CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_022592_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_022592_4                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium autoethanogenum DSM 10061
RefSeq :
NC_022592 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_022592_4
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
Number of repetitions :
34
Begin Position :
1504480
End Position :
1506686
1504480
AATTAGATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC
AGTAGCTAATGATCAAATATTAACATTCCAATTACT
1504545
1504546
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AGGTGGTTATTTTCAAAATAGTTATCAAGCCACACCG
1504612
1504613
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TATATCAACTCTCCCCACTTTTGGGGAACGTACTCT
1504678
1504679
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GATGATTATAAAGTATGTTTGCTAACAGCTATAGCGT
1504745
1504746
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
ATTTGTACTTGGCTCTGCTATCTTGAATATTAATTTA
1504812
1504813
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TAATTATATATATTCTGATTGGGTTTATATAAATTC
1504878
1504879
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
AAGAGTTGATACTTTACTTATAGATTACTTAGGTGC
1504944
1504945
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GGGCATTAAATATAAAAAGAAATATATTCCATGAAT
1505010
1505011
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TCTATTACCTTAAGAAAATTAAGTCCACTAGCATTA
1505076
1505077
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
CTATCCCAGCAATTAATATCTCTATTAATATCTCTCA
1505143
1505144
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
ATTGCTCACCCATTTTAAATAGTAATTCCCAAAAA
1505208
1505209
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GTGGTTACTTGGGATACACCAAGGCGGCTAACAAA
1505273
1505274
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GGAAATATATCTTCTCCTAGATCTCTGTACTTATTT
1505339
1505340
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
ATATTAGGCTGTTTAAAAGATACCTTACAGTTAAAT
1505405
1505406
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GCTGCAGAAAGAAAAAAGTGAGATGGAAGAAAAAAA
1505471
1505472
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TATATACGTAAATAATTTAAGTGGAACAACAACATC
1505537
1505538
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
CAACAACTTTCTCATGCAGGGGCCATATCAAAAGA
1505602
1505603
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
AAAAGAAAATGAAAATAAAGTTCCAAGTGCAACCAT
1505668
1505669
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
CTTCCACGCACTATGTAACACATTTTTGCTTTAGAG
1505734
1505735
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
CATAACCATAGATCAGTGCAATAAATTGTTTTTTAC
1505800
1505801
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TTGCCTTATTAGCGAATACAATAGAATTAGAAATTA
1505866
1505867
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
ATGGCTTTTGTTGCTGCTATGTGTGCAGGAGGTAC
1505931
1505932
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TTGAGAAGGAGTATAAAATTGCTAATAAGCAGATGA
1505997
1505998
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GTATAGATACTACATGCATTAAGCATATAGATGTATT
1506064
1506065
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TTTGACAGCAACAAGAGAAAGAATTTCACATATATT
1506130
1506131
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
AAATACATTTTATAAATTATTAAAAGAATATGAGG
1506195
1506196
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GAAGCTATAGAAGAATTAAAGGATCTATAAGAGAAA
1506261
1506262
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GAGGTATTTAAATTGTTAAAAGGTATAGATATATA
1506326
1506327
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
ATCAACTCCTAAAATATTCATAAATTTTATACCTCC
1506392
1506393
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
AAGGCGGATCCACAAATATTAAATCAGCCTCTTTCA
1506458
1506459
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TATTTGTTATTGGAGTGTATGTAGCAACAAAGACAA
1506524
1506525
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GTATGATAGTGTGACAGGTGCTATTATATTAGACAC
1506590
1506591
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TAACGGAAAAGGATGGGAGCACGTAAGTATAACACA
1506656
1506657
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
1506686
Left flanking sequence : Till position 1504480 (length
bp)
TAAATTCAGAGAAAAACCTTAGTAATTTCAATAGTTTTAAGACTATAGACTTTCATCAATCTCACGTTAT
AATAGAGTCTACTATATTCCTAATTTTTCA
Right flanking sequence : From position 1506686 (length
bp)
CACAGTAAAATAGCCATTTCTTATTTTCATTATAGTCCTAAAACCCTTAATAATAAAGGCATCAACAGAA
AATTTTCCAACCGTTTTTCACTTTTCACAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp