CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_021009_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_021009_1                                                                                                                 
top
Strain :
Coprococcus catus GD/7
RefSeq :
NC_021009 (chromosome linear)
CRISPR id :
NC_021009_1
DR consensus (36 bp) :
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
Number of repetitions :
16
Begin Position :
14161
End Position :
15186
14161
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
TCATGTCTTTAAATCTTAGACATCCTCTTT
14226
14227
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
GGTTTTATCTCCAGGCCCAACTCCTCTCTG
14292
14293
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
AACAATATCCTCTTTCATCTATCTCCTGCT
14358
14359
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
ATTTCCTACAGCATAAGGGTCAAAAAATCC
14424
14425
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
TTAATCTACATACTTTATATCCAAACATGC
14490
14491
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
TTTATACGGGCCTTCAAATTTCTGACATCC
14556
14557
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
AACAGCAGAAACAATAACGTCTATATCATT
14622
14623
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
CGCGTCCCATCCTTCCACTTCGCCGGTCGT
14688
14689
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
TGGGCGGACGCCGAAAGAAGACTATCGGCA
14754
14755
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
TCTTAACACGCATACCAGAACACCACTTCC
14820
14821
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
ATTGGAGGAGTTGTCGGAATATGACCCATT
14886
14887
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
TGCTGTACAAGGCTTCAATGATTCCATGAC
14952
14953
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
CCGGAATATCTCCGGCTCTGGCATACATTA
15018
15019
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
TGCTGTGTTTTTTGCTGCATTGTTTCCGGT
15084
15085
GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGC
ATTCTATCGCCTATCAGTTTTACGGCGACA
15150
15151
GTTTGAGAATGATGTAAAAACATATAGTATGTAATT
15186
Left flanking sequence : Till position 14161 (length
bp)
CGGTATATTATAGATAGAGATGGTTGTGAAATCTATTAAAATCACACAGCTTGGGTACCTTGTTTTATGC
AGGTGATAGCATTTCATTTTTGAATTTGAG
Right flanking sequence : From position 15186 (length
bp)
TATTTTTGATTCATCCTCCCATGCGAGGGTTTGAGAATGATGTAATGGTATTAAAACAGGTTATTCCCTG
TCGTTTGTGATAGGGAATTTTAGTATATAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp