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CRISPRs details
NC_021182_1
Flanking alignement tool
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NC_021182_1                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium pasteurianum BC1
RefSeq :
NC_021182 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_021182_1
DR consensus (30 bp) :
GCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC
Number of repetitions :
5
Begin Position :
88057
End Position :
88345
88057
GCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC
AATTCCGGACTGTGATAATCCTGGAAGAGCTCATA
88121
88122
GCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC
TTATACACACAACAATTAAACAAAGATCAGATAG
88185
88186
GCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC
AAAAAAGTTTTTGAAATTAAGGTGATTATCTGTAC
88250
88251
GCCTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC
CGTTTTGGTCTTTTAATAATGTATTAGTATCATCC
88315
88316
GCCTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC
88345
Left flanking sequence : Till position 88057 (length
bp)
TATAATTTTATATAATTAGATATAAAGTTAACTTAATCAAAAAAATAACAGTAAATTGATTAAAATTGAA
AATAGCACATATGGGGGGCATACACCTTAG
Right flanking sequence : From position 88345 (length
bp)
TACTGTATTTAAGGCATTCCTAAAATTAAGTTATGTTTCCAAACGCCTTGCTTAAAGCATTTGCTTGGAA
TTTTACCAGCTAAAGCTGGAAGGCTTAACG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp