CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_021592_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_021592_1                                                                                                                 
top
Strain :
Ferroplasma acidarmanus fer1
RefSeq :
NC_021592 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_021592_1
DR consensus (30 bp) :
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
Number of repetitions :
14
Begin Position :
15
End Position :
919
15
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
TTATTAGACAAACCAACTAATATAAAAGAAATGCTTA
81
82
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
CTAAAAAAAGATATAAAGCTCATTTACCTAATTTTTC
148
149
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
GGTGCTGCTGGATTCGATTTAGGAGTTCCTGAAAGC
214
215
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
TTGATGAACAACGTTGTAATGACGTTTAAATTATTTTAA
283
284
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
CTGAAAAATTAAGGGATTACAAAAACCAGCTTTTAAAAG
352
353
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
TGAGGGATTACATTTCCCCGTATCTTTTCCCGCCAGGGC
421
422
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
CTTCTCGTTGGAGGTTCTCCATGCCAGGATATATCCG
488
489
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
AATATCTTATAGGTCTCACTGCAACCGTCAGGGAATA
555
556
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
AAAAAGAGTATTGTTCTGGTAAACTGTTGCACTTGC
621
622
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
CGTGCCTCAATGCCAAGGAACAGATCCCTTGTGCCAA
688
689
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
TCTGCACAGGGAATATCATGCCCAGCAGGTCTCCGT
754
755
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
AGAAAATTCAACGGTTTCATGAAGATGGCGAGATAAT
821
822
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
GTTGATTTTTTAAATGATTATGCCTTTTTTTGGTCTAG
889
890
ATTTCAATTCCTATATGGAATTATTTTAAC
919
Left flanking sequence : Till position 15 (length
bp)
ATATTCCCATTTTG
Right flanking sequence : From position 919 (length
bp)
CCAGTTCATTAATTTAATAGTAACACAGTATATTACTTAATTTTTGTGAATTTTTACGTTTATATGCAAT
TTTAAAAATTTATGAGTTTTTTTCTATGAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp