Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_022592_3                                                                                                                 top


Strain : Clostridium autoethanogenum DSM 10061 RefSeq :NC_022592 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_022592_3
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACNumber of repetitions :44
Begin Position : 1499836 End Position : 1502711

1499836TGTTTCATACAACATTTGTTACGGTTCAACTATCATCACTTTGACGATAATTCAAAGTTATACCAATAAAGT 1499907
1499908ATTTAAAAACATTTCATATTATGGTTCAATAATTCCTTTATAATGTATTATTTACAATTATTATTT 1499973
1499974ATTTAATCACATCTCATGTTGAAGTTCAACTTATAGCTCCAGACGAGGAAAATGCCAGAGATTATTA 1500040
1500041ATTTAAATACATCCCATGTTAAGGTTCAATTAAAAAATAGACCATATACTTCTTTAAAAGATTTTCA 1500107
1500108ATTTAAATACATCCCATGTTAAGGTTCAACCAACTATAGAGCCACTTGGAAGGGTAATTAAGTT 1500171
1500172ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTGAAATACTTGATATGTATCCTAATGATGGAAGTTT 1500238
1500239ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTATAAATAGAAACTTCACAAAAGATCCTAAATCCAC 1500305
1500306ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTAATTTTCGCCAATTCTACATTACTATATTTCA 1500370
1500371ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTATTGTTTACTTTATCAGTATTTGCATTGACTT 1500435
1500436ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTATGGAAGAAATAAGACTTTTAACAGCAAATGAAAT 1500501
1500502ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACCGTCACAAAAGAAGAAATAGAAAAAATTGTAGATGAA 1500568
1500569ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGCAGATACAAAGAAGAAGGATTCCCTTGGGCAAGAA 1500634
1500635ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAAAATCAAATAAACCTATTGAATGGATAATCTCCCAG 1500701
1500702ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACATCATTATTGAAAGCTCTTATCCTTTATTCGATTTA 1500767
1500768ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACATGCCGTGCAATCAGACTGGATGGTCTACTATTTA 1500832
1500833ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAAACATTTCTTAGATGCTATATCTGGTTATGTAAG 1500897
1500898ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTTAGGTACTGGTATTATTTTTGCTCCATATTATTG 1500964
1500965ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAGTCTAGGCTTCAGCAATTTTAAGAAGGTAAAAAAA 1501030
1501031ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGGAGGCAGTAAATGATCTTGGACATACGCCTGTAAG 1501096
1501097ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTAGGACAAGGTAGAGATATGGATTTTTCTGCTTACAAA 1501164
1501165ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTGAAAAAGAAGGAGATAACCCAACTCAAAATAGTAAG 1501231
1501232ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTAATATCTCATCTATCATATTATACTTCCTTTCCA 1501297
1501298ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTAAATAATTAGTATAAAAATGGAGGAATGTATAAA 1501363
1501364ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTATTGGCCAAACTTTAAATATACATCTGCAATGTC 1501428
1501429ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACCTCTATAGCAGTTCAATTTCATCCTGATCTAATCCC 1501494
1501495ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTAGACCACAATTAAATGCAATGTTAGAATTTGCTCG 1501560
1501561ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTTAAAGATAGTATAACTAAGCAACAAAATGATTA 1501626
1501627ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACCGATAAAAGACACACTCAAAACTGTATGGGATGCTA 1501692
1501693ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTGGCTTACTACTTATAGCAGTTCCAACAGTTATTAC 1501760
1501761ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAAAGCTTCGGCATATAAAAGTTGGAGCTTTATACTG 1501826
1501827ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTAAGCAGTTTAAGCCATTGTATCGAGTAGACTG 1501890
1501891ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGTTGGTGGAGAAAAGGAACCTCTATTACTAGAAAA 1501955
1501956ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTGATAACTTAATAAAAAATATAGAGTTAAAAAAAGG 1502021
1502022ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGGTGCTAAAGATACTGGATTAGGAATAATTACATCA 1502087
1502088ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGCCCACTATTTTGTGTATAATTTATTACTCCAAACA 1502153
1502154ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTACATTCTCTACTACAGAATAATCGAATTTTACCTG 1502219
1502220ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACATAATGGATAAGATAATATTATATTAGTCATTTTTT 1502285
1502286ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACATTGGTTAGGCTCAAAATTCCTAGCGTTTTGTCCTT 1502351
1502352ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTGCACAACTTCGTTAAAACATAATTTAGCGAAGT 1502417
1502418ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAAATGAAAACATATGTTTTACACCTTATCAAGTTGG 1502483
1502484ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAATAATAGCAGTAATTTTATTAATTACAGGCATATA 1502549
1502550ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACATGTATAAATAAAGAAACAAACCAAATTGTAGAATA 1502615
1502616ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGCAGCTCCAGGAGCAAAAACCAAAGGTACTATTCGC 1502681
1502682ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC1502711
Left flanking sequence : Till position 1499836 (length bp)
GTTTACATTTATATTATTGTACTTAAATCAAATTTATATTCATAGTAAAACCAATAAAGTTGAAGTATTG
AGAAATATTTAGAATTAATTTAAACAAATC
Right flanking sequence : From position 1502711 (length bp)
CACAGTAAAATAGCCATTCTTTATTTTCATTATAACCCTAAAACCCTTAACAATAAAGGCATTCGCTGAA
AATTTTCCAACCGTTTTTCACTTTTCATAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp