
1091062
1091063
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TAGAGCATTTGCACTCATAGATGCTCCAGTAGGACT
1091127
1091128
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TAAGTTTTTGCTTAAAACTTCTTCTAAAGAAGCTGCA
1091193
1091194
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AACACAGACGCAAACCTTTTAAACGCAAACGGTGTA
1091258
1091259
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACGTTTTTCACACGACCTAACGCATCTATGTGTTTCATCTGA
1091329
1091330
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACAATTGCTGAAAAAGTGGACGATGACAAGAAGAAGA
1091395
1091396
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAAGTAAACAAAGCTCTGTTGCTTCTGGCGGCTTCT
1091460
1091461
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTACCAATCGCATCTACGCCTATCACCTTCCAACCA
1091525
1091526
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTGATTACAAACATTATCAACGCACTTGTAAAACAAA
1091591
1091592
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAGTAAGCGTTTTTTTAACAGAATGGAGGTCTTCTAT
1091657
1091658
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TAGAGCATTTGCATTAATAGATGCTCCTGTGGGACTT
1091723
1091724
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GCGTTTGAAAATAGTATTTCTTTTGTGTAAAAATAGG
1091789
1091790
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTAAAATGGCGGAAAGTTCTTGCGATCTGTCTAGT
1091854
1091855
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTAGAGCTTTGTCTTTTTTCAAGAAAGACTCTATTC
1091920
1091921
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATATGATACTTTTAGCACTTGCCCGAGCCAGTAGCTAATGG
1091990
1091991
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTACTGAAAAATTGCAACAATTATTAAACTACATG
1092055
1092056
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTTCTAAGGTTTGATGTAGTCTTTCAATCATTTGAGGCA
1092123
1092124
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AGCATCGGGGCGTTTATAAATACCGATGCAAAAACT
1092188
1092189
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACAACAAGCGTTTGATAAACGTTAGCGGGAGTTGTTGA
1092255
1092256
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
1092284
Left flanking sequence : Till position 1088952 (length
bp)
CAGAATCTGGCATTTTCGGGAAATTACCTTCATTTGCGATGGGTACCCCCTTGACAAAACCATTGATACA
CTATATAATTTTAAATATAGTGATTTCTGG
Right flanking sequence : From position 1092284 (length
bp)
TTTCATTCTACTTTGTAATAAAGGGTTATCTCTTTGTTGTCCCTTATGATTTTTACGCTGAAGCTTTGGC
TGTTTCTTAATGTACCTAATATTCTAAAAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp