CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_021837_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_021837_3                                                                                                                 
top
Strain :
Listeria monocytogenes
RefSeq :
NC_021837 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_021837_3
DR consensus (36 bp) :
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
Number of repetitions :
24
Begin Position :
790610
End Position :
792163
790610
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
CAAAGTGCTTTCTTCGATGACAACTGTTGC
790675
790676
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
ACGGTAAATGGAATTTCTTCTTTATTAAGA
790741
790742
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
ATGCGTTTGGTACAGTACCTTGAACAACGT
790807
790808
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
AGTCCAACAACCGCCTCCGTGTGTGTTTCT
790873
790874
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
CTTTCATCAAGTGTATTTTTTGCGACAAGA
790939
790940
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
ATCAATCGACAATATAAATACGCATCATCT
791005
791006
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
ATCAATCGACAATATAAATACGCATCATCT
791071
791072
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TTTAGGGAAGCGCCCTTCTTCCCGTTGAAA
791137
791138
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAACGCTACCAAAAC
ATACGAATTCTTTATCAAGGGTCAGAACGG
791203
791204
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
CCGATAGTTTTTTAAAAGTAACTTTACATT
791269
791270
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
CACTACATTCAAATATAAACCTTCACAAGC
791335
791336
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
CGTACTCGTTCGTCTCGTTAATGACGTACG
791401
791402
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TGGCGATGCGTTGTTACCGATAGCTGAAAT
791467
791468
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
ATATGACCGGTTTGATTCTGGTTACTGGAA
791533
791534
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
CACGAGTATCCACACAATCACTATCCAAAT
791599
791600
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TTCTTTTCCTTTGATAACAGCTCTATAAGT
791665
791666
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TTTAATTTCTTCCATCAGTCCAGCGGGAGC
791731
791732
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
ATATTCAAATGAATCAACTAATACTTTTTT
791797
791798
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TTTAGTTTATCAGTTTATCACAATGGAAGA
791863
791864
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
AACTACAATCAGAACCCTATCGACTTAGAA
791929
791930
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TTGGTTTGATGAAGAACTATTCAGTTGCTT
791995
791996
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
ACAATAAGATTTTTGAAGGGGATATAGGCT
792061
792062
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TGTCTGAATGTAGTTGATATCTTTAACTTG
792127
792128
GTTTTAGAGCTACATTATTCTGAATATCAACACATA
792163
Left flanking sequence : Till position 790610 (length
bp)
AAATTTTATGTAAACCATAAAATAGCATTCAAAATTGAAATCTTGCTATGGATGAATGGCGCGATTACGG
AATCTTGGAGGAAAGAAAAAATTCTGCGAG
Right flanking sequence : From position 792163 (length
bp)
GAGACAAAATGCATCGCAATTACCAAACCATGGTTAAATTTAAAAAGGAGTTAAACTATCTACATGACAC
AGTATCACTATCTTGCTTCGAAGTCGCTCT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp