Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_022571_4                                                                                                                 top


Strain : Clostridium saccharobutylicum DSM 13864 RefSeq :NC_022571 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_022571_4
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCNumber of repetitions :33
Begin Position : 2818156 End Position : 2820274

2818156ATTTAAATACATGTCATGTTAATGTTAATCCTACACTTACTCTGTAGCTACCCCATGGCTTACT 2818219
2818220ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATTTCTTCCTTTTCTGTTTGCTATATTGGCTAATTT 2818285
2818286ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACTTTGAGCCAGTTATAGATAAGCTTATTAAATA 2818349
2818350ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAGATGAATAATGAAAGGTATAGATATTTCAAATAA 2818415
2818416ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAGGTTAAAGTTATTACCAAAGAGTGTAATTACTGC 2818480
2818481ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTAAACCGCCTTTTGGATACATAGGTATCTTATGGTT 2818547
2818548ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTGATTTGTTTTAGTCTTCTTTTTTTTATACAA 2818611
2818612ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACATAGTTACTTGGGCTTAAGTTATCTATTGTAGAT 2818677
2818678ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCCAGCTAATGCTAGTGTATTACAAATAGATGGAA 2818742
2818743ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTATTCTTTTTGCTCGTACTAAACTATTATCTACA 2818808
2818809ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATAGATGGATTTACTCAACTTGGATTCGATGCAAA 2818873
2818874ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAAGTATTTAAAATAGAGAGGTGATAAATGATGAG 2818938
2818939ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAACTATATTAATTTCATCATCTTTTAAATCAATGTA 2819004
2819005ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCGAAAACTGATAATCCAAGTGACCCTGCTCCTTC 2819068
2819069ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCTTGTGCAACAGACTTAAACTTAACATTATCAGAA 2819133
2819134ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCCAACAGTTAATTTTTCCATCTTGACCTTTTATAT 2819198
2819199ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAGGTAGGCATATTTAAGTAGATTTTAAGAAGCTTT 2819264
2819265ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTTACTGATACAAACACTAAAACTGATACTAAAAC 2819330
2819331ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATAATGGTGGTAAATTCTACATGGTAATTCCTAA 2819394
2819395ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTATTCCGGAAATGTTGATATTTATTTAAAATTAGC 2819459
2819460ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGCAAATTTAATTTAAGGAGGAAATTATTATTATGTT 2819525
2819526ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACTCATGTTACTATATGTTATACAAAAAGTGGTAG 2819590
2819591ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTAGTAAAAGTGAGGTTGAACATATGATAAAACATA 2819655
2819656ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTATGGTTGCTCTGTTAGTGGATTTTCTTTTTCTGT 2819721
2819722ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATTTAGAAATAGATAAAACTCAAGAGAATAGAAT 2819785
2819786ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGACTCACTTTTGTAAGGTCAGGTAATTCAGTTCGT 2819850
2819851ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCATAAAGAAAATAAGAATCGCAAATATTAAAATATC 2819917
2819918ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACGTAACTATTATTAGAATGAAACGTATTTATACT 2819982
2819983ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGGTTAATCCTAAATCAATTGCCCATTGTTCCATCAA 2820048
2820049ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTGACTTGGGTAAAGAACATCAGACTTTAGTTGTTAT 2820114
2820115ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTATCAATCAAATCCTCTTAGTGCATATTTCATCA 2820178
2820179ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTCAAGGTATTCTGATTTTACATTTAGTCAGTTGAG 2820244
2820245ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC2820274
Left flanking sequence : Till position 2818156 (length bp)
TCTGATTTTTATGCTAAAAACAATATGTCTTTTACAATTGGTTTCATCATAGTTAATGTTAGTCTTTAAA
TTATACAAAGCACAAGTATGTTTTAGATAA
Right flanking sequence : From position 2820274 (length bp)
CCCTAAGAAAAAAGCCACTTCTTATATTAAGATAATGCTTTCATTATAGTTAGTGTAACACATCCTTAAA
AATTTACCAAGCACCCTCAACTTAAATTAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp